Publicações

Total de projetos de pesquisa


Número total de itens: 219

2022

1.   2022-Atual. AIDNewMat - Abordagem Interdisciplinar para Descoberta de Novos Materiais
Descrição: O projeto proposto consiste na aplicação da informática de materiais para diferentes aplicações de interesse nacional, sendo elas: 1) Materiais para energia: Fotovoltaica, supercapacitores e exploração de petróleo do pré-sal brasileiro. 2) Materiais semicondutores para computação e aplicações ópticas. 3) Materiais para eletrocatálise.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paula Homem-de-Mello - Coordenador / Mauro Coelho dos Santos - Integrante / Wendel Andrade Alves - Integrante / Gustavo Martini Dalpian - Integrante / Ronei Miotto - Integrante / José Antônio Souza - Integrante / André Sarto Polo - Integrante / Rodrigo M. Cordeiro - Integrante / Anderson Orzari Ribeiro - Integrante / Fabio Furlan Ferreira - Integrante / Mauricio Domingues Coutinho Neto - Integrante / Pedro Alves da Silva Autreto - Integrante / ALMEIDA, JAMES - Integrante / Romarly Fernandes da Costa - Integrante / Luana Sucupira Pedroza - Integrante / Carlos Kamienski - Integrante / Ronaldo Cristiano Prati - Integrante / Flávio Eduardo Aoki Horita - Integrante / Andre Santarosa Ferlauto - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
Membro: Paula Homem-de-Mello.
2.   2022-Atual. Analise do Ensino por Investigacao por meio do design-based research: um estudo comparado da formacao docente em ciencias entre Brasil e Africa do Sul (CNPq-Universal)
Descrição: Por meio de uma parceria entre as IES: Universidade Federal do ABC, Universidade Federal de São Paulo e Universidade de Kwazulu-Natal (África do Sul), esta pesquisa pretende se aprofundar em compreender a formação docente com relação à utilização do Ensino por Investigação em suas práticas pedagógicas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Integrante / Solange Wagner Locatelli - Coordenador / Simone Alves de Assis Martorano - Integrante / Guilherme Brockington - Integrante / Leonardo André Testoni - Integrante / Angela James - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
3.   2022-Atual. Desenvolvimento de nanocompositos com upconversion e luminescencia persistente: dos fundamentos as aplicacoes em armazenamento e conversao de energia
Descrição: Em virtude de funcionalidades específicas como luminescência persistente, separação fotoinduzida de cargas e amplificação/transmissão de luz, nanocompósitos dopados com lantanídeos mostram perspectivas promissoras na detecção de gases, ótica-eletrônica, imagens por upconversion e armazenamento de energia. A melhoria dessas aplicações requer entendimento do ambiente químico, estrutura eletrônica, passivação de superfície, engenharia de defeitos e mecanismos de migração de energia. Propomos a elaboração de novos nanocompósitos fotônicos à base de vidros e polímeros contendo perovskitas persistentes de terras raras e nanopartículas para conversão ascendente de energia. Exploraremos assim as propriedades mecânicas, estabilidade química, transparência e processabilidade de materiais vítreos e poliméricos em combinação com as propriedades fotônicas únicas das perovskitas, fluoretos e óxidos. A investigação da sinergia partícula/matriz será multidisciplinar e compreende a síntese controlada, caracterização estrutural/óptica avançada e estudos teóricos. O cerne desta proposta é estruturar um grupo de jovens pesquisadores com formação complementar para que possamos correlacionar estrutura, interfaces e propriedades ópticas para projetar materiais fotônicos com melhor desempenho. Os objetivos envolvem o estudo de propriedades espectroscópicas fundamentais e mecanismos de upconversion e luminescência persistente nesses compósitos. Propomos ainda a aplicação de métodos avançados de RMN em sólidos para descrever as interações de curto e médio alcance nos materiais. Os mecanismos de transferência fotoinduzida de cargas serão investigados por teoria funcional de densidade dependente do tempo (TD-DFT). Finalmente, as aplicações serão buscadas pelo pós-processamento dos materiais selecionados por crescimento in-situ através de processamentos a laser.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Thiago Branquinho de Queiroz - Integrante / Danilo Manzani - Coordenador / Marcos de Oliveira Junior - Integrante / Lucas Carvalho Veloso Rodrigues - Integrante / Paulo Cesar de Sousa Filho - Integrante / Juliana Mara Pinto de Almeida - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Thiago Branquinho de Queiroz.
4.   2022-Atual. Metabolic programming of embryo epigenetic profile in bovine
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Marcella Pecora Milazzotto - Coordenador / SIRARD, MARC-ANDRÉ - Integrante. Financiador(es): Natural Sciences and Engineering Research Council - Auxílio financeiro.
Membro: Marcella Pecora Milazzotto.
5.   2022-Atual. Sintese e propriedades fisicas de perovskitas hibridas organico-inorganico de baixa dimensionalidade
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: André Sarto Polo - Integrante / SOUZA, JOSÉ ANTONIO - Integrante / Aryane Tofanello - Integrante / Leticie Ferreira - Integrante / Fabio Furlan Ferreira - Integrante / Fernando Sabino - Integrante / Gustavo Martini Dalpian - Coordenador / Marcos Avila - Integrante / Pedro Autreto - Integrante / Ricardo Reis - Integrante.
Membro: Andre Sarto Polo.

2021

1.   2021-Atual. Avaliacao de microalgas para biorremediacao de contaminantes emergentes associada ao tratamento terciario de efluentes
Descrição: Contaminantes emergentes são compostos, orgânicos ou inorgânicos, que vêm sendo detectados em diferentes ambientes, podendo indicar riscos tanto para o meio ambiente como para o ser humano. Estão incluídos nessa grande variedade de compostos os fármacos, bem como matérias- primas industriais. Sua presença nos corpos hídricos, juntamente com nutrientes residuais, como nitrogênio e fósforo, pode dificultar o tratamento de água para fins de consumo humano. Um importante ponto de passagem de alguns contaminantes emergentes são as estações de tratamento de esgoto (ETEs). Nos tratamentos secundários de resíduos biológicos, esses contaminantes podem ser removidos total ou parcialmente. No entanto, a inclusão do tratamento terciário nas ETEs poderia contribuir para a remoção simultânea de nitrogênio e fósforo e contaminantes emergentes, além de produzir biomassa de microalgas com potencial de aplicação para produção de biocombustíveis, por exemplo. Assim, este projeto visa avaliar a remoção de contaminantes emergentes (sulfametoxazol, trimetoprim, 17-ß-estradiol e bisfenol A), bem como nitrogênio e fósforo, por microalgas em efluentes já submetidos ao tratamento secundário em ETE. Tem ainda por objetivo sequenciar o genoma das linhagens de microalgas com capacidade de remoção de contaminantes emergentes, bem como avaliar e caracterizar, por meio de ferramentas de bioinformática, enzimas e/ou vias metabólicas potencialmente envolvidas em processos de biodegradação.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcus Vinicius Xavier Senra - Integrante / MARCELO CHUEI MATSUDO - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
Membro: Marcus Vinicius Xavier Senra.
2.   2021-Atual. Desenvolvimento de Sistema de Seguranca para Veiculo Autonomo em Aplicacao Agricola
Descrição: O objetivo geral deste projeto é o desenvolvimento da tecnologia de automação veicular que leva um caminhão comercial de uso agrícola, que se encontra no nível de automação SAE-2, para o nível de automação SAE-3. Elevar a automação do caminhão para o nível SAE-3 aumentará a segurança de operação do equipamento, tornará o produto mais competitivo, aumentará as competências técnicas e científicas do grupo de trabalho, aumentará a transferência de conhecimentos entre os participantes e permitirá até mesmo a criação de startups que ofereçam produtos para automação de outros equipamentos off-road. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . Integrantes: Francisco de Assis Zampirolli - Integrante / Leopoldo Rideki Yoshioka - Integrante / Luiz Antonio Celiberto Junior - Coordenador / Ugo Ibusuki - Integrante / Edson C. Kitani - Integrante. Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Outra.
Membro: Francisco de Assis Zampirolli.
3.   2021-Atual. Design, synthesis and characterization of molecular systems for light harvesting and charge separation
Descrição: Efficient light absorption and charge separation in molecular systems are crucial events in organic photovoltaic devices and photo-induced reactions, often performed by associations of electron donor (D) and acceptor (A) molecular units. We aim to build an interdisciplinary research team focused on the development and understanding of charge separating molecular systems using experimental and theoretical approaches. Based on density functional theory (DFT) calculations and time-dependent (TD) DFT, we propose D-A molecular associations active as charge separation systems. We will also synthesize these molecular systems, prepare solid state heterojunctions (interpenetrating networks) and guest-host structures in mesoporous (organo) silicates. The structural properties of the materials will be characterized by, mainly, nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy and their electronic properties by (eletro)optical characterization methods. We aim to obtain designed D-A molecular systems that are chemically flexible (from the perspective of synthesis and structural manipulation) with high charge separation efficiency, as well as to understand the mechanisms that drive such charge separation.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Thiago Branquinho de Queiroz - Coordenador / Stephan Kümmel - Integrante / BROCHSZTAIN, SERGIO - Integrante / POLO, ANDRÉ S. - Integrante / alvaro takeo omori - Integrante / Luana Sucupira Pedroza - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Thiago Branquinho de Queiroz.
4.   2021-Atual. Espalhamento ondulatorio por buracos negros binarios: superradiancia e instabilidades
Descrição: Bolsa de produtividade em pesquisa do CNPq. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maurício Richartz - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Mauricio Richartz.
5.   2021-Atual. Infraestrutura computacional para os grupos de colisoes e de sistemas fortemente correlacionados
Descrição: Este projeto visa a aquisição de um cluster computacional para atender a demanda dos grupos de colisões de elétrons e pósitrons por moléculas (Universidade Federal do Paraná e Universidade Federal do ABC) e de estrutura eletrônica de ligas e compostos de metais de transição (Universidade Federal do Paraná). Há dois subprojetos propostos: espalhamento de elétrons e pósitrons por moléculas e estrutura eletrônica de óxidos de metais de transição. Os subprojetos propostos são sobre temas atuais e relevantes e demandam processamento de alto desempenho para sua execução. No que diz respeito ao espalhamento de elétrons e pósitrons por moléculas, o interesse está no estudo de processos elásticos e eletronicamente inelásticos envolvendo alvos moleculares de relevância biológica e tecnológica. Para os cálculos de espalhamento será utilizado o método Schwinger multicanal. Além disso, pretendemos aprimorar a descrição da interação pósitron-molécula incluindo um potencial modelo neste método. No caso do estudo da estrutura eletrônica de óxidos de metais de transição, as motivações são o desenvolvimento de um modelo de cluster multissítio capaz de modelar sistemas não estequiométricos e a aplicação de aproximações mais atuais em cálculos de estrutura de bandas para a determinação da origem microscópica das propriedades físicas de sistemas de interesse tecnológico. Além de aumentar a visibilidade e competitividade dos grupos envolvidos nos cenários nacional e internacional, este projeto permitirá a formação de recursos humanos altamente qualificados.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Romarly Fernandes da Costa - Integrante / Sanchez, Sergio d'A - Integrante / Bettega, M. H. F. - Coordenador / Alessandra de Souza Barbosa - Integrante / Rodrigo José Ochekoski Mossanek - Integrante / Giseli Maria Moreira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Romarly Fernandes da Costa.
6.   2021-Atual. Investigation of naphthalenediimide and phenothiazine derivatives as photoinduced charge separation junctions
Descrição: Phenothiazine derivatives present low oxidation potentials and oxidized species with high stability, entitling them as good π-electron donors. Naphtalenediimide (NDI) is an efficient electron acceptor due to their high electron affinity while ambient air stable. NDI can be easily synthesized with siloxyl goups permitting the fabrication of silicate films and mesoporous materials using sol-gel chemistry. We have investigated π-stacked junctions of bis-triethoxysilylpropyl-Naphthalenediimide (NDI-silane) with Methylene Blue [3,7-Bis(di-methylamino) phenothiazin-5-ium chloride, MB], phenothiazine tert-butyl [3,7-di-t-butylphenothiazine, TBP], and their 1,10?-dimers (MB-DI and TBP-DI, respectively) using Time Dependent Density Functional Theory (TD-DFT) with the optimally tuned range separated hybrid (OT-RSH) functional. From simple designing rules, as ionization potential matches, we note that the junction TBP-NDI-silane is quite promising. It shows correct alignment between the ionization energy of the donor with the electron affinity of the acceptor. It also demonstrates the first two excited states with strong charge transfer character. These transitions are at ?sunlight accessible?, at 1.46 and 2.84 eV, with non negligible oscillator strengths, 0.015 and 0.020, respectively. In this project we propose to investigate the influence of a heterogeneous environment in TBP-NDI-silane thin films with respect to the optical properties and photoinduced charge transfer efficiency.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Thiago Branquinho de Queiroz - Coordenador / Renan Gabriel de Assis - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.Número de orientações: 1
Membro: Thiago Branquinho de Queiroz.
7.   2021-Atual. Sintese e investigacao de novas formas cristalinas de agentes antineoplasicos
Descrição: O principal objetivo deste projeto é otimizar o desempenho do medicamento antineoplásico melfalano e do candidato a fármaco LASSBio-1735, tanto pelo desenvolvimento de novas formas cristalinas quanto pela liberação controlada dos mesmos. Como o melfalano - um medicamento antineoplásico usado para tratar câncer de mama e ovário e mieloma múltiplo - não possui estrutura cristalina conhecida, a primeira etapa deste projeto e, consequentemente, o primeiro resultado a ser obtido será a determinação de sua estrutura cristalina. A análise da estrutura cristalina e do empacotamento do melfalano, bem como do LASSBio-1735 - um derivado da N-acil-hidrazona que exibiu atividade antiproliferativa in vitro contra o HL-60 (leucemia humana), SF-295 (glioblastoma humano), MDA-MB435 células tumorais (melanoma) e HCT-8 (adenocarcinoma ileocecal) - serão a base para a síntese e investigação das propriedades físico-químicas das novas formas cristalinas (sais, hidratos, solvatos e/ou cocristais). Este projeto também visa à síntese e funcionalização de nanopartículas de magnetita para a liberação controlada dos compostos antineoplásicos. A avaliação da ação antineoplásica será realizada com base na relação entre a expressão gênica dos marcadores inflamatórios e o estresse oxidativo, o crescimento do tumor e a avaliação da toxicidade. Para isso, serão utilizados camundongos Balb/c, inoculados com células tumorais de Ehrlich. Esses animais serão tratados em diferentes períodos e grupos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / Paula Silvia Haddad - Integrante / Francesco Punzo - Integrante / Fernando Luiz Affonso Fonseca - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
8.   2021-Atual. Sintese e investigacao de novas formas cristalinas de agentes antineoplasicos
Descrição: O principal objetivo deste projeto é otimizar o desempenho do medicamento antineoplásico melfalano e do candidato a fármaco LASSBio-1735, tanto pelo desenvolvimento de novas formas cristalinas quanto pela liberação controlada dos mesmos. Como o melfalano - um medicamento antineoplásico usado para tratar câncer de mama e ovário e mieloma múltiplo - não possui estrutura cristalina conhecida, a primeira etapa deste projeto e, consequentemente, o primeiro resultado a ser obtido será a determinação de sua estrutura cristalina. A análise da estrutura cristalina e do empacotamento do melfalano, bem como do LASSBio-1735 - um derivado da N-acil-hidrazona que exibiu atividade antiproliferativa in vitro contra o HL-60 (leucemia humana), SF-295 (glioblastoma humano), MDA-MB435 células tumorais (melanoma) e HCT-8 (adenocarcinoma ileocecal) - serão a base para a síntese e investigação das propriedades físico-químicas das novas formas cristalinas (sais, hidratos, solvatos e/ou cocristais). Este projeto também visa à síntese e funcionalização de nanopartículas de magnetita para a liberação controlada dos compostos antineoplásicos. A avaliação da ação antineoplásica será realizada com base na relação entre a expressão gênica dos marcadores inflamatórios e o estresse oxidativo, o crescimento do tumor e a avaliação da toxicidade. Para isso, serão utilizados camundongos Balb/c, inoculados com células tumorais de Ehrlich. Esses animais serão tratados em diferentes períodos e grupos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / Paula Silvia Haddad - Integrante / Francesco Punzo - Integrante / Fernando Luiz Affonso Fonseca - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
9.   2021-Atual. Tendencias em Computacao de Alto Desempenho, do Gerenciamento de Recursos a Novas Arquiteturas de Computadores
Descrição: Nesse projeto vamos juntar esforços e competências de diversos pesquisadores da ciência da computação na área de processamento de alto desempenho (HPC). Nosso principal objetivo é promover pesquisa de alto impcato em duas áreas de HPC: Gerenciamento de Recursos e Novas Arquiteturas de Computadores. Cada uma dessas áreas está dividida em diversos tópicos. Cada tópico será coordenado por um pesquisador experiente e será conduzido com a ajuda de colaboradores e de estudantes. Com esse projeto, queremos fazer não apenas pesquisa, mas também aumentar a sinergia dos pesquisadores da área no estado de São Paulo. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Emilio de Camargo Francesquini - Integrante / Alfredo Goldman vel Lejbman - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra.
Membro: Emilio de Camargo Francesquini.

2020

1.   2020-Atual. Avaliacao de Protocolos de Ensino Informatizados
Descrição: Acordos de Cooperação / FAPs / FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas do Estado do Pará / FAPESPA - Projeto de Pesquisa - Regular - Chamada de Propostas (2019). Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: João Paulo Gois - Integrante / Priscila Benitez - Integrante / Marcelo Salvador Caetano - Coordenador / Romariz da Silva Barros - Integrante / Carlos Barbosa Alves de Souza - Integrante / Júlio César Coelho de Rose - Integrante / Katerina Lukasova - Integrante / Lidia Maria Marson Postalli - Integrante / Maria Teresa Carthery Goulart - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Outra / Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa - Outra.
Membro: Joao Paulo Gois.
2.   2020-Atual. Construcao de modelos dinamicos da circulacao cerebral para tomografia de impedancia eletrica aplicada na classificacao e monitoramento de acidentes vasculares cerebrais
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Fernando Silva de Moura - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Fernando Silva de Moura.
3.   2020-Atual. Educacao ambiental e gestao de Unidades de Conservacao do Estado de Sao Paulo: articulacao de saberes na construcao de comunidades de aprendizagem
Descrição: As metas 1, 17 e 19 das Metas de Aichi dependem, prioritariamente, de uma sociedade que se proponha a participar das discussões e decisões referentes à biodiversidade e a sustentabilidade socioambiental, fazendo-se necessário a problematização e o diálogo de saberes da relação entre os conhecimentos científicos sobre a biodiversidade com a diversidade cultural das comunidades locais. Nesse sentido, a pesquisa em EA oferece caminhos para envolver o público com as questões ambientais por meio da ação participativa, uma das características da EA crítica, auxiliando a guiar os sujeitos para mudanças de valores e atitudes. A partir de referências sobre formação participativa de professores, educação ambiental crítica, educomunicação e aprendizagem social, temos encontrado respaldo na constituição de comunidades de aprendizagem, cuja estrutura é formada por um grupo de pessoas que estão associadas em torno de um objetivo comum de aprendizagem, em uma dinâmica de diálogo, para resolver um problema que as preocupa ou para construir um projeto comum. O projeto tem como principal objetivo investigar a construção colaborativa de planos e práticas de educação ambiental, bem como proporcionar a disseminação desse conhecimento entre unidades, entes e atores, com vistas a subsidiar as equipes gestoras das UC nas suas atividades educativas e relações socioambientais voltadas à conservação e ao uso sustentável da biodiversidade. A pesquisa se fundamentará em abordagens quantitativa e qualitativa (método misto), e os principais instrumentos que utilizaremos serão as produções dos diferentes atores sociais (vídeos, planos de educação ambiental, registros de ações formativas, entre outros), questionários, entrevistas e grupos focais. Com base na primeira análise de dados buscaremos estreitar as relações com as equipes gestoras de quatro UCs parceiras, sendo duas urbanas e duas no interior. O projeto se propõe a acompanhar a construção e implementação dos planos de EA nessas quatro UC. Em etapa posterior utilizaremos grupos focais, para discussão de resultados parciais com equipe gestora e para a construção de processos formativos e planos de educação ambiental inovadores nas UC. Os resultados esperados vão ao encontro aos referenciais descritos, de maneira a envolver a comunidade local na gestão da UC, fomentando uma participação mais ativa no conselho gestor e nas ações de conservação e uso sustentável da biodiversidade. Algumas ferramentas serão priorizadas nas diferentes UCs, como a educomunicação (produção de filmes e outras mídias), a ciência cidadã (tema do declínio das abelhas e gestão da biodiversidade), e formação de professores (ação de cadeia nas escolas do entorno das UC determinadas, provocando um sentimento de pertencimento e gerando participação da comunidade no conselho gestor das UC). Os resultados serão disponibilizados de forma contínua durante o projeto, uma vez que será desenvolvido em parceria com a comunidade/participantes envolvida/os no projeto, por meio da divulgação de cursos de formação e oficinas, produção de vídeo, parceria com o conselho gestor das UC, elaboração de material didático para subsidiar a formação de professores e monitores ambientais e elaboração de livros e sumários executivos ao final do projeto. Portanto, esperamos que a pesquisa traga subsídios para que as UCs desenvolvam e/ou aprimorem seus planos de educação ambiental e implementem ações formativas de monitores e professores, envolvendo a comunidade local de acordo com a realidade de cada UC, utilizando ferramentas de aprendizagem social e educomunicação.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (3) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Integrante / Rosana Louro Ferreira Silva - Coordenador / Denise de La Corte Bacci Toledo - Integrante / Vanessa Puerta Veruli - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
4.   2020-Atual. Investigacoes de processos de transferencia eletronica em dispositivos fotoativos
Descrição: A utilização de combustíveis fósseis para geração de energia tem contribuído para o aquecimento global. A preocupação ambiental fez com que a demanda por novas tecnologias para geração limpa de energia aumentasse. Dentre as diversas possibilidades, as tecnologias baseadas na conversão da luz solar são as mais interessantes por utilizarem uma fonte primária limpa e praticamente inesgotável e várias abordagens são possíveis, como a conversão de energia solar em energia elétrica ou química. Em ambos os casos, processos de transferência e recombinação eletrônica afetam diretamente a eficiência dos dispositivos e, por isso, é fundamental a compreensão de tais processos. O presente projeto insere-se neste contexto e buscará investigar processos de transferência eletrônica em células solares sensibilizadas por corantes, em células solares de perovskitas e em processos de fotorredução de CO2. Em todos os casos, os processos de recombinação eletrônica interfacial são fundamentais de serem compreendidos e buscar-se-á estabelecer a relação deles com as estruturas químicas propostas que serão sistematicamente variadas. Por fim, espera-se que estas informações sejam úteis no design de novos compostos a serem desenvolvidos que aumentem a eficiência e durabilidade dos dispositivos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: André Sarto Polo - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Andre Sarto Polo.
5.   2020-2020. Marine Litter Citizen Science Research Agenda - An Expert Perspective on Advancing the Citizen and the Science in Citizen Science
Descrição: Marine litter is a growing issue in need of action. A growing trend is to use citizen science to help understand and tackle the issue, such as volunteers recording and removing marine litter items found in different environments. Research is needed to understand 1. How the quality of the data can be improved, 2. How to maximise the benefit for the volunteers (maximise learning, engagement, and encourage further pro-environmental behaviour), and 3. How to support decision makers (e.g. the practitioners [typically NGOs] and policy makers) to engage with these activities and/or the results. Building on an ongoing GCRF funded project, we are running a workshop (9-10 March 2020) bringing together researchers and practitioners to identify how to advance citizen science in marine litter. Funds have already covered for 10 Brazilian early career researchers and 7-10 UK researchers practitioners to attend. This proposal will extend the invitation to a further 10 UK decision makers, broaden the scope to invite international experts in this field, and cover a research assistant to help with the coordination of the event and collect social science data during and before the workshop.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Integrante / Alexander Turra - Integrante / Kayleigh Wyles - Coordenador / Birgitta Gatersleben - Integrante / Justine Millard - Integrante. Financiador(es): Biotechnology and Biological Sciences Research Council - Auxílio financeiro.
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
6.   2020-Atual. Melhoramento genetico e epigenetico de caracteres de producao e reproducao animal
Descrição: A pecuária é uma das atividades de maior relevância para o desenvolvimento econômico no Brasil. Neste sentido, estratégias que abordem o melhoramento dos caracteres de produção e reprodução dos animais são de fundamental importância, inclusive para o crescimento sustentável dessa atividade. Neste projeto, propomos o uso de ferramentas bioquímicas e moleculares para: (i) Identificação de animais com incremento dos caracteres produtivos e reprodutivos; (ii) Desenvolvimento de ferramentas que auxiliem no diagnóstico precoce de caracteres de interesse; (iii) Desenvolvimento de sistemas de produção de embriões in vitro que permitam a geração de embriões com maior viabilidade após transferência; (iv) Impressão de marcas epigenéticas em embriões que promovam o incremento de caracteres de interesse econômico após o nascimento; (v) Desenvolvimento e melhoramento de tecnologias aplicadas a reprodução animal. Esperamos com esse projeto contribuir para o aumento da eficiência da produção bovina, minimizando os impactos ambientais gerados por ela.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcella Pecora Milazzotto - Coordenador.
Membro: Marcella Pecora Milazzotto.
7.   2020-Atual. Mitigacao dos impactos ambientais promovidos pela acao humana em sistemas agropecuarios
Descrição: Importantes produtos agropecuários como a soja, a cana-de-açúcar e as carnes (em particular a bovinocultura extensiva) têm sido responsáveis pelo uso de grandes áreas de maneira predatória. Para que essa atividade se mantenha forte e perene, no entanto, práticas sustentáveis devem ser adotadas e estão para além da questão do desmatamento de áreas preservadas. A sustentabilidade no agronegócio hoje incorpora questões relacionadas ao uso racional de recursos, tecnologias limpas, responsabilidade social, desenvolvimento empresarial, qualidade de vida, entre outros. Especificamente, práticas como projetos que integrem lavoura-pastagem-floresta, rastreabilidade, recuperação de pastagens, tratamento de efluentes e resíduos, e técnicas que aumentem a produção do cultivar/ animal por hectare são alguns dos possíveis recursos em estratégias sustentáveis. Neste sentido, o presente projeto tem como objetivo abordar a busca de estratégias biotecnológicas que mitiguem os impactos ambientais promovidos pelas atividades agrícolas. Como objetivos específicos associados a este projeto temos: (i) caracterizar as emissões dos voláteis de plantas presentes nos remanescentes florestais, visando conhecer os principais voláteis emitidos pela vegetação presente em ambientes antropizados, (ii) identificar se compostos emitidos pelo limbo foliar persistem na atmosfera e estão relacionados com os níveis de ozônio e seus precursores antrópicos, (iii) desenvolver de estratégias para o reflorestamento de área degradadas; (iv) incrementar a produção animal e vegetal através do delivery de fatores de crescimento e material genético em agricultura e na pecuária; (v) Desenvolver ferramentas de diagnóstico precoce de caracteres de interesse.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcella Pecora Milazzotto - Coordenador.
Membro: Marcella Pecora Milazzotto.
8.   2020-Atual. Observatorio de Conflitos na Internet
Descrição: Tecnologias de informação e comunicação, em particular, a Internet, reconfiguraram profundamente a dinâmica de conflitos na sociedade contemporânea em diferentes níveis. Neste sentido, o presente projeto ambiciona construir um Observatório de Conflitos na Internet, capaz de consolidar-se como uma referência nacional e internacional de pesquisas na área. Para tanto, propõe a realização de uma ampla pesquisa, de caráter interdisciplinar e estruturada em quatro etapas, visando: I) construir um arcabouço teórico consistente para definir e identificar conflitos na Internet; II) construir metodologias e sistemas computacionais capazes de observar, sistematicamente, a dinâmica dos conflitos na rede; III) analisar e sistematizar os dados referentes aos conflitos na Internet; IV) contribuir propositivamente para o desenho de políticas públicas capazes de potencializar os efeitos produtivos dos conflitos na Internet e ampliação do debate sobre a temática de estudo do Observatório.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (12) . Integrantes: Fabricio Olivetti de França - Integrante / Carlos Alberto Kamienski - Coordenador / Denise Hideko Goya - Integrante / Claudio Luis de Camargo Penteado - Integrante / Carlos da Silva dos Santos - Integrante / EMERSON URIZZI CERVI - Integrante / Eva Maria Campos Dominguez - Integrante / Flávio Eduardo Aoki Horita - Integrante / Marcus Abílio Gomes Pereira - Integrante / Mirtha Lina Fernández Venero - Integrante / Rafaela Vilela da Rocha Campos - Integrante / Victor Marchezini - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Fabricio Olivetti de Franca.
9.   2020-Atual. PRH-ANP: Uma abordagem interdisciplinar para a formacao de recursos humanos em petroleo, gas e biocombustiveis
Descrição: Trata-se de projeto vinculado ao edital 'Programa de Recursos Humanos' da Agência Nacional de Petróleo. A equipe é composta por cerca de 30 docentes da UFABC, e focará temas relacionados a Petróleo, Gás e Biocombustíveis com um enfoque no desenvolvimento de novos materiais, nanoestruturas e energias renováveis.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Romarly Fernandes da Costa - Integrante / Gustavo Martini Dalpian - Coordenador / Flávio Leandro de Souza - Integrante / Dalmo Mandelli - Integrante / André Sarto Polo - Integrante / André Santarosa Ferlauto - Integrante.
Membro: Romarly Fernandes da Costa.
Descrição: Trata-se de projeto vinculado ao edital 'Program de Recursos Humanos' da Agência nacional de Petróleo. A equipe é composta por cerca de 30 docentes da UFABC, e focará temas relacionados a Petróleo, Gás e Biocombustíveis com um enfoque em materiais, nanoestruturas e energias renováveis.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (12) / Mestrado acadêmico: (6) / Doutorado: (2) . Integrantes: Gustavo Martini Dalpian - Coordenador / Flávio Leandro de Souza - Integrante / Dalmo Mandelli - Integrante / André Sarto Polo - Integrante / André Santarosa Ferlauto - Integrante. Financiador(es): Agência Nacional do Petróleo - Outra.
Membro: Gustavo Martini Dalpian.
10.   2020-Atual. Ventilador Pulmonar de baixo custo Ara Plus: acao emergencial de combate a COVID-19
Descrição: O presente projeto vem propor uma contribuição para amenizar as consequências do enorme desafio que será imposto pela pandemia COVID-19, dada sua velocidade de propagação e sintomas que requerem internação hospitalar e cuidados especiais com o uso de respiração assistida. Neste cenário existe o real risco de saturar rapidamente os sistemas públicos e privados de saúde, tal como já acontece em alguns países.Entre os equipamentos mais demandados está o ventilador pulmonar, e em vários países já se notam esforços para aquisição de novos equipamentos, a recuperação de equipamentos danificados ou obsoletos, bem como, alternativas de equipamentos emergenciais de baixo custo e rápida produção como os perseguidos pelo projeto aqui proposto. Dentro do atual cenário de restrições logísticas e grande demanda mundial, uma alternativa local, com materiais industrializados localmente se mostra indispensável para salvar vidas. Assim, o grupo de pesquisadores envolvidos neste projeto buscará desenvolver um projeto de respirador de modo ​ Pressure Support Ventilation (PSV) em plataforma aberta, simples de montar, com mínimo custo de produção, utilizando componentes de fácil aquisição no mercado local, e que cumpram com as necessidades e requisitos mínimos dos órgãos reguladores. Espera-se que ao final deste projeto tenhamos um protótipo para oferecer a empresas dispostas a buscar as homologações necessárias e industrializá-lo em escala.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Roberto Asano Junior - Integrante / Ivan Correia Lima Coqueiro - Integrante / Erick Dario Leon Bueno de Camargo - Integrante / Olavo Luppi Silva - Coordenador / Hermann Windisch Neto - Integrante / Victor Allisson da Silva - Integrante / Danilo Luna Campos - Integrante. Financiador(es): Universidade Federal do ABC - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1
Membro: Roberto Asano Junior.

2019

1.   2019-Atual. CAPES PRINT: Espectroscopia, Espectrometria e Simulacao Computacional Aplicadas ao Estudo de Biomoleculas e suas Interacoes com o Ambiente
Descrição: As propriedades macroscópicas da matéria dependem de sua composição, do grau de organização microscópico e do ambiente em que está imersa. O estudo da estrutura da matéria permite prever e interpretar o comportamento químico de substâncias, a funcionalidade e as propriedades dos materiais. De forma mais específica, este projeto tem por objetivo estudar e descrever a estrutura de biomoléculas, como proteínas e biomembranas, bem como a interação destas com o ambiente em que estão contidas (desde meios aquosos de solvatação a superfícies metálicas) ou com outras moléculas. Propriedades eletrônicas e estruturais serão investigadas por meio de espectroscopia fotoeletrônica, espectrometria de massas e por radiação sincrotron (VUV e Raios-X), sendo que os resultados experimentais obtidos podem ser confrontados com dados de simulação obtidos por métodos teóricos ab initio e por DFT. A interação de biomoléculas com o meio e outras espécies será estudada de diversas formas. O comportamento de biomembranas em condições de stress oxidativo será avaliado por microscopia computacional. Empregando-se espectroscopia de fluorescência resolvida no tempo, será possível avaliar como efeitos específicos de solvatação e a formação de agregados supramoleculares modulam processos de transferência de energia, sendo que tais processos também serão estudados por simulação computacional por meio de métodos de QM/MM. Particularmente, métodos de simulação computacional serão utilizados na descrição das propriedades de interfaces metal/água e no comportamento de moléculas neste ambiente. Aplicando-se métodos de campo médio para descrever tais interfaces, serão descritos modos de grande amplitude em proteínas e sua relação com a ligação com substratos e capacidade catalítica. Pretende-se realizar aprendizado de máquina aplicado ao delineamento de processos em interfaces e superfícies, de forma a planejar propriedades quimicamente relevantes, tais como energia de adsorção e capacidade de transferência de carga. Neste sentido, simulação por dinâmica molecular utilizando potencial químico constante será empregada na descrição de processos de transferência de carga envolvendo moléculas adsorvidas em interfaces metal/água. Coletivamente, o uso de técnicas experimentais e de métodos de simulação permitirá racionalizar melhor como biomembranas e proteínas tendem a interagir com o ambiente e com espécies químicas que definem/regulam suas propriedades e comportamento.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alexsandre Figueiredo Lago - Coordenador / Maurício Domingues Coutinho Neto - Integrante / Paula Homem de Mello - Integrante / Rodrigo M. Cordeiro - Integrante / Káthia Maria Honório - Integrante / Fernando Bartoloni - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Alexsandre Figueiredo Lago.
2.   2019-Atual. CAPES PrInt: Program for Institutional Internationalization - UFABC
Descrição: Descrição em: http://propg.ufabc.edu.br/wp-content/uploads/Portuguese_Print.pdf Membro do Comitê Gestor do Capes-Print UFABC. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: João Paulo Gois - Integrante / CHARLES MORPHY D. SANTOS - Coordenador. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Joao Paulo Gois.
3.   2019-Atual. CAPES PRINT: Sintese, caracterizacao e simulacao de materiais avancados
Descrição: Este projeto tem por finalidade fortalecer a internacionalização da área de Física da Matéria Condensada da UFABC, do ponto de vista de síntese, caracterização e simulação de materiais. Essa área avançou de forma muito rápida nos últimos anos, sendo uma de suas principais características o aumento da interação com outras áreas, principalmente química e Ciência dos Materiais, focando o desenvolvimento de pesquisas interdisciplinares. Este avanço é abordado neste projeto através de um processo colaborativo entre pesquisadores dos programas de pós-graduação em Física, Química e Nanociências e Materiais avançados da UFABC. Esta interação colaborativa, juntamente com as colaborações internacionais já vigentes, bem como possíveis novas colaborações, servirá de catalisador para o desenvolvimento de projetos mais audaciosos e amplos, bem como para a formação ampla dos alunos envolvidos. A área da Física da Matéria Condensada na UFABC conta com pesquisadores especializados no crescimento de materiais, por rotas físicas e química, focando materiais cerâmicos, magnéticos e semicondutores; na caracterização de materiais, através de técnicas como raios-x, Rietveld, magnetização, condutividade elétrica, magnetorresistência entre outras; e na modelagem computacional de materiais utilizando-se de métodos clássicos e quânticos. É importante destacar a enorme importância dessas colaborações para o desenvolvimento de novas tecnologias e a inovação num contexto mais amplo. É por conta do desenvolvimento de novos materiais que temos acesso hoje a supercondutores super rápidos (semiconductores), a lasers superpotentes e a fármacos mais eficientes. A interação com os grupos estrangeiros possibilitará o avanço científico e tecnológico da área de matéria condensada e a formação de doutores de alta qualidade na UFABC.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gustavo Martini Dalpian - Coordenador / Adalberto Fazzio - Integrante / Herculano Martinho - Integrante / Wendel Andrade Alves - Integrante / Flávio Leandro de Souza - Integrante / Jose Antônio Souza - Integrante / PEDROZA, LUANA S. - Integrante / Fabio Furlan - Integrante / Cedric Rocha Leão - Integrante / Marcos de Abreu Avila - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
Membro: Gustavo Martini Dalpian.
4.   2019-Atual. Citogenetica e polinizacao de Balanophoraceae
Descrição: A família de plantas parasitas de raízes Balanophoraceae caracteriza-se por plantas aclorofiladas que emergem do solo apenas no período de florescimento. Este projeto contempla duas linhas de pesquisa. A primeira refere-se a Citogenética de Balanophoraceae: a família Balanophoraceae insere-se na ordem Santalales, composta por outras famílias de plantas parasitas e todas com tamanhos de genoma elevado. Aqui visamos inicialmente acessar os valores de tamanho de genoma das espécies de Balanophoraceae do Neotropico para então avaliar possíveis associações entre expansão do tamanho de genoma e o hábito parasita. A segunda linha busca compreender a polinização e dispersão de Balanophoraceae, em especial Scymbalium fungiformis, uma espécie com alta produção de néctar e diversos visitantes florais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Ana Paula de Moraes - Coordenador / Felipe Amorim - Integrante / Caio S. Ballarin - Integrante / Leonor Patrícia C. Morellato - Integrante.
Membro: Ana Paula de Moraes.
5.   2019-2020. Conjunto de aplicativos moveis acessiveis para apoio ao aluno deficiente visual e auditivo
Descrição: (Edital nº 03/2018 - Fomento à inovação para o desenvolvimento e aplicação de tecnologias de informação e comunicação em educação na temática ferramentas de acessibilidade - Processo: 88887.185266/2018-00). Este projeto tem como objetivo desenvolver um conjunto de aplicativos móveis (para Android) que se adaptam às necessidades dos estudantes com deficiência visual e auditiva, servindo de tecnologia assistiva no âmbito acadêmico. Inclui nesse conjunto: configurador/adaptador de acessibilidade, registro de aulas, assistente para provas e uso opcional de teclado tátil.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Francisco de Assis Zampirolli - Integrante / Edson Pinheiro Pimentel - Integrante / Juliana Braga - Coordenador / Rafaela Vilela da Rocha - Integrante / Mirtha Lina Fernandéz Venero - Integrante / Silvia Dotta - Integrante / André Luiz Brandão - Integrante / Marina Sparvoli de Medeiros - Integrante / Priscila Benitez Afonso - Integrante / Kate Mamhy Oliveira Kumada - Integrante / Karla Vittori - Integrante / Airton Paulo de Oliveira Junior - Integrante / Lucia Regina Horta Rodrigues Franco - Integrante / Denise Goya - Integrante / Carla Lopes Rodriguez - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Francisco de Assis Zampirolli.
6.   2019-2020. Desenvolvimento de potenciais empiricos para a simulacao computacional de materiais
Descrição: Simulações atom1ísticas de dinâmica molecular e Monte Carlo para sistemas com milhares ou mesmo milhões de átomos requerem que as interações entre os átomos sejam descritas por meio de funções anal1íticas simples. Essas funções são chamadas de potenciais interatômicos (ou de force fields) e substituem a solução, muito mais cara computacionalmente, da equação de Schroedinger. O desenvolvimento de bons potenciais interatômicos é portanto uma tarefa crucial e a falta desses potenciais para vários materiais de grande interesse acadêmico e industrial representa um sério inconveniente e uma limitação para o avanço dessas simulações. Este projeto tem por objetivo inicial concluir o desenvolvimento de um código computacional que emprega o algoritmo de simulated annealing para obter potenciais interatômicos a partir de dados de referência de primeiros princípios. Subsequentemente, o código será utilizado para obter esses potenciais para materiais, particularmente ligas metálicas, que são de interesse para as linhas de pesquisa que o autor da proposta já vem desenvolvendo, inclusive em projetos que foram financiados pela FAPESP.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Roberto Gomes de Aguiar Veiga - Coordenador / Gabriel Henrique Perez - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Roberto Gomes de Aguiar Veiga.
7.   2019-Atual. Desenvolvimento de Sistema de Avaliacao da Circulacao Encefalica para auxiliar Diagnostico e Tratamento de Pacientes Neurologicos
Descrição: O mecanismo de autorregulação cerebral tem um papel crucial na homeostase encefálica; ele é responsável por manter o fluxo sanguíneo encefálico (FSE) constante apesar da variação da pressão arterial (PA) entre os limites de 60 a 140 mmHg. A constatação desta relação levou a progressos acerca da quantificação da autorregulação, empregando-se técnicas de processamento capazes de extrair informações relativas à interação entre PA e FSE. Ao longo dos últimos 20 anos, um software foi desenvolvido pela Universidade de Leicester (Inglaterra) aos quais contêm as principais técnicas de avaliação da autorregulação cerebral. No entanto, o processamento dos dados é realizado dentro do sistema operacional DOS, sistema obsoleto e incompatível com computadores atuais, impossibilitando a comunicação com os equipamentos médicos e dificultando a implementação de novas técnicas de processamento de sinais fisiológicos. Além disso, a ampla variedade de parâmetros utilizados para o cálculo da autorregulação cerebral faz com que os resultados entre os centros seja divergente. Neste contexto, este projeto visa desenvolver uma plataforma de software inovadora para o monitoramento em tempo real da autorregulação cerebral, bem como investigar mais profundamente como as diferentes configurações dos parâmetros podem afetar o cálculo deste mecanismo. Os resultados deste projeto certamente irão revolucionar o manejo clínico ofertado a pacientes com patologias neurológicas, principalmente na escolha das medidas neuroprotetoras que afetam o fluxo encefálico.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Fernando Silva de Moura - Integrante / João Loures Salinet Júnior - Integrante / Angela S Macedo Salinet - Coordenador / Edson Bor-Seng-Shu - Integrante.
Membro: Fernando Silva de Moura.
8.   2019-Atual. Evolution of chromosome number in the genus Utricularia L. (Lentibulariaceae)
Descrição: Utricularia are carnivorous plants distributed worldwide and include species with the smallest genomes. However, it is suggested that polyploidy is an important evolutive force in Utricularia, what needs to be better explored. Therefore, we aim to study chromosome numbers in a phylogenetic approach to better understand the evolution of plant minute genomes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ana Paula de Moraes - Integrante / Saura Rodrigues da Silva - Coordenador / Vitor Fernandes Oliveira de Miranda - Integrante / Alessandro M. Varani - Integrante.
Membro: Ana Paula de Moraes.
9.   2019-Atual. INCT da Internet do Futuro para Cidades Inteligentes
Descrição: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Emilio de Camargo Francesquini - Integrante / KON, FABIO - Coordenador.
Membro: Emilio de Camargo Francesquini.
10.   2019-Atual. Influencia do Efeito de Acoplamento Multicanal na Descricao dos Processos de Espalhamento Elastico e de Excitacao Eletronica de Moleculas por Impacto de Eletrons
Descrição: Os novos desafios enfrentados pela humanidade tem ampliado de maneira inequívoca as fronteiras que devem ser alcançadas e, porventura, transpostas pela ciência. Estes desafios se revestem cada vez mais de um caráter interdisciplinar exigindo, portanto, uma ação integrada entre as mais diferentes áreas do conhecimento. A capacidade de manipulação e controle de reações fı́sico-quı́micas na escala nanoscópica, sem dúvida, oferece novas e excitantes oportunidades que podem ser exploradas tanto do ponto de vista da pesquisa básica quanto das aplicações tecnológicas. Estudos bastante recentes mostram que as colisões iniciadas por elétrons de baixa energia atuam de maneira muito eficiente e com alto grau de seletividade na quebra de ligações químicas em sistemas poliatômicos permitindo, ainda, um controle fino desta seletividade em termos da escolha apropriada para a energia da partı́cula incidente. Além disso, as seções de choque que representam os processos de espalhamento de elétrons por moléculas se apresentam como parâmetros de entrada muito importantes em códigos computacionais utilizados na modelagem da radiólise em meio celular (Monte Carlo track strutucture) e na modelagem de plasmas atmosféricos (Boltzman equation). A obtenção de seções de choque, confiáveis e acuradas, para as colisões de elétrons com sistemas moleculares - em especial biomoléculas e outros compostos orgânicos - constitui um passo fundamental mas, também, representa um desafio bastante complexo e sofisticado. Tendo em vista estas considerações, o presente projeto de pesquisa tem como meta principal o estudo da dinâmica em processos de espalhamento de biomoléculas iniciados por impacto de elétrons de baixa energia. Para tanto, pretende-se utilizar os códigos computacionais do método multicanal de Schwinger recentemente otimizados no que diz respeito à descrição dos estados eletrônicos do alvo molecular de modo a possibilitar a utilização de estratégias mais elaboradas para a inclusão do efeito de acoplamento multicanal.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Romarly Fernandes da Costa - Coordenador / MOREIRA, GISELI M. - Integrante / Alan Guilherme Falkowski - Integrante / Jorge Luiz da Silva Lino - Integrante / Murilo de Oliveira Silva - Integrante / Yan Alexssander Celima de Avó - Integrante / Victor Enzo Yonemoto - Integrante / Lara Mei Honda - Integrante.
Membro: Romarly Fernandes da Costa.
11.   2019-Atual. Infraestrutura Institucional para Pesquisa
Descrição: A Reserva Técnica Institucional (RTI) FAPESP disponibilizada para o CCNH equivale a R$ 185.338,00. Os recursos serão aplicadas no suprimento de necessidades relativas à (1) adequação de infraestrutura para espaço de grupos de pesquisa alocados nos Blocos A, B e L; (2) aquisição de material de consumo destinado a espaços e equipamentos de caráter multiusuário destinados a grupos de pesquisa do CCNH e da UFABC; (3) aquisição de equipamentos para infraestrutura coletiva.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ronei Miotto - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Ronei Miotto.
12.   2019-2021. Machine Learning em Imagens Medicas: Plataforma Nacional de Armazenamento e Inteligencia Artificial em Imagens Medicas para Pesquisa, Inovacao e Suporte a Decisao Clinica
Descrição: Imagens médicas são fontes relevantes para a análise e diagnóstico de doenças em pacientes. Com o crescimento da tecnologia para aquisição e armazenamento, as imagens tornaram-se um importante instrumento na gestão da saúde. Todavia, o número de profissionais especializados não acompanhou a evolução tecnológica. Quando se considera o SUS, o problema ganha uma nova dimensão: imagens coletadas em diferentes formatos; protocolos; e níveis de aquisição (hospitais; unidades básicas de saúde e de pronto atendimento). Esta complexidade encontrada no Brasil, assim como em outros países com dimensões continentais e características socioeconômicas semelhantes, torna necessário o desenvolvimento de uma estrutura acessível capaz de armazenar, classificar e promover um ambiente para pesquisa e inovação. Entende-se como a criação de ferramentas de inteligência artificial que possam auxiliar nas tomadas de decisão em diferentes áreas: desde política estratégica em escala populacional, como suporte de decisão para diagnóstico. Este projeto contempla o desenvolvimento de uma base nacional de armazenamento de imagens médicas, permitindo o acesso de exames e o acompanhamento de patologias, melhorando a avaliação de resposta ao tratamento. Este ambiente permite que equipes de pesquisa em universidades e startups possam ser conectadas à base, propondo novos modelos de inteligência artificial. Trata-se de uma proposta conceitual, que prepara um ecossistema de automação diagnóstica, gerando impacto positivo na sobrevida e na qualidade de vida dos pacientes, bem como na redução dos custos com o tratamento, uma vez que as patologias são abordadas em estágios mais incipientes. Além disso, estaremos desenvolvendo três modelos de Machine Learning em afecções que foram eleitas como de relevância para o SUS: Zika, Melanoma e Tuberculose. Estes foram definidos como desafios assistenciais, por representarem três amostras do potencial de impacto da plataforma proposta. Para uma maior eficiência no uso dos modelos, adotamos o conceito de service design, que considera atividades de planejamento, conhecimento da infraestrutura, avaliação recursiva do propósito de modelagem e, principalmente, conhecimento técnico de vários especialistas na cadeia de operação em atenção primária e serviços especializados. Para tanto, dados de raio-X de tórax, tomografia computacional de crânio e fotos de melanoma irão constituir um primeiro esboço da base nacional de imagens médicas. Por fim, este projeto representa o preparo para um ambiente de armazenamento, disponibilização de dados e automação diagnóstica. Pesquisas em universidades, empresas e startups poderão ser integradas na plataforma, onde passam a ter uma função automatizada na mesma. Isto significa que, para cada nova imagem de pacientes e que seja elegível de análise, o SUS estará apto a auxiliar no diagnóstico as equipes assistencias, propiciando à saúde nacional um ecossistema tecnológico e colaborativo e para a população.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: André Ricardo Oliveira da Fonseca - Integrante / Birajara Soares Machado - Coordenador.
Membro: Andre Ricardo Oliveira da Fonseca.
13.   2019-Atual. Modelagem de escoamento com giro - dinamica dos fluidos e transferencia de calor
Descrição: Escoamentos com giro são uma ocorrência comum na natureza e é amplamente adaptado em aplicações de engenharia, como separação dispositivos, trocadores de calor, câmaras de combustão, turbomáquinas, motores de foguetes nucleares e dispositivos de controle de poluição. Os efeitos de fluxos de alta velocidade na dissipação viscosa são bem conhecidos, mas a configuração de fluxo onde o fluido é altamente viscoso, como fluidos de hidrocarbonetos, é mais recente e precisa ser investigado em profundidade. Um dos aspectos essenciais dos óleos pesados é que sua viscosidade impacta diretamente na recuperação, produtividade, separação do reservatório processo e métodos de transporte. Esse projeto propõe um estudo numérico e teórico do escoamento com giro, em tubos, de fluido altamente viscoso. Em dinâmica dos fluidos, o foco será a identificação da quebra de vórtice, típica nesse tipo de aplicação, mas que precisa ser melhor investigada para números de Reynolds baixos. Em transferência de calor, o foco será o efeito do giro sobre a dissipação viscosas e o número de Nusselt.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: André Damiani Rocha - Coordenador.
Membro: Andre Damiani Rocha.
14.   2019-2020. Ocean LitterAcy (OLA) - Empowering society to combat marine litter through citizen science
Descrição: Marine litter is a global problem, with national and international initiatives trying to further understand and combat it. Brazil, like many other developing countries, is attempting a multi-solution approach to face marine litter, yet face numerous barriers to engage society and promote social control. This proposal examines how citizen science, where volunteers collect scientific data such as recording marine litter, can be used to empower and encourage societal change (both in terms of individual behaviour change but also support national and international infrastructure and policy change). Specifically, collaborating across nations (i.e. UK Brazil), disciplines (i.e. social natural sciences, engineering), and sectors (i.e. science, policy, NGOs, industry), this project will identify and prioritise research gaps, policy-relevant implications and training needs in order to maximise the impact monitoring initiatives by citizen scientists can have on scientific data but also directly and indirectly on all groups of society.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Integrante / Alexander Turra - Integrante / Larissa de Araújo Kawabe - Integrante / Kayleigh Wyles - Coordenador / Birgitta Gatersleben - Integrante. Financiador(es): University of Surrey - Auxílio financeiro / University of Surrey - Bolsa.
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
15.   2019-Atual. Paralelizacao de Problemas de Geofisica em Clusters Heterogeneos CPU-CPU na Nuvem
Descrição: Imageamento sı́smico é reconhecidamente um problema de Geofı́sica que é central à etapa de exploração de petróleo. A solução deste problema se baseia em técnicas de Reverse Time Migration (RTM) como Common-Reflection-Surface (CRS) e Full Waveform In- version (FWI) que realizam computações complexas em volumes gigantescos de dados. Técnicas como FWI, por exemplo, oferecem soluções precisas para o problema de image- amento sı́smico, a um custo computational muito elevado. Por outro lado, a disponibi- lização pela indústria de nuvens com nós CPU-GPU tem indicado que problemas como FWI podem se beneficiar de um número significativo de nós CPU-GPU com elevada ca- pacidade computacional. A meta deste projeto é desenvolver uma plataforma, chamada BR-CLOUD, baseada em padrões da industria, que permita uma solução eficiente na nu- vem para problemas complexos de imageamento sı́smico. Para viabilizar esta plataforma pretende-se integrar e ampliar modelos de execução paralela já usados pela indústria como OpenMP, MPI e CUDA. O modelo resultante deve ser totalmente compatı́vel com estes padrões, ser independente de versões de ferramentas, e permitir o descarregamento de programas cientı́ficos complexos em nuvens heterogêneas de maneira transparente, balanceada e tolerante à falhas. Descarregamento de computação (i.e. computation of- floading) é um modelo de programação paralela em que os fragmentos do programa (por exemplo, laços quentes) são anotados para que sua execução seja realizada em hardware dedicado ou dispositivos aceleradores como GPUs. A equipe deste projeto possui uma grande experiência em paralelização de código, e propôs o primeiro modelo que esten- deu o padrão OpenMP para permitir descarregamento de computação transparente na nuvem. Este modelo, chamado OmpCloud, segue o padrão OpenMP, e foi testado com uma aplicação cientı́fica complexa nas nuvens da Amazon AWS e Microsoft Azure, pro- duzindo bons resultados. Este projeto tem dois objetivos. Primeiro pretende-se estender OmpCloud para viabilizar paralelismo de tarefas de OpenMP 4.X na nuvem, integrando o modelo resultante de maneira transparente com drivers MPI. Isto permitirá a execução não bloqueante e pipelined das tarefas de fomatação e distribuição de dados com a com- putação em GPU dos kernels dos programas. Espera-se com isto superpor latências de execução temporal e espacialmente de modo a melhorar o desempenho final da aplicação. O segundo objetivo deste projeto é desenvolver técnicas de otimização de código para GPUs que melhorem a localidade de referência e a latência de descarregamento de dados.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Emilio de Camargo Francesquini - Integrante / Guido Costa Souza de Araújo - Coordenador.
Membro: Emilio de Camargo Francesquini.
16.   2019-Atual. Planejamento de inibidores das calicreinas 5, 6 E 7 usando metodos computacionais e o ensaio de fragmentos moleculares
Descrição: As enzimas KLK5, KLK6 e KLK7 (abreviada para KLK5-KLK7 daqui em diante) são serino-proteases e pertencem a família das calicreínas. Estas enzimas estão envolvidas em mecanismos fisiológicos importantes tal como a descamação da pele e desenvolvimento neural. Além do seu importante papel no funcionamento normal das células, evidências mostram que a desregulação da expressão das enzimas KLK5-KLK7 ou o aumento excessivo da sua atividade proteolítica estão associadas à várias doenças como câncer, síndrome de Netherton e esclerose múltipla. Em virtude disso, a inibição dessas enzimas pode representar novos alvos para o tratamento dessas doenças. Contudo, a ausência de inibidores potentes, seletivos e ativos em modelos celulares e animais dificulta a validação dessas enzimas como alvos terapêuticos. Nesse sentido, esse projeto propõe a utilização conjunta de métodos computacionais e experimentais para a identificação e otimização de inibidores das calicreínas KLK5-KLK7 que possam ser empregados para investigar a relevância dessas enzimas em diferentes doenças. A disponibilidade das estruturas de Raios-X das enzimas KLK5-KLK7 em complexo com pequenas moléculas bem como a estrutura química de alguns inibidores irá permitir o uso dos métodos de ensaio virtual baseado na estrutura do receptor e dos ligantes, visando a seleção de um número reduzido de compostos que apresentem alta probabilidade de serem ativos nos ensaios experimentais. Em conjunto com os métodos computacionais, esse projeto irá aplicar também o ensaio de fragmentos moleculares (compostos com massa molecular entre 150 e 250 Da) para identificar novos inibidores das enzimas KLK5-KLK7. Essa é uma estratégia validada para a identificação de ligantes e permite explorar o espaço químico de maneira mais eficiente do que o ensaio de coleções de compostos com propriedades fármaco-similares.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Renato Ferreira de Freitas - Coordenador / Luciano Puzer - Integrante / Rodrigo Luiz Oliveira Rodrigues Cunha - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Renato Ferreira de Freitas.
17.   2019-Atual. Projeto de PD (UFABC/Eletropaulo) - Potencialidade da Geracao Solar Fotovoltaica para a Melhoria no Fornecimento de Energia Eletrica nas Redes de Distribuicao
Descrição: Processo: 230006.002665/2017-50; Espécie: Termo de Colaboração Técnico-Cientifíco - TCTC n. 12/2019 celebrado entre a UFABC - CNPJ 07.722.779/0001-06 e a Eletropaulo Metropolitana Eletricidade de São Paulo S.S. - CNPJ 61.695.227/0001-93. Obejeto: Desenvolver projeto intitulado Potencialidade da Geração Solar Fotovoltaica para a Melhoria no Fornecimento de Energia Elétrica nas Redes de Distribuição.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (7) / Doutorado: (2) . Integrantes: Roberto Asano Junior - Integrante / Patricia Teixeira Leite Asano - Coordenador / Ricardo Caneloi dos Santos - Integrante / Sergio Henrique Ferreira de Oliveira - Integrante / Federico Bernadino Morante Trigoso - Integrante / Edmarcio Antônio Belati - Integrante / Maria Cleofé Valverde Brambila - Integrante / Joel David Melo Trujillo - Integrante / Ahda Pionkoski Grilo Pavani - Integrante / Ricardo da Silva Benedito - Integrante / Lucas Ribeiro Torin - Integrante / Celso Carlos S. Spuhl - Integrante / Guilherme Madeira - Integrante / Antonio Padilha Feltrin - Integrante / Renato Tsutomu Koganezawa - Integrante / Ulisses de Marchi Silva Terra - Integrante / Romulo Gonçalves Lins - Integrante / Elio Vicentin - Integrante / Juscelino Batista dos Santos - Integrante / Thiago Abraão dos Anjos da Silva - Integrante / Aline SantAna de Souza - Integrante / Yanick Rodolfo Gomes - Integrante / Rodrigo Garcia da Silva Viana - Integrante / Luiza Buscariolli - Integrante / Joel Villavicencio Gastelu - Integrante / Renzo Amilcar Vargas Peralta - Integrante. Financiador(es): Eletropaulo Metropolitana - Outra.
Membro: Roberto Asano Junior.
18.   2019-Atual. Reforco e aprimoramento da infraestrutura de pesquisa transversal e multidisciplinar da UFABC (REFIPENE)
Descrição: A presente proposta "reforço da infraestrutura de pesquisa transversal e multidisciplinar da UFABC (REFIPENE)" é fruto da articulação e inserção dos Núcleos Estratégicos de Pesquisa existentes na UFABC que visam prover recursos para a ampliação e reforço da infraestrutura científica atual da universidade, atendendo as linhas temáticas do presente edital e de suas próprias frentes de atuação - Biotecnologia, Ciências Biomédicas, Engenharias, Ciências Sociais e Nanotecnologia. Em geral foi dada prioridade para a proposta de infraestrutura com claro caráter multiusuário que será recebido e gerenciado, quando possível, pelas Centrais Experimentais Multiusuário (CEMs) ou pelos próprios Núcleos Estratégicos como apresentado nos subprojetos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / Iseli Lourenço Nantes - Integrante / TIAGO RODRIGUES - Integrante / RODRIGO L. O. R. CUNHA - Integrante / Gustavo Martini Dalpian - Integrante / Derval dos Santos Rosa - Integrante / Daniele Ribeiro de Araujo - Integrante / Carlos Rettori - Integrante / Amedea Barozzi Seabra - Integrante / Mauricio Coutinho Domingues Neto - Integrante / Alejandro Zuniga - Integrante / Fernando Carlos Giacomelli - Integrante / Javier Acuña - Integrante / Dalmo Mandelli - Integrante / Alexandre Hiroaki Kihara - Integrante / Nelson Eduardo Durán Caballero - Integrante / Giselle Cerchiaro - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
19.   2019-Atual. Salvaguardando servicos de polinizacao em um mundo em mudanca: teoria na pratica (SURPASS2)
Descrição: Os polinizadores têm um papel essencial na reprodução de espécies vegetais em áreas preservadas e na produção agrícola. O conhecimento sobre sua distribuição espacial e temporal é de extrema importância para a conservação e uso sustentável da biodiversidade e pode ser gerado a partir de registros de ocorrência das espécies obtidos em inventários em campo. A disponibilização online desses dados tem crescido rapidamente e com ela nota-se a existência de lacunas de conhecimento, com regiões e táxons sub-amostrados, requerendo um maior esforço de coleta de dados, o que pode ser alcançado com a colaboração de cidadãos devidamente capacitados para a tarefa (cientistas cidadãos). Dados digitalizados e online de interações entre espécies, como as interações planta-polinizador, são ainda mais incipientes, apesar de serem de grande importância para o entendimento das relações e processos biológicos. Isso se deve à complexidade inerente dos dados de interações, que se reflete ainda na falta de um padrão para sua representação, ao contrário do que ocorre com dados de ocorrências, que possuem um padrão de dados internacionalmente bem estabelecido, o Darwin Core. Para atacar essas questões, este projeto propõe: a) desenvolver um padrão para a digitalização de dados de interações planta-polinizador, que facilite o compartilhamento, reuso e agregação de dados; b) desenvolver um sistema de informação sobre interações planta-polinizador a partir desse padrão; c) gerar um diagnóstico das interações planta-polinizador no Brasil e d) identificar lacunas de conhecimento. Propõe ainda desenvolver um programa de ciência cidadã para polinizadores, incluindo: a) desenvolver um aplicativo e sistema apropriados para a coleta de dados para registro e monitoramento de polinizadores; b) avaliar a qualidade dos dados gerados; c) avaliar os ganhos de conhecimento dos cidadãos participantes; e d) criar uma rede Latino Americana sobre os temas de interações planta-polinizador e ciência cidadã para polinizadores.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Integrante / Saraiva, Antonio Mauro - Coordenador / Francisco E. Fonturbel - Integrante / Marcelo Adrian Aizen - Integrante / Matthew Heard - Integrante / Kayna Agostini - Integrante / Tiago Mauricio Francoy - Integrante / Allan Koch Veiga - Integrante / Andre Rodrigo Rech - Integrante / Betina Blochtein - Integrante / Bruno de Carvalho Albertini - Integrante / Charles Fernando dos Santos - Integrante / Etienne Américo Cartolano Júnior - Integrante / Isabela Galarda Varassin - Integrante / Leandro Freitas - Integrante / Marcia Motta Maues - Integrante / Marina Wolowski Torres - Integrante / Sheina Koffler - Integrante / Celso Barbieri - Integrante / Jailson N. Leocadio - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Outra / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
20.   2019-Atual. Sistematica e citogenetica em Monimiaceae (Laurales)
Descrição: O presente projeto visa fornecer uma hipótese filogenética robusta para a família Monimiaceae, avaliando as relações entre tribos, gêneros e espécies. Espécies novas têm sido sugeridas dentro desta família e serão avaliadas pela sua morfologia, sistemática, número cromossômico e tamanho de genoma. A hipótese filogenética gerada neste projeto será utilizada para avaliar a evolução dos caracteres de tamanho genômico e evolução cromossômica em Monimiaceae.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Ana Paula de Moraes - Coordenador / Elton John de Lírio - Integrante / Danilo Alvarenga Zavatin - Integrante / Paulo Takeo Sano - Integrante / Ariane Luna Peixoto - Integrante / Maria Cristina de Castilhos Pauli Barbosa - Integrante / Narjes Seighali Komleh - Integrante.
Membro: Ana Paula de Moraes.
21.   2019-Atual. Sintese e caracterizacao estrutural e magnetica de nanoparticulas superparamagneticas de oxido de ferro incorporadas em polimeros inteligentes para liberacao controlada de farmacos
Descrição: A preparação de novos veículos hidrossolúveis de alta viscosidade, como os géis hidrofílicos, é uma das muitas estratégias para obtenção de formas de liberação controlada de fármacos e representa uma área de investigação bastante importante emaplicações biomédicas. Dentro deste contexto, o foco principal deste projeto é agregar as funcionalidades de nanopartículas superparamagnéticas de óxido de ferro comas de copolímeros dependentes da temperatura, como Poloxamer 407 (PL 407), como potenciais veículos carreadores de fármacos. Esses copolímeros são conhecidos por aumentar a biodisponibilidade e tempo de circulação no sangue, agindo tambémna formulação farmacêutica para melhorar a solubilidade de drogas hidrofóbicas. Diversos tipos de nanopartículas contendo estes copolímeros são obtidas no intuito de estabilizar e manter suspensões emmeio comalta força iônica, como emaplicações farmacêuticas. Assim, este projeto se baseia emduas vertentes principais. A primeira é sintetizar nanopartículas (NPs) superparamagnéticas de óxido de ferro do tipo magnetita, Fe3O4. A segunda vertente será a incorporação destas NPs magnéticas nos hidrogéis PL407 a fim de utilizá-las em aplicações biomédicas. As caracterizações estrutural, morfológica, magnética e a eficiência de incorporação das nanopartículas nos hidrogéis serão realizadas na Central Experimental Multiusuário (CEM) da UFABC.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / Paula Silvia Haddad - Integrante / Daniele Ribeiro de Araujo - Integrante / FONSECA, FERNANDO L.A. - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
22.   2019-2020. Texturas de spin nao triviais em filmes finos de SrFeO3
Descrição: Skyrmions (Sks) magnéticos são texturas de spin com configuração de vórtice que apresentam propriedades físicas protegidas pela sua natureza topológica não trivial. Sks são comumente mais reportados em estruturas cristalinas não centrossimétricas onde a interação antissimétrica de Dzyaloshinskii-Moriya (DM) apresenta um papel fundamental na estabilização dos Sks. Contudo, uma estrutura topológica não trivial foi observada recentemente em um cristal de SrFeO3 o qual apresenta uma estrutura cristalina centrossimétrica. Nesse caso, o aparecimento de Sks está relacionado a outras interações as quais abrem a possibilidade de criar estruturas de spin completamente distintas. Nesta proposta, investigaremos a estrutura magnética de filmes finos de SrFeO3 crescidos em diferentes substratos para mapear a influência da tensão dos filmes finos na sua estrutura de spin. Além disso, estudaremos os efeitos de proximidade na interface entre os filmes de SrFeO3 e um substrato ferromagnético.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Lucas Almeida Miranda Barreto - Coordenador / Steven May - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Lucas Almeida Miranda Barreto.
23.   2019-2021. Um Sistema Universal para Geracao e Correcao Automatica de Questoes Parametrizadas
Descrição: (Processo: 2018/23561­-1). Apresentamos uma solução inovadora para simplificar a geração e correção de questões parametrizadas para serem aplicadas em exames em papel, podendo ser reutilizáveis em várias instituições de ensino. Foi desenvolvido inicialmente um protótipo online para validar conceitos, resultando inicialmente em várias propostas de contribuições científicas na área de educação, sistemas de informação, visão computacional e computação de alto desempenho. Além disso, este protótipo está em operação e auxilia professores de diversas instituições na geração e correção de exames. Esse projeto de pesquisa visa fomentar a divulgação dessas contribuições científicas e fazer melhorias na usabilidade das interfaces gráficas existentes.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Francisco de Assis Zampirolli - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Francisco de Assis Zampirolli.

2018

1.   2018-Atual. [CAPES-PrInt UFABC] Combinatoria e aplicacoes em Bioinformatica, Cientometria, e Computacao Grafica
Descrição: A Ciência da Computação está cada vez mais presente em diversas áreas do conhecimento, fomentando a necessidade de criar novas tecnologias para lidar com problemas crescentemente complexos de diversas áreas da ciência. Tais avanços tecnológicos são possíveis através de resultados teóricos que sustentem a geração de modelos computacionais adaptados aos novos problemas interdisciplinares. Por exemplo, o estudo de estruturas combinatórias tem um papel fundamental no desenvolvimento de algoritmos eficientes para resolver problemas nas áreas de Bioinformática, Cientometria e Computação Gráfica. Em particular, análise de redes complexas, que são grafos com características topológicas não triviais que ocorrem em muitas situações do mundo real, é uma área de pesquisa com diversas aplicações atuais e de interesse público que permite entender desde o comportamento social nas redes até o funcionamento biológico das redes neuronais e de genes e proteínas. Dividimos os objetivos deste projeto em duas frentes: 1) Investigar propriedades estruturais, combinatórias e algorítmicas de grafos e estruturas discretas relacionadas; 2) Aplicar técnicas combinatórias para obter avanços em problemas de Bioinformática, Cientometria e Computação Gráfica. Em Bioinformática, o foco será na inferência, modelagem e simulação de redes de biologia molecular, empregando-se análise de redes complexas, incluindo o desenvolvimento de métodos de detecção de comunidades e padrões estruturais locais que se repetem e que normalmente estão associados a alguma função importante na rede. Já em Cientometria, o foco é na aplicação de conceitos de teoria dos grafos e de redes complexas para análise de redes de pesquisadores, que também envolve busca de comunidades, padrões estruturais locais em grafos e predição de ligações futuras. Finalmente, em Computação Gráfica o objetivo é segmentar imagens e vídeos através da aplicação de grafos Laplacianos construídos a partir das entradas para o problema de segmentação ou co-segmentação. Embora o foco das aplicações seja dado principalmente nas três frentes supracitadas, praticamente todas as áreas da ciência dependem de análise combinatória, mais notadamente: física, química, biologia, engenharias, astronomia, ciências sociais (especialmente análise de redes sociais), dentre outras.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luiz Carlos da Silva Rozante - Integrante / David Correa Martins Jr. - Integrante / Harlen Costa Batagelo - Integrante / João Paulo Gois - Coordenador / Daniel Morgato Martin - Integrante / Fabrício Olivetti de França - Integrante / Jesús Pacual Mena- Chalco - Integrante / Saul de Castro Leite - Integrante / Carla Negri Lintzmayer - Integrante / Cláudio Nogueira de Meneses - Integrante / Guilherme Oliveira Mota - Integrante / Cristiane Maria Sato - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Luiz Carlos da Silva Rozante.
2.   2018-2021. Analise dos padroes de conectividade cerebral em individuos com dor cronica
Descrição: Dor crônica é um fenômeno complexo, não totalmente explicado, que atinge 37% da população brasileira e gera gastos da ordem de milhões de reais por ano. Partindo da hipótese que a dor crônica altera o padrão da conectividade cerebral, utilizaremos as Teorias de Sistemas Dinâmicos e Grafos para representar a atividade neural durante sessões de repouso e de imagética de movimento, analisando quantitativamente e qualitativamente os eletroencefalogramas de indivíduos normais e com dor crônica.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: André Ricardo Oliveira da Fonseca - Coordenador / Abrahão Fontes Baptista - Integrante.
Membro: Andre Ricardo Oliveira da Fonseca.
3.   2018-Atual. Analise genomica e funcional de metacaspases envolvidas no processo de senescencia induzida por estresse hidrico em monocotiledoneas, com enfase em Setaria italica e Setaria viridis
Descrição: Análise genômica e funcional de metacaspases envolvidas no processo de senescência induzida por estresse hídrico em monocotiledôneas, com ênfase em Setaria italica e Setaria viridis. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Nathalia de Setta - Coordenador / thais Massanet - Integrante / Luciano Freschi - Integrante. Financiador(es): Universidade Federal do ABC - Bolsa.Número de orientações: 1
Membro: Nathalia de Setta Costa.
4.   2018-Atual. Atomistic simulations of electrochemistry
Descrição: In this project (Young Researcher Award) we will study in detail the structure and dynamics of aqueous electrolytes at metallic interfaces including nuclear quantum effects and taking into account the effect of the electrode potential, in the presence of an external bias potential applied to the electrodes. This will be accomplished developing a new computational state-of-the-art framework based on ab initio methodologies, such as Density Functional Theory (DFT), non-equilibrium Green?s functions methods (NEGF) and Path Integral Molecular Dynamic (PIMD) formalism. In this way, we will have a better and more detailed description of the water/metal interface, allowing to predict the correspondence between the macroscopic voltage and the microscopic interfacial charge (re)distribution in electrochemical fuel cells. This project will entail a strong collaboration between experimental and theoretical groups both in the State of São Paulo and the Fritz Haber Institute of the Max Planck Society in Berlin.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . Integrantes: Luana Sucupira Pedroza - Coordenador / ROCHA, ALEXANDRE REILY - Integrante / Mariana Rossi - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Luana Sucupira Pedroza.
5.   2018-Atual. CAPES - PRINT: Desafios da Astrofisica, da Cosmologia e da Gravitacao para o seculo XXI
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maurício Richartz - Integrante / Cecilia Bertoni Martha Hadler Chirenti - Integrante / Vilson Tonin Zanchin - Coordenador / Olexandr Zhidenko - Integrante / Maximiliano Ujevic Tonino - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Outra.
Membro: Mauricio Richartz.
6.   2018-Atual. Coastal biodiversity and public policies: methodologies and actions to integrate stakeholders
Descrição: This proposal addresses interdisciplinary questions to integrate researchers, decision makers and local communities to develop a program for Innovative Public Policies with social relevance for coastal biodiversity conservation. Our main goal is to develop knowledge and skills and support the production of participative public policies built on the visions of a range of different stakeholders. We will use the coastal biodiversity of mangroves, rocky shores and sandy beaches from the Santos and Guarujá region as a model system. The coastal region is an important model area for innovative social public policies in conservation, due its socio-economic and cultural importance within a mosaic of human impacts. We will develop a diagnostic approach to evaluate coastal biodiversity and relevant public policies together with socio-ecological-environmental assessments to evaluate the environmental perception of stakeholders. Based on this, we will develop a citizen science program for coastal biodiversity monitoring to strength stakeholders links to the environment. Finally, to achieve our main goal, we will integrate such actions and knowledge with decision makers to develop an integrative program among stakeholders for productions of new public policies with social and ecological importance. Using an active methodology, we aim to stimulate stakeholders to share their knowledge and identify advances and challenges in the transfer of knowledge and expectations. We also aim to develop their skills and competencies in leadership, planning and ability to work in groups to stimulate the establishment of an innovative social program of public policies that can be expanded for other regions and issues to allow a medium to long term return. This is an opportunity for interdisciplinary capacity development that will benefit human well-being for the next generations, providing best solutions and practices for management and conservation of marine biodiversity and ecosystem services.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Integrante / Ronaldo Adriano Christofoletti - Coordenador / Melissa Vivacqua Rodrigues - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
7.   2018-Atual. Combinatoria e aplicacoes em Bioinformatica, Cientometria, e Computacao Grafica (Projeto dentro do Capes-PrInt)
Descrição: A Ciência da Computação está cada vez mais presente em diversas áreas do conhecimento, fomentando a necessidade de criar novas tecnologias para lidar com problemas crescentemente complexos de diversas áreas da ciência. Tais avanços tecnológicos são possíveis através de resultados teóricos que sustentem a geração de modelos computacionais adaptados aos novos problemas interdisciplinares. Por exemplo, o estudo de estruturas combinatórias tem um papel fundamental no desenvolvimento de algoritmos eficientes para resolver problemas nas áreas de Bioinformática, Cientometria e Computação Gráfica. Em particular, análise de redes complexas, que são grafos com características topológicas não triviais que ocorrem em muitas situações do mundo real, é uma área de pesquisa com diversas aplicações atuais e de interesse público que permite entender desde o comportamento social nas redes até o funcionamento biológico das redes neuronais e de genes e proteínas. Dividimos os objetivos deste projeto em duas frentes: 1) Investigar propriedades estruturais, combinatórias e algorítmicas de grafos e estruturas discretas relacionadas; 2) Aplicar técnicas combinatórias para obter avanços em problemas de Bioinformática, Cientometria e Computação Gráfica. Em Bioinformática, o foco será na inferência, modelagem e simulação de redes de biologia molecular, empregando-se análise de redes complexas, incluindo o desenvolvimento de métodos de detecção de comunidades e padrões estruturais locais que se repetem e que normalmente estão associados a alguma função importante na rede. Já em Cientometria, o foco é na aplicação de conceitos de teoria dos grafos e de redes complexas para análise de redes de pesquisadores, que também envolve busca de comunidades, padrões estruturais locais em grafos e predição de ligações futuras. Finalmente, em Computação Gráfica o objetivo é segmentar imagens e vídeos através da aplicação de grafos Laplacianos construídos a partir das entradas para o problema de segmentação ou co-segmentação. Embora o foco das aplicações seja dado principalmente nas três frentes supracitadas, praticamente todas as áreas da ciência dependem de análise combinatória, mais notadamente: física, química, biologia, engenharias, astronomia, ciências sociais (especialmente análise de redes sociais), dentre outras.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: João Paulo Gois - Coordenador / Daniel Morgato Martin - Integrante / Harlen Costa Batagelo - Integrante / Luiz Carlos da Silva Rozante - Integrante / Fabricio Olivetti de França - Integrante / JESÚS PASCUAL MENA CHALCO - Integrante / SAUL DE CASTRO LEITE - Integrante / DAVID CORRÊA MARTINS JÚNIOR - Integrante / CARLA NEGRI LINTZMAYER - Integrante / CLÁUDIO NOGUEIRA DE MENESES - Integrante / GUILHERME OLIVEIRA MOTA - Integrante / CRISTIANE MARIA SATO - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Joao Paulo Gois.
8.   2018-Atual. Computational Material Science and Chemistry
Descrição: Much of the energy consumed in the world comes from the burning of petroleum-based fossil fuels (oil diesel, gasoline, kerosene for aviation, and liquefied gas). Beyond the fuels to run our modern society, petroleum is also the raw material of an extensive chain of products, e.g., paraffin, asphalt products, petrochemical naphtha, solvents, plastics, etc. Despite the great importance of fossil fuels, there are several reasons for the research of renewable and new alternative energy sources, which includes environmental problems and the fact that petroleum will exhaust in the future. Therefore, there is a great interest in the use of renewable energy resources such as hydroelectric, biomass, offshore/inland wind, photovoltaics, hydrogen, as well as the development of new energy carriers from the conversion of methane or/and from CO2 captured from ar combined with H2 from water splitting. Due to the large demand, we believe that those technologies will be combined in future to yield a sustainable planet with net-zero emissions, however, our Computational Material Science and Chemistry (CMSC) Division will focus only on few of those pathways. We believe strongly that among all those energy sources, four pathways should be followed, namely, $(i)$ photons to electrons using photovoltaics devices as photovoltaics is expected to contribute with about \SI{30}{\percent} (Shell report) for our energy matrix in future, $(ii)$ energy storage using batteries and ultra(super)capacitors to support inland/offshore wind energy growth, $(iii)$ CO2 capture and conversion to value-added products -- methanol, gasoline-range hydrocarbons, which can provide a crucial role to our future as an environmental problem can be part of the solution, $(iv)$ methane conversion to high density liquid carriers -- methanol, etc, which is expected to play an important role due the large supply of natural gas world-wide. To address those problems, we propose to employ the state-of-the-art in ComputationalMaterial Science tools to deliver cutting-edge solutions. For practical organization, we propose nine projects, which includes two projects for photons to electrons conversion based on photovoltaics (in particular perovskites) and photochemistry, two projects to study the conversion of methane and CO2 captured from air to high-value products such as high density energy carriers (methanol) employing porous materials combined with transition-metal finite size particles. For energy storage, we explore batteries and ultra(super)capacitors, in particular, we are interested in beyond-Li technologies and employing cheap ionic conductors. Beyond of the six projects, we proposed three cross-boundary projects with the potential to contribute to the previous six projects, as well as to provide their on solo contribution, which includes: nanocatalysts engineering, fluid dynamics to address the flow of ionic liquids, and machine learning techniques, which will be applied to explore theoretical and experimental data from the remaining three Divisions. Therefore, our Division combined with the additional three Center Divisions have a great potential to yield important contributions to the generation of New Energies.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (5) . Integrantes: Ronaldo Cristiano Prati - Coordenador / André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho - Integrante / Gustavo Enrique Almeida Prado Alves Batista - Integrante / Juarez Lopes Ferreira da Silva - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / BG E P Brasil - Auxílio financeiro.
Membro: Ronaldo Cristiano Prati.
9.   2018-Atual. Educacao ambiental e ensino de biodiversidade
Descrição: Projetos de iniciação científica, mestrado e doutorado relacionados com a reflexão sobre estratégias de ensino e aprendizagem de biodiversidade em diferentes espaços de ensino, bem como de educação ambiental. A pesquisa com formação de professores com este enfoque também é objetivo deste projeto.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Coordenador / Gesrael Silva de Lima - Integrante / Flávia Marques - Integrante / Sandra Félix Santos - Integrante / Vivian Tadima Cazeta - Integrante. Número de produções C, T A: 3 / Número de orientações: 1
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
10.   2018-2021. Espalhamento ondulatorio: Buracos Negros Extremos e Modelos Analogos de Gravitacao
Descrição: Bolsa de produtividade em pesquisa do CNPq. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maurício Richartz - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Mauricio Richartz.
11.   2018-Atual. Estudo das propriedades eletronicas de corantes
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Ronei Miotto - Coordenador / Cassiano Minoru Aono - Integrante / Ariel Magalhães Bellio - Integrante. Número de produções C, T A: 1
Membro: Ronei Miotto.
12.   2018-Atual. Ferramentas clinicas para o auxilio ao diagnostico e prognostico de doencas vasculares cerebrais
Descrição: O trabalho de cooperação foca no desenvolvimento de ferramentas clínicas para o auxílio ao diagnóstico e prognóstico de doenças vasculares cerebrais. Serão abordados três tópicos relacionados: 1- Efeitos do posicionamento de stents desviadores de fluxo (FDS) próximo de perfuradores 2- Ferramenta computacional de auxílio ao prognóstico de pacientes com AVC 3-Avaliação e caracterização por imagens de ressonância magnética nuclear da composição de trombos em pacientes com AVC. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Fernando Silva de Moura - Integrante / Diogo Soriano - Integrante / Tiago Ribeiro de Oliveira - Coordenador. Financiador(es): Association des Professionnels de l'Hémodynamique Cérébrale - Auxílio financeiro.
Membro: Fernando Silva de Moura.
13.   2018-2020. Fotossensibilizadores: estudos de propriedades fundamentais e aplicacoes biologicas
Descrição: Este projeto pretende dar continuidade aos trabalhos iniciados com o projeto temático "Fotossensibilização nas Ciências da Vida" e manter a colaboração com pesquisadores experimentais e também da área de simulação computacional no desenvolvimento de fotossensibilizadores, visando principalmente a terapia fotodinâmica. Serão empregados métodos baseados na teoria do funcional da densidade para estudar os estados fundamental, excitado e oxidado de compostos trifenilimidazólicos, macrocíclicos do tipo ftalocianina, bem como tiazinas, fenotiazinas e xantenos. Procuraremos enteder propriedades que envolvem os estados excitados, como transferência de próton intramolecular e transferência de energia ou elétron para formação de oxigênio singlete. Serão realizados também estudos sobre a ação de fenotiazinas no escuro, de forma a complementar o entendimento sobre os mecanismos de ação desses compostos em tratamentos contra o câncer.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Paula Homem-de-Mello - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Paula Homem-de-Mello.
14.   2018-2020. Generalizacao e Aplicacoes do Tipo de Dado Algebrico Interacao-Transformacao
Descrição: O Tipo de Dado Algébrico Interação-Transformação é uma nova representação para o problema de regressão simbólica que restringe o espaço de busca para compreender apenas expressões simples e válidas. Foi criado como um meio termo entre a simplicidade de modelos lineares e o poder de aproximação de modelos caixa-preta. Este projeto tem o objetivo de generalizar essa representação para outras aplicações, expandir seu espaço de busca e empregar os algoritmos relacionado em aplicações reais.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . Integrantes: Fabricio Olivetti de França - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Fabricio Olivetti de Franca.
15.   2018-Atual. Materiais avancados: estudos fundamentais e aplicados
Descrição: Este projeto tem como objetivo principal o fortalecimento de colaborações internacionais relacionado à temática de nanociências e nanotecnologia. Por ser uma área interdisciplinar, serão realizadas pesquisas envolvendo síntese, caracterização de propriedades físicas/químicas e simulação computacional de diversos materiais com forte apelo científico e tecnológico. Os materiais alvo de estudo - tanto na escala nanométrica como bulk - serão perovskitas; biocompósitos; isolantes topológicos; materiais super/semicondutores, termoelétricos e magnéticos; compostos biomiméticos automontados; compostos e ligas mono-, poli- e nanocristalinas; nanocompósitos; materiais cerâmicos, vítreos e poliméricos. Destacamos o interesse nos chamados ?materiais inteligentes?, que apresentam propriedades elétricas como condutividade, blindagem eletromagnética, atuação eletromecânica, além das propriedades típicas de materiais poliméricos, como por exemplo a flexibilidade e baixa densidade. O projeto abrange amplo espectro de aplicações tecnológicas relacionadas à energia limpa, spintrônica, armazenamento e exibição de informações, fármacos, dispositivos eletrônicos, células solares e fotoeletroquímicas, biossensores, armazenamento de hidrogênio, entre outros. Os materiais sintetizados serão estudados com ferramentas experimentais e teóricas tais como técnicas de raios X, espectroscopia vibracional, espectroscopia ultrarrápida, microscopia eletrônica, magnetização, fotônica, transporte elétrico e térmico; métodos clássicos e quânticos de simulação computacional de materiais. Intrinsecamente, este projeto irá estimular a interação entre discentes e docentes orientadores dos grupos envolvidos por meio do intercâmbio com as instituições internacionais. A síntese, caracterização e simulação de materiais é de natureza interdisciplinar e atua nas interfaces entre a física, química e biologia. Os grupos com os quais os pesquisadores interagem no exterior são líderes nas técnicas propostas. Os projetos específicos que serão desenvolvidos estão vinculados aos projetos aprovados pela FAPESP e CNPq para as bolsas de produtividade em pesquisa de todos os membros do projeto. Por meio das interações locais e internacionais, contribuiremos para a formação de recursos humanos altamente qualificados (mestres e doutores), e o avanço do conhecimento científico e inovação tecnológica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / WENDEL ANDRADE ALVES - Integrante / JOSÉ A. SOUZA - Integrante / FLÁVIO LEANDRO SOUZA - Integrante / HERCULANO DA SILVA MARTINHO - Integrante / Marcos A. Avila - Integrante / Gustavo Martini Dalpian - Integrante / Adalberto Fazzio - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
16.   2018-2018. Modos quasinormais de um buraco negro hidrodinamico
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maurício Richartz - Coordenador / Silke Weinfurtner - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Mauricio Richartz.
17.   2018-2020. Molecular Dynamics Simulations of Advanced Materials Consolidated by Cold Spray Additive Manufacturing
Descrição: The aim of the ongoing FAPESP project is to investigate in a fundamental level aspects of plastic deformation in metallic materials at the nanoscale employing computational techniques. Cold spray (CS) is a high rate material deposition technique used to produce metallic coatings from micron-size feedstock powder particles. In CS, the powder particles are accelerated to achieve high impact velocities (up to 1000 m/s) upon the surface to be coated by means of a supersonic inert gas flow generated using a DeLaval nozzle. Upon impact with the substrate, the particles plastically deform as a results of shear adiabatic instability induced locally by the high strain rates (109 1/s). CS experiments have been carried in the group of Prof. Bertrand Jodoin at uOttawa for the past two decades. To reach the required level of understanding of the impact deformation process mechanisms occurring in CS, we propose a more fundamental and universal approach through molecular dynamics (MD) simulations combined with validation using experimental results. MD will allow a better understanding of the adiabatic shear instability, amongst other phenomena, at the atomic level.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Roberto Gomes de Aguiar Veiga - Coordenador / Alejandro Andres Zuniga Paez - Integrante / Bertrand Jodoin - Integrante / Saeed Rahmati - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação.
Membro: Roberto Gomes de Aguiar Veiga.
18.   2018-Atual. Prospeccao de genes candidatos ao melhoramento voltado a tolerancia ao estresse abiotico em gramineas.
Descrição: Gramíneas monocotiledôneas são a principal fonte de nutrição humana e pesquisas sobre o melhoramento desse grupo são de importância crítica na segurança alimentar. Entre as principais gramíneas cultivadas no mundo, podemos destacar milho, trigo, cana-de-açúcar e arroz. Dado o cenário atual das mudanças climáticas, é esperado um aumento das temperaturas globais e taxas de CO2, modificação nos regimes de precipitação e na ocorrência de pragas. Essas mudanças terão sérios impactos nas quatro dimensões da segurança alimentar, sendo que seus efeitos já estão sendo sentidos nos mercados globais de alimentos. Neste contexto, a pesquisa em melhoramento genético vegetal tem trabalhado para gerar plantas mais tolerantes a estresses como seca e altas temperaturas; sendo que o primeiro passo para o processo de melhoramento é a seleção de genes candidatos a serem modificados. Este projeto de pesquisa tem como objetivo realizar estudos genômicos de larga escala em famílias gênicas vegetais, focando na seleção e caracterização de potenciais genes candidatos ao melhoramento para estresse abiótico em gramíneas. Para isso, serão empregadas as seguintes metodologias: (i) mineração gênica e dos perfis de expressão in silico em bases de dados genômicas, (ii) caracterização das estruturas e diversidade gênicas, (iii) busca in silico por localização subcelular proteica e (iv) estudo das relações de ortologia entre genes de espécies modelo e alvo. A seleção das famílias gênicas a serem estudadas será realizada posteriormente, de acordo com o background teórico em vigor e possíveis colaborações com empresas e instituições de pesquisas públicas, com o objetivo de maximizar a aplicação dos resultados no desenvolvimento de ferramentas para a pesquisa inovativa voltada à cadeia produtiva agrícola.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Nathalia de Setta - Coordenador / Hana Paula Masuda - Integrante / Danilo da Cruz Centeno - Integrante / WAGNER RODRIGO DE SOUZA - Integrante / Fernanda Dias da Silva - Integrante / Silvia Ribeiro de Souza - Integrante. Número de orientações: 2
Membro: Nathalia de Setta Costa.
19.   2018-Atual. Transferencia de calor por conveccao natural: experimentos e simulacao numerica
Descrição: A remoção do excesso de calor de sistemas eletrônicos é essencial. Temperaturas elevadas, que excedem as especificações do projeto, podem resultar em falhas catastróficas, como derretimento, vaporização ou mesmo combustão de materiais de embalagem de baixa temperatura. Portanto, a longa vida útil de um componente e o desempenho confiável podem ser alcançados quando a temperatura de operação de um dispositivo é controlada. O resfriamento por convecção natural continua sendo uma das técnicas de controle térmico para sistemas eletrônicos. Este método é um mecanismo passivo e intrinsecamente confiável, possui baixo custo de manutenção e é livre de ruídos, sendo amplamente aplicável em sistemas eletrônicos que utilizam dispositivos de baixo consumo de energia. Esse projeto propõe estudar experimentalmente e numericamente a transferência de calor por convecção natural e radiação de pacotes eletrônicos em placa em meio infinito, em canais, orientados verticalmente e horizontalmente, em diferentes arranjos de dissipadores, buscando o melhor desempenho térmico.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: André Damiani Rocha - Coordenador / Marcelo Moreira Ganzarolli - Integrante / Henrique Lopes de Castro - Integrante.
Membro: Andre Damiani Rocha.

2017

1.   2017-2020. Analise de sensibilidade e otimizacao do desempenho termo-hidraulico de coletores solares planos para aquecimento de ar atraves da utilizacao de geradores de vortices longitudinais
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: André Damiani Rocha - Integrante / Daniel Dezan - Coordenador / Wallace Gusmão Ferreira - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Andre Damiani Rocha.
2.   2017-2019. Avaliacao de compostos de polipiridinicos Ru(II) e Re(I) em dispositivos fotoativos
Descrição: Sensores luminescentes, dispositivos emissores de luz, sistemas conversores de luz em energia elétrica ou química normalmente são baseados em compostos de coordenação pois eles permitem a modulação das suas propriedades, como a absorção de luz, os potenciais redox e a sua fotorreatividade, através de modificações nas suas estruturas. Estes compostos são muito interessantes para uso no desenvolvimento de sistemas de conversão de energia solar diretamente em eletricidade ou em energia química. Compostos tris-heterolépticos de rutênio(II) já vem sendo investigados no nosso grupo de pesquisa e, neste projeto, propõe-se a avaliação sistemática da influência da extensão da conjugação de grupos substituintes da fenantrolina, com foco principal no seu efeito na eficiência de injeção de elétrons através do estado excitado tripleto. Compostos de polipiridínicos de rênio(I) são muito usados nas investigações sobre a fotorredução de CO2. Isso se deve principalmente ao fato destes compostos atuarem simultaneamente como fotossensibilizador e catalisador para esse processo. Nesse contexto, é foco deste projeto, inserir o grupo de pesquisas nesta área e usar conceitos de engenharia molecular para obter compostos polipiridínicos de rênio(I) que demonstrem maior capacidade de captar a luz solar e converter o CO2 em produtos de maior conteúdo energético. Também é foco deste projeto investigar os mecanismos envolvidos em ambos os processos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: André Sarto Polo - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Andre Sarto Polo.
3.   2017-2019. Avaliacao demografica, genetica e sanitaria da queixada (Tayassu pecari), uma especie-chave e ameacada, em dois dos seus ultimos locais de ocorrencia na Mata Atlantica
Descrição: Queixadas (Tayassu pecari) são fundamentais na dinâmica de regeneração de florestas neotropicais. Vivem em bandos de dezenas a centenas de indivíduos e criam padrões de distúrbio e regeneração na floresta de escala e intensidade que são únicas desta espécie. São altamente vulneráveis à caça e à fragmentação, restando pouquíssimas populações de queixada na Mata Atlântica. Destas, pouco se sabe sobre seu status demográfico, genético e sanitário. O presente estudo irá amostrar populações remanescentes de queixadas em duas áreas de Mata Atlântica (Parque Estadual Ilha do Cardoso e Parque Estadual da Serra do Mar ? Núcleo Santa Virgínia) com objetivo de responder às seguintes perguntas: (1) Qual é o tamanho populacional (de censo e efetivo) e a densidade em cada área estudada? (2) As duas populações encontram-se diferenciadas geneticamente? Se sim, essa diferenciação é histórica ou recente? (3) Qual o grau de diversidade genética das duas populações estudadas? (4) Essas populações passaram por gargalos populacionais recentes? (5) Existe evidência significativa de endogamia para tais populações? (6) Quais os patógenos presentes nas duas populações e suas respectivas prevalências? Para tanto, utilizaremos técnicas modernas de biologia molecular para estimativas de tamanho/densidade populacional e diversidade genética; e técnicas diagnósticas sorológicas, moleculares e epidemiológicas para avaliação do risco sanitário. O presente estudo proporcionará melhor compreensão da situação das populações de uma espécie-chave e criticamente ameaçada em uma das últimas regiões de Mata Atlântica protegida e contínua onde a espécie ainda ocorre, fornecendo dados importantes para sua conservação.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . Integrantes: Cibele Biondo - Coordenador / Mauro Galetti - Integrante / Maria Luisa da Silva Pinto Jorge - Integrante / Fernanda de Góes Maciel - Integrante / RAPOSO DO AMARAL, FÁBIO - Integrante / Anna Carolina Russo Curbelo Martin - Integrante / Marcos Bryan Heinemann - Integrante / Marcello Schiavo Nardi - Integrante.
Membro: Cibele Biondo.
4.   2017-Atual. Caracterizacao de elementos promotores responsivos ao auto-indutor de quorum sensing (QS) tipo 2 (AI-2) em Zymomonas mobilis
Descrição: A bactéria Gram-negativa Zymomonas mobilis apresenta diversas características que a tornam atrativa para a produção industrial de diferentes bioprodutos, incluindo o bioetanol. Por exemplo, Z. mobilis pode ser cultivada tanto em condições aeróbicas como anaeróbicas, é capaz de converter glicose a etanol com uma eficiência ainda maior do que a própria Saccharomyces cerevisiae e tolera maiores concentrações deste álcool durante o processo de fermentação. Além disso, técnicas de manipulação genética foram desenvolvidas para esta bactéria, que vem sendo modificada geneticamente e/ou adaptada para produzir diversos produtos de alto valor agregado (como levano, sorbitol, lactato, polihidroxibutirato e 2,3-butanodiol, entre outros), além de incorporar fontes alternativas de carbono às suas vias metabólicas, como as pentoses xilose e arabinose. Dessa forma, Z. mobilis vem sendo vista como um microrganismo de grande potencial para a indústria de bioconversão e um melhor entendimento acerca dos mecanismos por ela utilizados para o controle de sua expressão gênica pode auxiliar no desenvolvimento de novas linhagens geneticamente manipuladas, com elevada capacidade de produção industrial. Nesse sentido, foi demonstrado recentemente que Z. mobilis é capaz de responder ao indutor de quorum sensing (QS) do tipo 2 (denominado auto-indutor 2, ou AI-2). O AI-2 é uma das moléculas utilizadas por bactérias para controlar o processo de QS, responsável por avaliar a densidade populacional do meio e sincronizar seu comportamento em escala comunitária. A ativação da resposta QS leva à diminuição no ritmo de crescimento celular, ao mesmo tempo em que ativa a expressão de genes envolvidos com uma série de atividades alternativas. Nesse sentido, se genes de interesse industrial forem incorporados ao genoma de Z. mobilis, sob o controle de promotores responsivos a AI-2, seria possível induzir sua expressão de maneira controlada, através da adição deste sinalizador às culturas, já que Z. mobilis, embora sensível a AI-2, não é capaz de sintetizá-lo. Dessa forma, o projeto aqui proposto tem por objetivo caracterizar a resposta de Z. mobilis ao sinalizador de QS AI-2, identificando os genes/operons que têm sua expressão modulada em resposta a esta molécula, bem como os elementos cis-ativadores (promotores) e trans-ativadores (fatores de transcrição) que medeiam este processo. Estes estudos levarão ao isolamento e compreensão acerca do funcionamento dos primeiros promotores indutíveis em Z. mobilis, que poderão ser desenvolvidos (e futuramente patenteados) em uma importante ferramenta para a manipulação desta bactéria, com amplas possibilidades de aplicação na indústria de bioprocessamento, já que permitirá a expressão de transgenes nesta bactéria, sob situações controladas e otimizadas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Luiz Roberto Nunes - Coordenador / Ivarne Tersariol - Integrante / Valquíria Campos Alencar - Integrante / Fabiano Bezerra Menegidio - Integrante / COSTA DE OLIVEIRA, REGINA LÚCIA BATISTA DA - Integrante / Renata Ozelami Vilas Boas - Integrante / Juliana de Fátima Santos Silva - Integrante / Adrian Robert Walmsley - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Luiz Roberto Nunes.
5.   2017-Atual. Caracterizacao Espectroscopica de novos Fotossensibilizadores derivados de Fenotiazina
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Hueder Paulo Moisés de Oliveira - Coordenador / Melissa de Carvalho Santos - Integrante.
Membro: Hueder Paulo Moises de Oliveira.
6.   2017-2020. Criacao do nucleo de estudos em agroecologia e producao organica da Universidade Federal do ABC (NEA-UFABC)
Descrição: O NEA-UFABC desenvolverá as principais atividades descritas, em parceria com órgãos governamentais, agentes de extensão rural e social, organizações não governamentais de agroecologia, produção orgânica, desenvolvimento sustentável, e consumo solidário, por meio de: 1. Instalação do NEA-UFABC e capacitação interna dos profissionais do NEA (capacitação interna): Necessárias para a estruturação do Núcleo em implantação. 2. Organização da Rede NEA: Necessária para a integração do novo núcleo aos demais já instalados e em instalação, para troca de experiências e divulgação das respectivas programações de atividades. 3. Ações de extensão e capacitação, por meio da oferta dos cursos, oficinas e palestras em agroecologia, produção orgânica e tecnologias agrosustentáveis: Trata-se de uma das atividades centrais do núcleo, que deverá envolver a comunidade acadêmica e de produtores em transição agroecológica, técnicos de ATER e de assistência dos municípios e público em geral, com ênfase para o desenvolvimento das práticas nas unidades produtivas da região. 4. Eventos em Agroecologia: Farão parte da Semana de Ciência e Tecnologia da UFABC e servirão de momentos de síntese dos conhecimentos sistematizados pelo núcleo e de troca de experiências com outros sujeitos envolvidos no desenvolvimento da agroecologia e da produção orgânica. 5. Atividades de Pesquisa-Ação e publicações científicas: Se dividem em duas grandes linhas de pesquisa: I) Tecnologia agroecológica para produção, recuperação e conservação de remanescentes florestais rurais, periurbanos e urbanos e II) Agroecologia, consumo e políticas públicas. 6. Ações de Educação e Educação Ambiental: Pensadas estrategicamente para aproximar agentes da educação formal do tema da agroecologia e a população do entorno da UFABC. 7. Socialização do conhecimento e divulgação técnico-científica: Estratégias de difusão do conhecimento e dos saberes científicos e populares, através da produção de material didático e midiático. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Integrante / Simone Rodrigues de Freitas - Integrante / Tiago Fernandes Carrijo - Integrante / Dácio Roberto Matheus - Coordenador / Michelle Sato Frigo - Integrante / Roberta Maia - Integrante / Vanessa Empinotti - Integrante / Leonardo Freire de Mello - Integrante / Luciana Travassos - Integrante / Silvia Titotto - Integrante / Leandro Reverberi Tambosi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
7.   2017-Atual. Desenvolvimento de espectrometro do tipo TOF-MS e tecnicas de coincidencia eletron-ion aplicadas na investigacao de sistemas atomicos e moleculares
Descrição: O projeto científico proposto tem como base o desenvolvimento e aplicações de um sistema experimental de espectroscopia eletrônica, envolvendo a técnica experimental de espectrometria de massas por tempo de voo (TOF-MS) [1] e técnicas de coincidência elétron-íon [2-9], e uso de radiação eletromagnética na faixa desde o ultravioleta de vácuo até raios-x, visando estudos avançados de sistemas atômicos e moleculares de interesse químico, biológico, tecnológico e industrial. Esta proposta de pesquisa visa o desenvolvimento e construção de um espectrômetro de massas do tipo TOF-MS, não convencional, para estudo dos processos de excitação eletrônica, fotoionização, e dinâmica de dissociação de moléculas poliatômicas, baseado nas técnicas experimentais de coincidência elétron-íon, tais como: PEPICO (PhotoElectron PhotoIon COincidence), TPEPICO, PEPIPICO.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Alexsandre Figueiredo Lago - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Alexsandre Figueiredo Lago.
8.   2017-2020. Desenvolvimento de materiais organicos e hibridos para sistemas fotovoltaicos
Descrição: É proposto o desenvolvimento de sistemas orgânicos e híbridos do tipo hóspede-hospedeiro para camadas ativas de sistemas fotovoltáicos. Para tanto, serão investigados heterojunções de oligômeros de baixo gap ótico com fulerenos incorporados em organo-sílicas mesoporosas através de um estudo correlacionado: estrutural, de propriedades eletro-óticas e por modelagem computacional e cálculos quânticos. É dado ênfase ao design de novas matrizes mesoporosas preparadas por metodologia sol-gel que via organo-modificações e a inserção de líquido iônicos possam ter funcionalidades específicas, como de transporte de cargas, e que favoreçam a incorporação e a formações de heterojunções das espécies ativas baseadas na interação hóspede-hospedeiro. Será realizada a análise das mudanças estruturais e das propriedades óticas através do estudo das espécies ativas em função do ambiente químico, ou seja; isoladas (ou dispersas em ambiente inerte), sob efeito de solvatação e incorporadas na matriz hospedeira. Serão utilizadas diversas técnicas de caracterização, em particular, técnicas de espectroscopia ótica e de ressonância magnética nuclear (RMN) de alta resolução em estado sólido. Complementarmente, serão realizados estudos teóricos por dinâmica molecular e por teoria do funcional da densidade com especial atenção a efeitos de solvatação e de interações intermoleculares, utilizando-se funcionais que possuem correção assintótica do potencial e que incorporem efeitos de blidagem dielétrica. Dessa forma, este projeto pretende-se relevante tanto do ponto de vista científico como tecnológico.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Thiago Branquinho de Queiroz - Coordenador.
Membro: Thiago Branquinho de Queiroz.
9.   2017-Atual. Estimativa do potencial de recrutamento alveolar atraves da tomografia por impedancia eletrica
Descrição: O projeto pretende desenvolver um método para estimar e quantificar o potencial de recrutamento alveolar, sem que seja necessária a realização de uma manobra de recrutamento alveolar padrão, minimizando assim a VILI. Tal estratégia será baseada em imagens de TIE, para a detecção de regiões com colapso ou hiperdistensão.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Fernando Silva de Moura - Integrante / AA-erick camargo - Coordenador / AA-marcelo Amato - Integrante / Roberta Ribeiro de Santis Santiago - Integrante.
Membro: Fernando Silva de Moura.
10.   2017-Atual. Evolucao de orquideas Neotropicais sob a optica da citogenetica, filogenia e biogeografia
Descrição: A biodiversidade dos Neotrópicos oferece oportunidades valiosas para estudos evolutivos. A partir de estudos na família Orchidaceae, subtribo Maxillariinae, e contando com uma rede de pesquisadores de diferentes espertises, pretendemos obter um melhor panorama das tendências evolutivas. A primeira fase deste projeto (FAPESP-JP1) visou superar alguns desafios, como a integração da ecologia-citogenética-tamanho do genoma, mas é necessário um novo passo: considerar plenamente a ecologia vegetal ao estudar hibridação e poliploidia. Considerando a reorganização genômica (das sequências e do padrão epigenético) que ocorre após a hibridação e poliploidia, todo o desenvolvimento da planta pode ser afetado. Portanto, todos os sinais que a planta usa para se comunicar com outros organismos podem ser afetados e como a mudança nesses sinais participa na delimitação das fronteiras das espécies híbridas e no estabelecimento de novas barreiras reprodutivas precisa ser explorado. Todos os nossos estudos contam com uma hipótese filogenética, permitindo que os resultados sejam interpretados dentro do contexto evolutivo. Entretanto, a partir de novos estudos de sistemática, geralmente surgem novas dúvidas. Aqui, pretendemos usar técnicas complementares para estudar alguns gêneros parafiléticos de orquídeas, compondo a segunda grande área do projeto. Como as sequências repetitivas são gênero ou espécie específicas, seu uso poderia somar novas informações. Tais abordagens se beneficiam da popularização de técnicas de sequenciamento, também entre plantas não-modelo. Estas duas grandes áreas, a integração da hibridação e ecologia e a sistemática das Orchidaceae serão abordadas com o objetivo de obter novos insights sobre a evolução das plantas neotropicais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Ana Paula de Moraes - Coordenador / Eliana Forni-Martins - Integrante / Guerra, Marcelo - Integrante / Thaíssa B J Engel - Integrante / FELIX, LEONARDO P. - Integrante / Juliano S. Cabral - Integrante / Thayná Guerra - Integrante / Laura Mota - Integrante / Eduardo Catharino - Integrante.
Membro: Ana Paula de Moraes.
11.   2017-2017. Gravitational Waves from hairy black holes
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Maurício Richartz - Coordenador / Emanuele Berti - Integrante. Financiador(es): Fulbright Comissão para o Intercâmbio entre os Estados Unidos e o Brasil - Bolsa.
Membro: Mauricio Richartz.
12.   2017-Atual. Intelligent Traps and Sensors: an Innovative Approach to Control Insect Pests and Disease Vectors
Descrição: Insects are undoubtedly important to agriculture, the environment and human health. Many insect species are beneficial to the environment and humans. For example, insects are responsible for pollinating at least two-thirds of all food consumed in the world. Due to its importance to humans, the recent decline in populations of pollinator insects, especially bees, is considered a serious environmental problem; frequently associated with pesticide exposure. In contrast, insect pests destroy over 40 billion U.S. dollars worth of food each year and vectors are responsible for spreading diseases that kill over one million people annually, such as malaria, dengue and chikungunya fevers and zika virus. In this project, we propose an intelligent trap that captures harmful insect species. Such a trap uses a sensor that we have developed over the last years to automatically recognize insect species using wingbeat data. The insect recognition will allow the creation of real-time insect density maps that can be used to support local interventions. For instance, in the case of insect pests, these maps will allow more local use of insecticides and, therefore, a reduced impact over the environment. In the case of disease vectors, this trap will make some sophisticated but highly costly interventions, such as SIT (Sterile Insect Technique), more cost-effective. In this project, we show how this real application can expand the limits of the state-of-the-art research in Computer Science, particularly in Machine Learning and Data Stream Mining areas. In order to demonstrate the practical aspects of our proposal, we will concentrate in the identification of two species: the Asian citrus psyllid, vector of greening, a terrible citrus disease and the Aedes aegypti vector of dengue, chikungunya and yellow fevers, as well as, the zika virus, recently associated with cases of microcephaly in newborns.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . Integrantes: Ronaldo Cristiano Prati - Integrante / Gustavo Enrique Almeida Prado Alves Batista - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Ronaldo Cristiano Prati.
13.   2017-Atual. Interfaces em materiais: propriedades eletronicas, magneticas, estruturais e de transporte
Descrição: Projeto Temático FAPESP, 17/02317-2. A pesquisa na área de materiais tem avançado nos últimos anos, partindo de um enfoque basicamente aplicado, e relacionado à Engenharia, até a posição ocupada hoje onde tem grande impacto em outras áreas, incluindo a Física, Química e Biologia. Isto ocorre em grande parte pelos avanços tecnológicos que nos tem permitido estudar e manipular a matéria em escala atômica e molecular. Este projeto pretende atuar neste nicho, desvendando as propriedades de materiais, procurando por novos materiais e desenvolvendo metodologias avançadas para o tratamento e entendimento destes. O projeto focará principalmente nas propriedades de superfícies e interfaces, estudando fenômenos emergentes. Destacamos dentre esses materiais e propriedades: 1) o estudo de isolantes topológicos quando em interface com outros materiais; 2) o estudo da interface entre sólidos e líquidos, com aplicações em energia, como fotoeletroquímica e física do petróleo; 3) o estudo de materiais bidimensionais quando em contato com outros materiais incluindo biomoléculas; 4) o estudo de propriedades ópticas em interfaces de heteroestruturas, principalmente de materiais 2D com foco no desenho de células fotovoltaicas de próxima geração. Nesta proposta teórico/experimental utilizaremos técnicas do estado da arte. Do ponto de vista teórico a Engenharia de Materiais será obtida por meio de técnicas de big data em Ciência de Materiais, que inclui a utilização dos grandes repositórios de materiais e o desenvolvimento de códigos do tipo "high throughtput", varrendo diferentes famílias de materiais. A partir de candidatos selecionados refinaremos os estudos utilizando combinações de métodos quânticos e clássicos. Estas interfaces também serão estudadas por meio de técnicas de síntese de nano e microestruturas de materiais semicondutores e magnéticos e ligação de biomoléculas e moléculas orgânicas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Gustavo Martini Dalpian - Integrante / Adalberto Fazzio - Coordenador / Antonio José Roque da Silva - Integrante / Wendel Andrade Alves - Integrante / Alexandre Reily Rocha - Integrante / Flávio Leandro de Souza - Integrante / Caetano Rodrigues Miranda - Integrante / Jose Antônio Souza - Integrante / Iseli Lourenço Nantes - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Gustavo Martini Dalpian.
14.   2017-Atual. METABOLOEPIGENETICA: O ESTUDO DO DESENVOLVIMENTO DE EMBRIOES BOVINOS SOB UMA NOVA OTICA
Descrição: Os efeitos do sistema in vitro no desenvolvimento do embrião pré-implantacional são determinantes na sua viabilidade e sucesso pós transferência. Modificações neste sistema têm sido sugeridas, em especial em relação ao incremento do metabolismo energético pela modulação de substratos como glicose, piruvato e diversos aminoácidos. No entanto, o impacto dessas suplementações podem estar para além da geração de ATP. Durante as primeiras clivagens, o embrião utiliza principalmente o piruvato e em certa medida lactato, glutamina e aspartato para gerar energia e possui capacidade limitada de metabolizar glicose. A demanda energética é aumentada com a ativação do genoma embrionário, fazendo com que o embrião passe a metabolizar glicose com maior eficiência, em especial pela maior atividade da via glicolítica. A partir dessa via, piruvato é produzido, convertido a acetil-CoA e direcionado ao ciclo do ácido tricarboxílico. Entre outros intermediários, o ciclo do TCA gera citrato que poderá, fora da mitocôndria, ser novamente convertido a acetil-CoA, fornecendo precursores para a síntese de lipídeos. Já foi demonstrado também que esse mesmo acetil-CoA pode desviar sua rota e servir de precursor para a acetilação das histonas, modificando o padrão de transcrição gênica global da célula. Assim, a hipótese deste presente trabalho é que a modulação farmacológica da via glicolítica em embriões de bovinos produzido in vitro pode levar a diferentes perfis de geração de citrato e acetil-CoA, interferindo no padrão de acetilação de histonas, alterando assim o seu perfil metabólico e a potência das células do blastocisto.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (4) . Integrantes: Marcella Pecora Milazzotto - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Marcella Pecora Milazzotto.
15.   2017-Atual. Smart Water Management Platform (SWAMP)
Descrição: The SWAMP project develops IoT based methods and approaches for smart water management in precision irrigation domain, and pilots them in Italy, Spain, and Brazil (2). Water is vital for ensuring food security to the world?s population, and agriculture is the biggest consumer amounting for 70% of freshwater. The water wastages are caused mainly by leakages in distribution and irrigation systems, and in the field application methods. The most common technique, surface irrigation wastes a high percentage of the water by wetting areas where no plants benefit from it. Localized irrigation can use water more efficiently and effectively, avoiding both under-irrigation and over-irrigation. However, in an attempt to avoid under-irrigation, farmers feed more water than is needed resulting not only to productivity losses, but also water is wasted. Therefore, technology should be developed and deployed for sensing the level of water needed by the plantation and for flowing the water to places where and when needed. The SWAMP project addresses these issues by use of the Internet of Things (IoT), data analytics, autonomous devices and other related technologies. The challenges addressed by SWAMP project are following: 1) Reducing effort in software development for IoT-based smart applications. 2) Automating advanced platforms and integrating different technologies and components. 3) The integration of heterogeneous and advanced sensors, particularly flying sensors (drones) providing precision in the water supply for irrigation. 4) The use of a Software Platform together with technologies such as IoT, Big Data, Cloud/Fog and drones for the deployment of pilot applications for smart water management. 5) Proposing, testing and validating new business models for using IoT in smart water management settings. 6) Technological components must be flexible and adaptable enough in order to adapt to different contexts and to be replicable to different locations and contexts.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (4) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . Integrantes: Ronaldo Cristiano Prati - Integrante / Carlos Alberto Kamienski - Coordenador / João Henrique Kleinschmidt - Integrante. Financiador(es): Rede Nacional de Ensino e Pesquisa - Auxílio financeiro / Comissão Européia - Auxílio financeiro.
Membro: Ronaldo Cristiano Prati.
16.   2017-Atual. Uso de Estatistica Fractal na Busca de Parametros Estruturais em Grupos de Estrelas Jovens
Descrição: Pretende-se fazer uma análise de uma grande amostra de aglomerados (clusters) de estrelas jovens com o intuito de investigar as propriedades inerentes ao agrupamento e evolução dinâmica das componentes estelares. Em especial, o parâmetro estatístico Q medido para os grupos estelares, e suas correlações com a dimensão fractal estimada para as nuvens próximas projetadas. Em trabalhos anteriores, medimos o parâmetro Q para um conjunto de 25 aglomerados estelares e os resultados foram correlacionados com outras propriedades das distribuições espaciais determinadas por meio do perfil de King e mostram que quase metade desses grupos apresenta uma relação com a dimensão fractal de sua nuvem parental. Também há indicações da presença de subestruturas semelhantes às observadas nas nuvens vizinhas. No entanto, outros aglomerados estelares apresentam uma distribuição radial que não coincide com a estrutura das nuvens. Estas propriedades podem levar a conclusões sobre as condições iniciais de formação de grupos estelares (colapso frio ou colapso quente), evolução inicial (ligada ou não) e sua evolução dinâmica galáctica esperada (crossing time). Esses estudos poderão nos dar informações sobre a história da influência da Galáxia sobre os grupos estelares e como estes foram afetados por sua passagem pelas suas estruturas. Além disso, pretende-se estudar a aplicação de novas técnicas matemáticas e numéricas com potencialidade para uso em modelos de estruturas filamentares.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Annibal Hetem Junior - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Annibal Hetem Junior.

2016

1.   2016-2018. Big data in materials science: high throughput calculations and materials screening
Descrição: The field of computational materials science has reached its maturity, and now leads to the use of large repositories and high throughput calculations to significantly increase the quantity of simulations. Our group is using these tools to simulate a large number of materials focusing mainly on energy applications.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Gustavo Martini Dalpian - Coordenador.
Membro: Gustavo Martini Dalpian.
2.   2016-2018. Brain network changes in fatigued drivers
Descrição: The analysis of neurophysiological changes during driving can clarify the mechanisms of fatigue, considered an important cause of vehicle accidents. The fluctuations in alertness can be investigated as changes in the brain network connections, reflected in the direction and magnitude of the information transferred. Those changes are induced not only by the time on task, but also by the quality of sleep. In an unprecedented five-month longitudinal study, daily sampling actigraphy and EEG data were collected during a sustained-attention driving task within a near-real-world environment. Using a performance index associated with the subjects' reaction times and a predictive score related to the sleep quality, we identify fatigue levels in drivers and investigate the shifts in their effective connectivity in different frequency bands, through the analysis of the dynamical coupling between brain areas. Study results support the hypothesis that combining EEG and actigraphy data can reveal new features of brain oscillations and connectivity associated with sleep-induced fatigue in drivers.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: André Ricardo Oliveira da Fonseca - Coordenador / Tzyy-Ping Jung - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
Membro: Andre Ricardo Oliveira da Fonseca.
3.   2016-Atual. Desafios para o Seculo XXI em Fisica e Astrofisica de Neutrinos
Descrição: O avanço da Física de Neutrinos nas duas últimas décadas foi excepcional. A descoberta experimental das oscilações quânticas dos neutrinos e a determinação de todos os ângulos de mistura e suas diferenças de massa, a solução das antigas anomalias do neutrino solar e do neutrino atmosférico e o papel central que os neutrinos revelaram desempenhar na evolução cosmológica do Universo são alguns exemplos deste avanço e despertaram com força o interesse da comunidade internacional de Física de Altas Energias. Entretanto, ainda existem algumas questões sem resposta, o que inclui a hierarquia de massas dos neutrinos, a natureza dos neutrinos, Dirac ou Majorana, e a grande questão da próxima década, se a violação de CP existe no setor de neutrinos. O Experimento DUNE, em que estamos envolvidos poderá ser crucial para entender a hierarquia das massas dos neutrinos e a responder a questão da violação de CP com neutrinos. Nos planejamos estudar a física desta nova geração de experimentos feixe de neutrinos a longa distância bem como a nova geração de experimentos em reatores. Temos interesse nos tópicos de (1) Fenomenologia de massas e ângulos de misturas e suas extensões a outros mecanismos, (2) estudo de Modelos de Física de sabor além do Modelo Padrão e suas consequências na Física de Neutrinos, (3) o estudo da Astrofísica de Neutrinos e da (4) Cosmologia de Neutrinos. O estudo da física com neutrinos não é apenas importante para a comunidade de altas energias, mas também para o público em geral, pois tem potencial grande de impacto no futuro da ciência no Brasil, sendo importante para motivar a nova geração para que siga o estudo acadêmico nesta área. Por isto, propomos neste Projeto Temático um ambicioso e inovador programa de divulgação científica.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Celio Adrega de Moura Junior - Integrante / Marcelo Moraes Guzzo - Integrante / Ernesto Kemp - Integrante / Fernando - Integrante / Celso Chikahiro Nishi - Integrante / Orlando L. G. Peres - Coordenador / Ricardo Avelino Gomes - Integrante / Gustavo do Amaral Valdiviesso - Integrante / vicente pleitez - Integrante / alberto gago medina - Integrante / Alexei Yuryevich Smirnov - Integrante / André Luiz Carvalho de Gouvêa - Integrante / Arman Esmaili Taklimi - Integrante / Cecilia Lunardini - Integrante / Diego Rossi Gratieri - Integrante / Francesco Vissani - Integrante / Jose Wagner Furtado Valle - Integrante / Maria Amparo Tortola - Integrante / Maria Concepcion Gonzalez-­Garcia - Integrante / Maury Goodman - Integrante / Omar Gustavo Miranda - Integrante / Pedro Cunha de Holanda - Integrante.
Membro: Celio Adrega de Moura Junior.
4.   2016-2019. Estudo do Escoamento Liquido-Gas em S-BCSS
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: André Damiani Rocha - Integrante / Marcelo Moreira Ganzarolli - Integrante / Antonio C. Bannwart - Coordenador / Natache do socorro - Integrante. Financiador(es): Petróleo Brasileiro - Rio de Janeiro - Matriz - Auxílio financeiro.
Membro: Andre Damiani Rocha.
5.   2016-Atual. Heteroestruturas van der Waals de grafeno com semicondutores lamelares
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Cedric Rocha Leão - Integrante / Fazzio, Adalberto - Coordenador / Jimena Olmos Asar - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Cedric Rocha Leao.
6.   2016-Atual. Instituto Nacional de Ciencia e tecnologia em Farmacos e Medicamentos - INCT-INOFAR.
Descrição: Projeto de rede de competências para articular ações em termos de Inovação radical e incremental em Fármacos e Medicamentos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Integrante / REGINA CÉLY RODRIGUES BARROSO - Integrante / Lídia M. Lima - Integrante / BARREIRO, ELIEZER J. - Coordenador / FRAGA, CARLOS ALBERTO MANSSOUR - Integrante.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
7.   2016-2019. Laboratorio de optica adaptativa para o projeto GMT
Descrição: Todos os Telescópios Extremamente Grandes (ELTs, na sigla em inglês) incluindo o E-ELT, o GMT e o TMT, são limitados por distorções ópticas introduzidas pela atmosfera da Terra. Tais distorções serão parcialmente compensadas pelo uso de Óptica Adaptativa (AO, na sigla em inglês), sistemas optomecânicos que podem medir a frente de onda da luz incidente de objetcs celestes e rapidamente aplicar uma correção óptica apropriada usando um elemanto óptico ativo, tipicamente um espelho deformável. O desenvolvimento de AO é impulsionado pela necessidade de mais fótons do objeto cientifico sendo entregue em um número menor de pixels dentro dos instrumentos detectores, minimizando os fótons do ruído de fundo do céu. Instrumentos de visão irritada escalonam aproximadamente linearmente com o tamanho do telescópio, mas instrumentos alimentados com AO permanecem do mesmo tamanho ou tornam-se menores com o imageamento no limite de difração. Neste projeto, propomos a instalação de um laboratório de AO para ELTs no Brasil que permitirá testes rápidos de novos dispositivos (hardware) e de algoritmos (software) e proverá uma simulação dos telescópios com a qual novos conceitos de instrumentos poderão ser testados.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Marcelo Augusto Leigui de Oliveira - Coordenador / Matthew Kenworthy - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 2
Membro: Marcelo Augusto Leigui de Oliveira.
8.   2016-Atual. Microeucariotos Ciliados (Alveolata, Ciliophora) ocorrentes em ecossistemas aquaticos do Estado de Minas Gerais: Caracterizacao Multidisciplinar e Ensaios Ecotoxicologicos
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcus Vinicius Xavier Senra - Integrante / Roberto Junio P. Dias - Coordenador / Jessica Andrade - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
Membro: Marcus Vinicius Xavier Senra.
9.   2016-Atual. Modelos mistos para dados comportamentais em processos cognitivos
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Peter Maurice Erna Claessens - Coordenador.
Membro: Peter Maurice Erna Claessens.
10.   2016-Atual. Metodos em rastreamento ocular
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Peter Maurice Erna Claessens - Coordenador.
Membro: Peter Maurice Erna Claessens.
11.   2016-2017. Origins of Semantic Composition in Early Cognitive Development
Descrição: Semantic composition is the ability to bind together two or more lexical meanings. For example, RED and BRICK may be unified into the compound RED BRICK. In adults, this ability comes with the language­specific capacity to combine words into grammatical phrases. For instance, in English ?red? and ?brick? may be combined into ?red brick?, but not into ?brick red?, whereas in other languages the order of the adjective and noun may be different. However, infants are able to understand and construct simple semantic compounds before they can encode them in speech, and before they can represent the appropriate word order in the grammar of the languages they are acquiring. This project aims to track the origin and development of semantic composition in the first two years of life, prior to the acquisition of complex grammatical skills. The proposed research will test the hypothesis, supported by previous work, that there are three developmental precursors of semantic composition. First, cross­modal priming, or the ability to relate at the conceptual level bits of information presented in a sequence in different modalities (e.g., the spoken word ?dog? and the sight or the picture of a dog, and vice versa; appearing at about 9 months). Second, cross­modal integration, or the ability to bind information delivered simultaneously in different modalities (e.g., the spoken word ?dog? and the sight or picture of a dog; from 14 months on). Third, lexical semantic priming, or the capacity to relate the meaning of words presented in close succession (e.g., ?dog? and ?bark?; from 18 months on). We aim to determine with precision the onset and the developmental trajectory of each of these abilities, and to establish whether they can be used as early predictors of individual differences in vocabulary size, grammar and logic in the third year of life. We will conduct a longitudinal study of Norwegian infants and toddlers from 6 to 36 months of age, using a battery of tests including cross­modal priming and integration, lexical priming, and sentence processing, using the N400 effect in event­related potentials (ERPs) as a measure semantic processing. Our research will shed new light on the ontogeny of a key human capacity, providing a basis for research on the neural precursors of inherited developmental disorders of language and cognition.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: André Ricardo Oliveira da Fonseca - Integrante / Giosuè Baggio - Coordenador. Financiador(es): Research Council of Norway - Auxílio financeiro.
Membro: Andre Ricardo Oliveira da Fonseca.
12.   2016-Atual. Planejamento Energetico Estruturado com Suporte de uma Plataforma Computacional de Inteligencia Artificial Bioinspirada
Descrição: Este projeto possui dois objetos de estudos, o planejamento da operação e expansão dos sistemas de energia elétrica e as técnicas de inteligência artificial bioinspiradas. Este planejamento é um problema de tomadas de decisão complexo, não linear, de grande porte e de difícil solução, o que o torna atrativo para testar e desenvolver o segundo objeto de estudos, as técnicas de inteligência artificial.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Roberto Asano Junior - Integrante / Ivan Roberto Santana Casella - Integrante / Patricia Teixeira Leite Asano - Coordenador / José Rubens Maiorino - Integrante / Ricardo Caneloi dos Santos - Integrante / Edmarcio Antônio Belati - Integrante / João Manoel Losada Moreira - Integrante / Jacyro Gramulia Junior - Integrante / Erich Kellner - Integrante / Roseli F. Benassi - Integrante / Reinaldo Fugitaro Otobe Junior - Integrante / Ricardo Andrade de Lira Rabêlo - Integrante / Anderson Passos de Aragão - Integrante / Hugo Valadares de Siqueira - Integrante / Ivo Chaves da Silva Junior - Integrante / Fábio Godoy Ferreira - Integrante / Thales de Souza - Integrante / Paulo Cesar Mota Anselmo - Integrante / José Fernando de Toledo - Integrante / Ricardo Gaspar - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 13
Membro: Roberto Asano Junior.
13.   2016-Atual. Propriedades Eletronicas e Estruturais de grafeno duas camadas dopado
Descrição: Analisamos como a presença de defeitos altera as propriedades mecânicas e eletrônicas em grafeno duas camadas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Cedric Rocha Leão - Integrante / demétrio jackson dos santos - Coordenador. Número de orientações: 1
Membro: Cedric Rocha Leao.
14.   2016-Atual. Protistas ciliados endossimbiontes de mamiferos herbivoros (Ciliophora, Trichostomatia) no Brasil: Caracterizacao multidisciplinar, deteccao de bacterias metanogenicas e filogenia com base em multiplos marcadores moleculares.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcus Vinicius Xavier Senra - Integrante / Roberto Junio P. Dias - Coordenador / Marta Tavares d`Agosto - Integrante / Franciane Cedrola - Integrante. Financiador(es): Associação dos Servidores do CNPq - Auxílio financeiro.
Membro: Marcus Vinicius Xavier Senra.
15.   2016-Atual. Simulacao Computacional de Liquidos Ionicos
Descrição: Estudo por simulação de computacional de Líquidos Iônicos buscando caracterizar e entender a maneira como os pares iônicos interagem entre si e com a vizinhança visando relacionar estes dados como as suas aplicações.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ednilsom Orestes - Coordenador.
Membro: Ednilsom Orestes.
16.   2016-Atual. Sintese e caracterizacao estrutural de cocristais de rutina e acido ferulico para aplicacoes em protetores solares e cremes antioxidantest
Descrição: Um cocristal pode ser entendido como a junção de dois componentes neutros em uma forma cristalina de modo a melhorar as propriedades de estado sólido de compostos farmacêuticos, principalmente aquelas relacionadas à solubilidade em água. Diferentes metodologias para obtenção de cocristais podem ser encontradas na literatura, sendo que as cristalizações a partir da massa fundida, a partir de uma solução e da moagem assistida por líquido são as mais utilizadas. A rutina, um insumo farmacêutico ativo, com potenciais aplicações em protetores solares e cremes antioxidantes, e que possui baixa solubilidade em água, será utilizada como padrão para a obtenção de diferentes cocristais com o uso de diversos solventes, técnicas de cristalização e ácidos. Adicionalmente, o ácido ferúlico, um potente antioxidante fenólico encontrado em altas concentrações em plantas, e que possui um alto potencial fotoprotetor, será utilizado em conjunto com a rutina na obtenção de novos cocristais. A caracterização estrutural dos compostos formados será feita, principalmente, com o uso da difração de raios X por policristais. Os dados obtidos com o uso dessa técnica experimental serão então utilizados no processo de determinação da(s) estrutura(s) cristalina(s) formada(s), a(s) qual(is) será(ão) refinada(s) com o uso do método de Rietveld. Neste projeto de pesquisa realizaremos a síntese e caracterização de cocristais de rutina e ácido ferúlico, com a finalidade de obtenção de novas formas cristalinas com potenciais aplicações em protetores solares e cremes antioxidantes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
17.   2016-Atual. Sintese e caracterizacao estrutural de cocristais para aplicacoes em protetores solares e antioxidantes de uso topico
Descrição: Um cocristal pode ser entendido como a junção de dois componentes neutros em uma forma cristalina de modo a melhorar as propriedades de estado sólido de compostos farmacêuticos, principalmente aquelas relacionadas à solubilidade em água. Diferentes metodologias para obtenção de cocristais podem ser encontradas na literatura, sendo que as cristalizações a partir da massa fundida, a partir de uma solução e da moagem assistida por líquido são as mais utilizadas. A rutina, um insumo farmacêutico ativo, com potenciais aplicações em protetores solares e cremes antioxidantes, e que possui baixa solubilidade em água, será utilizada como padrão para a obtenção de diferentes cocristais com o uso de diversos solventes, técnicas de cristalização e agentes co-formadores. Adicionalmente, o ácido ferúlico, um potente antioxidante fenólico encontrado em altas concentrações em plantas, e que possui um alto potencial fotoprotetor, será utilizado em conjunto com a rutina na obtenção de novos cocristais. A caracterização estrutural dos compostos formados será feita, principalmente, com o uso da difração de raios X por policristais. Os dados obtidos com o uso dessa técnica experimental serão então utilizados no processo de determinação da(s) estrutura(s) cristalina(s) formada(s), a(s) qual(is) será(ão) refinada(s) com o uso do método de Rietveld. Neste projeto de pesquisa realizaremos a síntese e caracterização de cocristais de rutina e ácido ferúlico, com a finalidade de obtenção de novas formas cristalinas com potenciais aplicações em protetores solares e cremes antioxidantes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / GABRIEL L. B. ARAUJO - Integrante / VÂNIA MENDES DO PRADO - Integrante / Juliana Alves Pereira Sato - Integrante / Fanny Nascimento Costa - Integrante / André Rolim Baby - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
18.   2016-2017. The role of social media in comparative elections: Turkey and Brazil
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Fabricio Olivetti de França - Integrante / Denise Hideko Goya - Integrante / Claudio Luis de Camargo Penteado - Coordenador.
Membro: Fabricio Olivetti de Franca.
19.   2016-Atual. Utilizacao de Torio em Reatores Nucleares e Ciclos de Combustivel
Descrição: Para o Brasil, a utilização de Tório, é fundamental desde que somos a maior reserva mundial de Tório do planeta, de acordo com o [IThEO, 2014], e portanto não podemos ficar alheios a este importante combustível, a exemplo de países como a India, que possui um programa de desenvolvimento na utilização de Tório. Atualmente, iniciamos na Universidade Federal do ABC, pesquisas sobre a utilização de Tório, sendo que atualmente dentro de um doutorado e um mestrado, com bolsa CAPES/ELETRONUCLEAR, desenvolvem-se pesquisas sobre o tema., sobre a possibilidade de utilizar o conceito de SEED- BLANKET, onde no seed de um elemento combustível, se utilizaria UO2 com urânio de baixo enriquecimento (LEU, 20%), e no blanket, (UxThy)O2. Além disso, se utilizaria o conceito de blanket axial . Os resultados esperados é que esse conceito possa ser regenerador ( breeder), produzir menos resíduos de alto nível, e ter uma queima estendida comparada com um reator PWR de geração III(e.g. AP1000).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Roberto Asano Junior - Integrante / Patricia Teixeira Leite Asano - Integrante / José Rubens Maiorino - Coordenador / João Manoel Losada Moreira - Integrante / Pedro Carlos Russo Rossi - Integrante / Pedro Henrique Silva Rodrigues - Integrante. Número de produções C, T A: 2
Membro: Roberto Asano Junior.
20.   2016-2017. Water Environment Micropollutant Science Initiative: A GCU-UFABC-PUCPR Collaborative to explore emergent pollutants in Brazilian watercourses (Newton Fund - Institutional Links)
Descrição: This cross-disciplinary project draws together environmental science; (waste) water engineering, eco-toxicological analysis; and stakeholder engagement in a new collaboration to consider the increasingly recognised problems of water-quality standards. The aim of this will be to investigate potential negative impacts and identify technical and policy solutions. There is considerable concern in Brazil about the (long-term) impact of watercourse pollution on ecosystems and human health. Transformations that the society has seen in the last 20 years impacted the production and distribution of health problems. Brazil has seen a much more complex epidemiological profile than expected, where (infectious and parasitic) diseases originating in poverty and those associated with the process of modernisation (such as cancer, hormonal and cardiovascular diseases), appear simultaneously. In favela areas considerable problems are perceived: watercourses can be contaminated with surface runoff and direct discharges of wastewater, additionally sewers are often uncovered. This can potentially create sources of airborne disease and risk of surface water contamination / leachate into groundwater. There are often high incidences of water-borne diseases: typhoid; infectious hepatitis; cholera; schistosomiasis; leptospirosis and diarrhoea particularly prevalent in areas with poor sanitation. Drawing upon the considerable expertise that GCU has gained from PILLS and noPILLS cross-European Programmes we will build upon this in a context where concern is growing regarding a range of ?emerging pollutants? in surface water such as pharmaceuticals and plastics additives alongside more ?traditional? water quality parameters such as pesticides and heavy metals and their environment and health impacts. The Project will contribute to advances in the identification, quantification and removal of potentially toxic substances for example interfering on the endocrine system of animals and humans.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (1) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / Paul Teedon - Integrante / Ole Pahl - Integrante / Lucia Helena Gomes Coelho - Integrante / Tatiane Araujo de Jesus - Integrante / Harry Alberto Bollmann - Integrante / Jefferson Pedro Cunha - Integrante / Leana Carolina Ferreira Setim - Integrante / Luciene Ribeiro - Integrante / Fabiana de Nadal Andreoli - Integrante / Eliza Mara Arruda Dias - Integrante / Edilberto Nunes de Moura - Integrante / Kiana Kargar - Integrante / Karen Helwig - Integrante / Colin A. Hunter - Integrante / Joanne Roberts - Integrante. Financiador(es): British Council - Auxílio financeiro.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
21.   2016-2017. X-ray diffraction patterns of some pharmaceutical compounds
Descrição: This project aims the collection of X-ray powder diffraction data of some pharmaceutical compounds to be deposited in the Powder Diffraction File (PDF) database, which is distributed by the International Centre for Diffraction Data (ICDD). Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador. Financiador(es): International Center for Diffraction Data - Auxílio financeiro.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
22.   2016-Atual. XTReMe - Experiencias de Tecnologias para Reabilitacao em Medicina
Descrição: O objetivo geral deste projeto é desenvolver tecnologias assistivas e de reabilitação voltadas para pacientes com deficiências motoras, com foco, mas não restrito a pacientes de AVC. Pretende-se dar continuidade às pesquisas de interfaces cérebro-computador acopladas a cadeira de rodas robotizada iniciadas com o projeto DesTINe (FINEP), e incluir outras linhas de pesquisas voltadas à reabilitação desse tipo de pacientes usando realidade virtual aumentada, além do desenvolvimento de próteses.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Fernando Silva de Moura - Coordenador / Diogo Soriano - Integrante / Gabriela Castellano - Integrante / Eleri Cardozo - Integrante / Romis Attux - Integrante / Sarah Negreiros de Carvalho - Integrante / Janaina Gaspar Ruas - Integrante.
Membro: Fernando Silva de Moura.

2015

1.   2015-Atual. 15th International Conference on Phonon Scattering in Condensed Matter
Descrição: Este auxílio visa apoiar a participação na Conferência acima citada, bem como a visita à School of Chemistry, University of East Anglia, UK. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Herculano da Silva Martinho - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Herculano da Silva Martinho.
2.   2015-Atual. Apoio as facilidades multiusuarias da UFABC
Descrição: O presente projeto visa à aplicação da Parcela para Custos de Infraestrutura Institucional para Pesquisa (PCIIP) para o apoio ao funcionamento das infra-estrututura multiusuária da UFABC, em particular, as Centrais Experimentais Multiusuárias de Santo André e São Bernardo do Campo e os biotérios de Santo André e São Bernardo do Campo. Este apoio envolverá a execução de obras laboratoriais, aquisição de materiais e equipamentos de uso comum e outros insumos. Esta infraestrutura atende atualmente mais de 500 usuários entre docentes e pós-graduandos da UFABC e usuários externos, das áreas de Física; Química; Engenharias de Materiais, de Energia, Biomédica, de Instrumentação e Robótica, Aeroespacial; Biologia; Neurociências.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Herculano da Silva Martinho - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Herculano da Silva Martinho.
3.   2015-Atual. Caracterizacao genomica funcional e evolutiva das malato desidrogenases de gramineas
Descrição: A malato desidrogenase (MDH) é uma enzima importante para a manutenção do estado redox celular, por causa da sua capacidade de interconversão reversível de malato em oxaloacetato e oxidorredução de NAD ou NADP. Em A. thaliana existem 9 isoformas conhecidas que são direcionadas para mitocondriais, peroxissomos, plastídios, dentre ele cloroplastos e citosol. Entretanto, a estrutura e história evolutiva da família gênica malato desidrogenase permanecem pouco estudadas em monocotiledôneas, entre elas, arroz, milho e cana-deaçúcar. O objetivo geral deste projeto de pesquisa é caracterizar a estrutura e evolução da malato desidrogenase em gramíneas e guiar futuros estudos funcionais com foco no incremento no rendimento do metabolismo de carboidratos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Nathalia de Setta - Coordenador / Danilo da Cruz Centeno - Integrante / Marcos Vinícius Gonçalves da Silva - Integrante / Anderson Marque de Oliveira - Integrante.
Membro: Nathalia de Setta Costa.
4.   2015-Atual. Conservacao de ungulados em um remanescente de Mata Atlantica
Descrição: A avaliação da efetividade das áreas protegidas na redução das ameaças aos habitats e às espécies é urgente para os ecossistemas que estão sob um grande nível de ameaça, como a Mata Atlântica. Essas áreas estão sendo alvos de invasão humana, extração de madeira e da caça, sendo que, em longo prazo, podem perder importantes elementos da biodiversidade, incluindo os grandes mamíferos herbívoros, dentre eles porcos-do-mato, antas e veados. Essas espécies representam um importante grupo funcional e sua ausência pode refletir na perda de processos ecológicos, pois são predadores e dispersores de sementes, assim como fonte de recursos para grandes e médios predadores. No Espírito Santo (ES), a presença simpátrica de todos os ungulados neotropicais nativos ainda pode ser registrada apenas no norte do estado. Sendo assim, este projeto tem como objetivo principal avaliar a efetividade de um dos últimos remanescentes de Mata Atlântica, no norte do ES, para a proteção de antas (Tapirus terrestris) e queixadas (Tayassu pecari). A pesquisa se concentrará na Reserva Biológica de Sooretama e na Reserva Particular do Patrimônio Natural Recanto das Antas, localizadas nos municípios de Sooretama e Linhares. Serão instaladas 30 armadilhas fotográficas em diferentes ambientes da paisagem para as análises de estimativa populacional e seleção de habitat por cada espécie. Para a seleção de habitat, serão analisadas características da paisagem que podem influenciar positivamente ou negativamente a densidade de mamíferos nas duas áreas. Para avaliar os fatores ambientais e antrópicos que influenciam a ocorrência dos ungulados, será utilizado o modelo de ocupação. Para as análises de estimativa populacional, também será utilizada a técnica de identificação de pegadas (FIT) para estimar a população de antas. Concomitantemente, uma análise da paisagem e do padrão espacial das manchas de habitat será feita utilizando-se sistemas de informação geográficas. Para as análises genéticas, serão instaladas armadilhas de pelos nos locais utilizados por grupos de queixadas. As extrações de DNA serão feitas a partir da raiz dos pelos. Amostras com o mesmo genótipo serão classificadas como sendo do mesmo indivíduo. Indicadores de diversidade genética, testes dos equilíbrios de Hardy-Weinberg e de ligação para cada área e o coeficiente de endogamia FIS serão calculados. Para verificar se as populações passaram por gargalos populacionais recentes, será utilizado o programa BOTTLENECK. A divulgação do projeto para o público será feita através da distribuição de folhetos para a comunidade. Ao final do projeto, um workshop será realizado para a consolidação das informações obtidas e definição de diretrizes para a conservação das populações de antas e queixadas no ES. O projeto identificará os pontos favoráveis à conservação de ambas espécies e, ainda, identificará as ameaças que elas estão submetidas nas duas reservas. O projeto também fornecerá informações sobre a ecologia espacial e populacional dessas espécies. Os resultados deste trabalho servirão de embasamento para ações do plano de manejo da Rebio de Sooretama, que está em desenvolvimento, e ainda, poderão indicar recomendações específicas de manejo visando à conservação de biodiversidade, particularmente na área da RPPN Recanto das Antas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Cibele Biondo - Integrante / Sérgio Lucena Mendes - Coordenador / Andressa Gatti - Integrante / Stuart Pimm - Integrante / Daniele de Oliveira Moreira - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Espírito Santo - Auxílio financeiro.
Membro: Cibele Biondo.
5.   2015-2017. Dinamica de metacomunidades em ambientes heterogeneos
Descrição: Para compreender os padrões de diversidade é preciso considerar não só dinâmicas locais, mas como elas se conectam em escala regional. Por essa razão, a abordagem de metacomunidades (isto é, comunidades ecológicas ligadas por dispersão) é hoje um dos campos mais ativos da ecologia. Os ecólogos reconhecem que não há ainda uma teoria geral de metacomunidades, em parte pela falta de modelos matemáticos básicos que resolvam algumas questões fundamentais. O projeto proposto pretende contribuir para suprir uma das lacunas, que é o desenvolvimento de modelos matemáticos de metacomunidades em espaço explícito heterogêneo. Usaremos a teoria e instrumental de análise de sistemas dinâmicos, bem como métodos e resultados provenientes da teoria de metapopulações e do estudo de módulos de interação da ecologia de comunidades. Os objetivos específicos são o desenvolvimento e análise de modelos matemáticos que (i) generalizem a capacidade de suporte metapopulacional com taxas heterogêneas para metacomunidades, (ii) expressem o efeito de heterogeneidade ambiental sobre interações interespecíficas (com destaque para predação intraguilda), (iii) e mostrem o efeito de atributos da paisagem e das espécies sobre a dinâmica de metacomunidades.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Renato Mendes Coutinho - Integrante / Paulo Inácio Prado - Coordenador.
Membro: Renato Mendes Coutinho.
6.   2015-Atual. Dinamica de relaxacao de agua confinada supercongelada em micro/nanotubos de L,L-difenilalanine
Descrição: Este projeto é visa apoiar a publicação dos resultados envolvendo micro/nanotubos de L,L-difenilalanine que foram escolhidos como capa da revista Physical Chemistry Chemical Physics. Em resumo, a dependência com a temperatura (10-290 K) dos modos fonônicos ativos em Raman em baixas frequencias (20-150 cm-1) para água confinada supercongelada em micro/nanotubos de L,L-difenilalanina foi analizada. A dinâmica isolada de uma geometria específica de cluster de água (pentamero) no regime de confinamento supercongelado foi estudada em detalhes. Uma transição frágil-forte em 204 K foi observada e relacionada ao cruzamento da linha de Widom. Análise dos modos vibracionais dos peptídeos acoplados as ligações de hidrogênio da água indicaram que flutuações nas ligações de hidrogenio desempenham um importante papel neste sistema. Nossos resultados estão de acordo com a hipotese de existência do segundo ponto crítico da água.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Herculano da Silva Martinho - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Herculano da Silva Martinho.
7.   2015-Atual. ESTRESSE CELULAR E SUA RELACAO COM A CINETICA DE DESENVOLVIMENTO DE EMBRIOES BOVINOS PRODUZIDOS IN VITRO.
Descrição: A produção in vitro de embriões bovinos ainda é considerada uma biotecnologia de baixa eficiência, uma vez que a técnica apresenta, em média, menor taxa de prenhez quando comparada à produção in vivo. Embora o sistema de cultivo in vitro (CIV) tente mimetizar o que ocorre in vivo, os embriões da CIV acabam sendo expostos a diversos fatores de estresse que normalmente não sofreriam no interior do trato reprodutivo. Além de fatores intrínsecos como a própria produção de energia para sustentar os eventos do desenvolvimento, fatores de estresse ambiental ocasionados por um sistema não otimizado de cultivo também podem prejudicar o desenvolvimento embrionário. É o caso da manutenção da homeostase oxidativa, que se não for mantida pode fazer com que a produção de ATP e a síntese proteica entrem em colapso. Para a otimização do processo de cultivo é necessário conhecer a que tipos de condições estressoras estes embriões estão submetidos no sistema in vitro e como os embriões de características distintas respondem a essas condições de estresse. Por esta razão, acreditamos que seja de extrema relevância a investigação de mecanismos moleculares que relacionem a competência do embrião aos estressores existentes na produção in vitro. Além disso, combinação de técnicas moleculares e avaliações bioquímicas e morfológicas podem fornecer biomarcadores da resposta embrionária ao estresse, de forma que nos permita desenvolver estratégias alternativas para a modulação e para a reformulação empírica dos métodos de cultivo visando sua otimização e a seleção de embriões de melhor qualidade e viabilidade. Com base no exposto os objetivos deste projeto são: avaliar ao longo do cultivo de embriões bovinos PIV de diferentes cinéticas de desenvolvimento (rápido e lento) mantidos sob condições estressoras no sistema de cultivo (estresse glicêmico e oxidativo) o padrão de consumo de substratos energéticos (glicose, lactato, piruvato e glutamato); a atividade mitocondrial e a produção intracelular de espécies reativas de oxigênio; os produtos da peroxidação lipídica no meio de cultura; o padrão de expressão de genes relacionados a diferentes vias de resposta ao estresse celular e correlacionar os dados com a cinética de desenvolvimento de embriões produzidos in vitro.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . Integrantes: Marcella Pecora Milazzotto - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Marcella Pecora Milazzotto.
8.   2015-2018. Genomas obesos e ditribuicao geografica: amplificacao de sequencias de DNA repetitivo e citogeografia
Descrição: Apesar da mega biodiversidade vegetal encontrada nos neotrópicos, praticamente inexiste trabalhos em que biogeografia das espécies tenha sido abordada do ponto de vista citogenético, seja pelas análises de cariótipo, seja pela avaliação do tamanho de genoma. Estudos que relacionem tais parâmetros com a distribuição geográfica das espécies são prementes, permitindo ampliar o entendimento sobre processos microevolutivos. Dentre as famílias vegetais ocorrentes na região neotropical, Orchidaceae se destaca pela diversidade de ambientes colonizados e variações morfológicas e cariotípicas dentre suas espécies. As mudanças observadas nos cariótipos e variações quanto o tamanho de genoma podem ser relacionadas com as variações ambientais. Em condições de instabilidade, os retrotransposons podem tornar-se mais ativos, re-padronizando o genoma e, como consequência, leva a um incremento na quantidade de DNA, sendo que esta variação é considerada um das principais causas de divergência entre espécies. Um exemplo de variações cariotípicas e de tamanho de genoma relacionada a distribuição geográfica pode ser observada em espécies de Brasiliorchis, um gênero tipicamente neotropical ocorrente ao longo da Mata Atlântica brasileira. As espécies deste gênero apresentam 2n=40, com pequenos blocos heterocromáticos nos cromossomos e 2C = aprox.3pg, exceto por B. schunkeana que, apesar de apresentar os mesmos 2n=40, apresenta três pares cromossômicos basicamente heterocromáticos e 2C=4.19pg, que representa um incremento de 50%. Adicionalmente, B. schunkeana encontra-se restrita ao Espirito Santo, enquanto as demais espécies do gênero stão distribuídas ao longo da Mata Atlântica. A região de ocorrência de B. schunkeana coincide com regiões de refugio do Pleistoceno no Quartenário, onde a mata úmida ficou restrita com o avanço da mata seca. Para melhor compreender os processos microevolutivos envolvidos na distribuição restrita de B. schunkeana e a relação da distribuição geográfica com o aumento do tamanho de genoma, a genômica se une à citogenética, permitindo analisar a fração repetitiva do genoma e caracteriza-la diretamente nos cromossomos. Desta forma, pretende-se elucidar o papel da variação do tamanho do genoma na distribuição geográfica e escolhas ecológicas das espécies, compreendendo como as sequências se comportam em eventos de amplificação do genoma.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ana Paula de Moraes - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Ana Paula de Moraes.
9.   2015-2016. In silico modelling of endovascular treatment of intracranial aneurysms
Descrição: Flow-diverting stents (FDS) offer a valid alternative in treatment of intracranial aneurysm at bifurcations, when other endovascular procedures (e.g. coiling) are not possible. Unfortunately their use carries a risk of ischemic complications. These are frequently caused by the occlusion of the opposite artery to the FDS in the early follow up period. This effect does not seem to depend on the FDS model or mark, and can be observed with any commercially-available FDS. Interestingly, the problem does not occur when FDS are placed across side-wall arteries in arterial bifurcations, e.g. ophthalmic, anterior choroid, posterior cerebellar or posterior communicating arteries. Bulding on idealised and patient-specific numerical representations of the physics of the problem, the project investigates the mechanisms at the basis of these observations with the ultimate aim of understanding the mutual significance of all problem variables at play (vessels diameter, stent design/porosity, arterial wall deformation secondary to stent placement, bifurcation geometry/type) on the clinically-relevant effects (alterations of pressure and velocity, flow recirculating areas, haemodynamic load on arterial wall, in the regions of interest). The identification of the variables of strongest influence, and the virtual platform that this study will assemble, has the potential to make an impact on clinical treatment and to provide a valid guidance to Neuroradiologists when deciding the optimal treatment for a specific patient.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Fernando Silva de Moura - Coordenador / Harki Tanaka - Integrante / Ana Paula Narata - Integrante / Alberto Marzo - Integrante / Ignacio Larrabides - Integrante / Paul Watton - Integrante / Ronny Calixto - Integrante. Financiador(es): Royal Academy of Engineering - Cooperação. Número de produções C, T A: 4
Membro: Fernando Silva de Moura.
10.   2015-2018. Modelagem computacional multiescala da evolucao microestrutural e da plasticidade em ligas metalicas
Descrição: Uma das características distintivas dos metais e suas ligas é a de apresentar algum grau de maleabilidade e ductilidade, o que implica que podem ser deformados plasticamente quando há uma solicitação mecânica. Isso é de grande importância para os processos de fabricação e mesmo para as variadas aplicações tecnológicas desses materiais. Contudo, essas e outras propriedades das ligas metálicas dependem da sua composição quíımica (i.e., dos elementos de liga envolvidos) e da microestrutura (e.g., múltiplas fases, tamanho médio de grãos, precipitados, etc). A plasticidade e a evolução microestrutural de ligas metálicas têm sido objeto de estudos experimentais e teóricos há bastante tempo; nas últimas décadas, abriu-se a possibilidade de modelá-las também em nível atômico devido ao surgimento de grandes máquinas paralelas e o desenvolvimento de códigos computacionais otimizados. No âmbito do projeto aqui apresentado, o que se propõe é estudar a mobilidade de discordâncias na presençaa de obstáculos (e.g., atmosferas de Cottrell ou nanoprecipitados), a resposta de ligas metálicas com tamanho médio de grão nanométrico à aplicação de uma força de tração, o efeito de elementos de liga no crescimento de grãos nanométricos e a mobilidade de interfaces durante as transformações de fases, principalmente em ligas ferrosas (tomadas como ligas metálicas prototípicas), utilizando métodos computacionais tais como a dinâmica molecular com potenciais empíıricos e Monte Carlo.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Roberto Gomes de Aguiar Veiga - Coordenador / Hélio Goldenstein - Integrante / Marcio Gustavo Di Vernieri Cuppari - Integrante / Alejandro Andres Zuniga Paez - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Roberto Gomes de Aguiar Veiga.
11.   2015-Atual. Modelagem e Instrumentacao em Tomografia por Impedancia Eletrica
Descrição: Desenvolvimento de hardware, modelos matemáticos e ferramentas clínicas relacionados à Tomografia por Impedância Elétrica para uso clínico.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (7) / Mestrado acadêmico: (4) . Integrantes: Fernando Silva de Moura - Integrante / AA-erick camargo - Coordenador / AA-olavo luppi - Integrante. Número de produções C, T A: 16
Membro: Fernando Silva de Moura.
12.   2015-2015. Multifractality and information in nonlinear neural dynamics: generalized dimensions and entropy applications
Descrição: We review the dynamical systems concepts of generalized dimensions and entropy, related to the attractor natural measure, and develop numerical estimators for those invariants based on statistical descriptions. We compare the results with the analytical expressions derived for the skew tent map. Those estimators are also suitable for empirical data, specifically in the context of nonlinear and nonstationary neural dynamics. We analyze the multifractal structure changes in two scenarios, probably Alzheimer disease and sleep, establishing dynamical correlates with brain dynamics with applications in neural phase transition detection.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: André Ricardo Oliveira da Fonseca - Integrante / Jeferson Cassiano - Integrante / Gheorghe Tigan - Coordenador. Financiador(es): Politehnica University of Timișoara - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1
Membro: Andre Ricardo Oliveira da Fonseca.
13.   2015-Atual. Plasticidade fenotipica de macacosprego (genero Sapajus): investigacao sobre o efeito de trajetorias ontogeneticas distintas e de ativacao contexto-dependente.
Descrição: Dentre os primatas não humanos, o gênero Neotropical Sapajus constitui modelo ideal para investigar fatores subjacentes a diversidade comportamental relacionada a diferentes contextos ambientais. Assim, o objetivo deste projeto é investigar se a variabilidade comportamental já observada entre populações de Sapajus se deve a diferenciação genética ou a plasticidade fenotípica. As hipóteses serão testadas por meio de uma análise genômica e de análises de covariação fenotípica e genética por modelos mistos. Se a diversidade comportamental for independente de diferenciação genética, buscaremos responder se a plasticidade fenotípica resulta de flexibilidade reversível contingente a mudanças ambientais (plasticidade ativacional) ou de trajetórias ontogenéticas distintas desde o desenvolvimento inicial das diferentes populações (plasticidade ontogenética), por meio da relação entre variância intra e entre populações ao longo de diferentes fases do desenvolvimento. Para tanto, serão comparados, por meio de filmagens semanais de um dia inteiro, indivíduos de quatro populações selvagens de espécies irmãs (S. nigritus, S. libidinosus, S. xanthosternos e S. flavius), do nascimento até os 36 meses de idade, bem como variáveis ecológicas e características dos sistemas sociais, e genótipo, comportamento e perfil hormonal de todos os indivíduos dos grupos estudados. Este projeto é multicêntrico, envolvendo pesquisadores brasileiros da USP (IP e IB), UNESP Botucatu, UFABC e UFRN, norte-americanos, das Universidades da Califórnia, Los Angeles, da Georgia, Athens, e de Medicina e Biociências de Kansas, europeus, do Instituto de Ciência e Cognição de Roma, Itália e da Universidade de Veterinária de Viena, Áustria, e um pesquisador do Instituto Politécnico Nacional do México.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Cibele Biondo - Integrante / Patricia Izar - Coordenador / Cristina Yumi Miyaki - Integrante / Briseida Dogo de Resende - Integrante / BARTH WRIGHT - Integrante / DOROTHY FRAGASZY - Integrante / ELISABETTA VISALBERGHI - Integrante / JESSICA LYNCH ALFARO - Integrante / GABRIEL RAMOS-­FERNANDEZ - Integrante / JOSE DE OLIVEIRA SIQUEIRA - Integrante / KRISTIN WRIGHT - Integrante / LAURIE REITSEMA - Integrante / LUCIENE MAURA MASCARINI SERRA - Integrante / MICHAEL ALFARO - Integrante / RENATA GONÇALVES FERREIRA - Integrante / RUPERT PALME - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Cibele Biondo.
14.   2015-2015. Superradiancia em sistemas dissipativos
Descrição: Bolsa de Pesquisa no Exterior (FAPESP). Processo: 15/14077-0. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maurício Richartz - Coordenador.
Membro: Mauricio Richartz.
15.   2015-2018. Sintese, caracterizacao e fotorreatividade de compostos polipiridinicos de Re(I) e nitronas.
Descrição: Este projeto propõe a síntese, caracterização e investigação das propriedades fotoquímicas e fotofísicas dos compostos polipiridínicos de rênio(I) do tipo fac-[Re(CO)3(Ph2-Phen)(Nit)]+ onde Ph2-phen = 4,7-difenil-1,10-fenantrolina e Nit = aril-aril derivados da nitrona, visando a sua utilização em sensores de radicais, como o peróxido. O projeto será iniciado pela síntese e caracterização dos compostos e posteriormente as suas propriedades fotofísicas serão investigadas tanto em solução fluída quanto rígida. Também serão avaliadas as mudanças das propriedades dos compostos na presença e ausência de radicais, como o radical peróxido. Esta avaliação servirá como base para melhorias dos compostos visando sua possível aplicação como sensor luminescente para estes radicais livres.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: André Sarto Polo - Coordenador / Antonio Otávio T Patrocínio - Integrante / karina - Integrante / Artur Keppler - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Andre Sarto Polo.
16.   2015-Atual. TB-Horse: Construcao do Prototipo de um Robo Quadrupede Bio-Inspirado para Locomocao em Terrenos Irregulares
Descrição: A robótica móvel tem se desenvolvido fortemente nas últimas décadas. Estudos de robôs com pernas, em especial, ganham destaque pela capacidade de transpor obstáculos com maior efetividade em relação aos demais meios de locomoção. Aliado a este estudo, encontra-se a robótica bio-inspirada, que faz uso de elementos funcionais da natureza como inspiração para a robótica. O TB-Horse, fruto deste trabalho, é um robô quadrúpede bio-inspirado em um cavalo da raça Mangalarga Marchador e tem como objetivo se locomover em terrenos acidentados para o resgate de feridos, transporte de cargas frágeis, dentre outras aplicações. Este projeto de pesquisa tem como objetivo o estudo/análise e simulação do projeto mecânico estrutural em CAD-3D antes da construção do protótipo real. Além disso, deve-se propor e simular o projeto eletrônico no software Proteus, antes da sua implementação real. A simulação é fundamental para que se consiga corrigir alguns erros, evitando assim que grandes ajustes sejam realizados quando o protótipo for desenvolvido. Após o estudo do projeto mecânico estrutural e eletrônico, o protótipo do TB-Horse será construído e vários algoritmos inteligente podem ser implementado para validar o robô real.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Maria das Graças Bruno Marietto - Integrante / Vera Lúcia da Silva - Integrante / Wagner Tanaka Botelho - Coordenador / Felipe Marin Biihrer - Integrante / Daniel Rodrigues de Sousa - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Maria das Gracas Bruno Marietto.
17.   2015-Atual. Understanding the plastic responses to the water deficit in Setaria italica and the influence of the transposable elements
Descrição: Evolução e Fisiologia se desenvolveram como disciplinas separadas, o que refletiu em uma hipótese de que ambas só poderiam ser estudadas de forma desassociada. Nesse projeto, propomos investigar um problema clássico da fisiologia vegetal com um olhar evolutivo para buscar respostas sobre os mecanismos que regem a herança da plasticidade fenotípica. Como os elementos de transposição têm sido repetidamente associados à geração de variabilidade genética e epigenética em plantas, o objetivo desse projeto será avaliar o papel dessas sequências na geração e herança da resposta plástica ao estresse hídrico em monocotiledôneas C4. Propõe-se utilizar Setaria italica como espécie modelo devido à facilidade de cultivo e a disponibilidade do genoma sequenciado. Será realizado um experimento em casa de vegetação em que plantas serão cultivadas por duas gerações em um gradiente de estresse hídrico. Plantas dos diferentes tratamentos serão comparadas quanto à sobrevivência e reprodução, por meio da avaliação de caracteres de fitness, e amostras de folhas e sementes serão analisadas por meio de perfis metabólicos e de expressão gênica (mRNA, sRNAs e qPCR). Além de avaliar se os elementos de transposição desempenham um papel na regulação epigenética da tolerância à seca, os dados obtidos permitirão determinar genes e rotas metabólicas que conferem plasticidade fenotípica em S. italica. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Nathalia de Setta - Coordenador / Luisa Bérmudez - Integrante / Fernando Carrari - Integrante / Magdalena Rossi - Integrante / Danilo da Cruz Centeno - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Bolsa. Número de produções C, T A: 4
Membro: Nathalia de Setta Costa.

2014

1.   2014-2016. Atomistic simulations of material s interfaces for solar energy devices
Descrição: This project aims to provide accurate predictions at atomic and molecular level of the interfaces of solar energy devices, which would be used for experimentalist in the seeking of new materials for harvesting solar energy. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Luana Sucupira Pedroza - Integrante / Alexandre Reily Rocha - Coordenador / César Enrique Pérez Villegas - Integrante. Financiador(es): Microsoft Corporation - Auxílio financeiro.
Membro: Luana Sucupira Pedroza.
2.   2014-2017. Avaliacao do habito cristalino de candidatos a novos farmacos pela predicao da morfologia, imagens de microscopia optica e de dados de difracao de raios X por policristais
Descrição: A busca por novos medicamentos, que produzam resultados eficazes e específicos, no tratamento de doenças como diabetes mellitus e câncer, por exemplo, são de grande interesse científico e tecnológico. A redução de doses ingeridas pelos pacientes, combatendo tecidos-alvo acometidos pelas manifestações nocivas ao organismo, podem proporcionar uma melhora significativa na qualidade de vida dos indivíduos, bem como reduzir os efeitos colaterais usualmente verificados em alguns tipos de tratamento. Muitas formulações farmacêuticas sólidas merecem atenção em virtude de possíveis variações de suas propriedades físico-químicas, tais como alterações no ponto de fusão, na solubilidade, na densidade real, no perfil de dissolução, dentre outros, comprometendo a eficácia e biodisponibilidade do fármaco no organismo. Grande parte dos medicamentos é administrada na forma sólida. Destas, muitas são policristalinas, sendo facilmente detectadas por difração de raios X. Quando as estruturas cristalinas são conhecidas, a aplicação do método de Rietveld de refinamento de estruturas cristalinas é uma poderosa ferramenta na caracterização estrutural. Entretanto, quando a estrutura é desconhecida, a aplicação do método não pode ser considerada. Nestes casos, o primeiro passo a ser realizado é a eficiente coleta de dados de difração de raios X e a utilização de métodos computacionais para a elucidação da estrutura cristalina para subsequente aplicação do método de Rietveld. Neste projeto pretendemos determinar as estruturas cristalinas de diversos compostos candidatos a novos fármacos utilizados no tratamento do diabetes mellitus Tipo 2 e do câncer. Para tanto, medidas de difração de raios X por policristais serão conduzidas no LCCEM-UFABC. Uma parte importante da caracterização estrutural está relacionada à análise do hábito cristalino dos cristais formados no processo de síntese. Métodos computacionais de Dinâmica Molecular e predição de morfologia cristalina serão correlacionados com imagens obtidas ao microscópio óptica. Testes para encapsulamento em sistemas para liberação controlada dos fármacos também serão testados.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / VÂNIA MENDES DO PRADO - Integrante / LAYSA PIRES DE FIGUEIREDO - Integrante / AMANDA LAURA IBIAPINO - Integrante / Juliana Alves Pereira Sato - Integrante / Fanny do Nascimento Costa - Integrante / Rondes Ferreira da Silva - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 4
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
3.   2014-2017. Center for Computation and Engineering Sciences
Descrição: We propose the creation of a world-class multidisciplinary Center dedicated to the develop- ment and application of advanced computational science for the following purposes: (a) To provide state-of-the- art facilities and highly qualified human resources devoted to face the present chal- lenges in high- performance and massive computation in science and engineering; (b) To promote substantial advancements in partnerships between academia and industry in Brazil and (c) To engage on science education and dissemination in these areas.. The Center will be housed in a fully equipped building that will provide working spaces to harbor faculty, researchers, students, visiting scholars, and technicians in order to boost cooperation and scientific interaction among its participants. Faculty will be drawn from various Departments at the University of Campinas, including Computer Science, Mechanical Engineering, Physics, Chemistry, Biology, and Applied Math. The primary goal of the Center is to bring together a team of scientists from the Uni- versity of Campinas, working in several scientific domains, with partners from abroad, to carry out high-level research in a cooperative manner, taking advantage of the fast growing area of high-performance and data-intensive computing.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Emilio de Camargo Francesquini - Integrante / Munir Salomão Skaf - Coordenador.
Membro: Emilio de Camargo Francesquini.
4.   2014-Atual. Ciencia Cidada e o monitoramento participativo da biodiversidade
Descrição: A ciência aparece muitas vezes desconectada do cotidiano das pessoas, não havendo muito conhecimento por parte da população dos processos envolvidos para o desenvolvimento de pesquisas cientificas e para a coleta de dados sobre a biodiversidade. Nos espaços escolares, as estratégias de ensino mais próximas ao fazer científico (metodologias ativas de aprendizagem): 1) promovem estudo e investigação em contextos autênticos; 2) estimulam a responsabilidade, iniciativa, tomada de decisão e aprendizado intencional dos educandos; 3) promovem a colaboração entre estudantes e professores e 4) utilizam atividades dinâmicas e interdisciplinares que promovem processos e estruturas de pensamento complexos. Com uso destas estratégias, o conteúdo das aulas de ciências e biologia passa a fazer sentido para o aluno, auxiliando, posteriormente, na sua inclusão na sociedade e no mercado de trabalho. Neste contexto se insere a ?Ciência Cidadã?, um processo que envolve o público na coleta de informações científicas em ampla escala espacial e/ou temporal, ao mesmo tempo em que contribui para a formação científica dos cidadãos. O presente projeto visa à implantação de um programa de ciência cidadã para educação científica em diferentes contextos, tanto formais quanto informais. Para isso, pretende-se a formação de uma equipe e a parceria com diferentes espaços educacionais para o desenvolvimento das atividades. No momento, já estão em andamento quatro projetos dentro desta linha na UFABC, sendo três de iniciação científica (envolvendo escolas de educação básica) e um de mestrado (envolvendo mergulhadores em uma unidade de conservação marinha). Além destes, mais três estão em elaboração. A meta destes projetos é promover a alfabetização científica de diferentes públicos, trabalhar a sua percepção ambiental e, ao mesmo tempo, possibilitar a coleta de dados sobre a biodiversidade brasileira de maneira participativa em diferentes escalas de espaço e tempo. Atualmente, questões como ?Quais são os benefícios trazidos pelas árvores urbanas à população? (serviços ecossistêmicos)?; ?Qual a relação entre a arborização urbana e a biodiversidade de aves urbanas??; ?Qual é a distribuição e abundância de diferentes tipos de resíduos sólidos urbanos?? e ?Qual a composição e abundância das comunidades bentônicas de infralitoral e de praias?? tem sido trabalhadas pelo grupo. Em todos os casos, serão desenvolvidos protocolos simples e com materiais de baixo custo para o desenvolvimento das atividades. Haverá o treinamento dos cidadãos cientistas (professores, alunos, turistas, entre outros) para aplicação de protocolos de coleta de dados. Os dados coletados serão disponibilizados para o público geral e discutidos. Será realizada avaliação dos participantes e da proposta por meio de questionários.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Coordenador / Andrea Onofre de Araújo - Integrante / Larissa de Araújo Kawabe - Integrante / Amanda Porto do Nascimento - Integrante / Lillian Silva Assunpção - Integrante / Tainara Vasconcelos Ramim - Integrante / Rebeca Venâncio - Integrante / Diana Ribas Rodrigues - Integrante / Juliana Aliano Bloch Fakri - Integrante / Eduardo Roberto Alexandrino - Integrante / André Felipe Barreto de Lima - Integrante / Juliana Silva França - Integrante / Cássio Zocca Zandomenico - Integrante / Juliana Silva Souza Luz - Integrante / Verônica Piñeiro Bouzas de Espirito Santo - Integrante. Número de produções C, T A: 12 / Número de orientações: 3
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
5.   2014-2016. Classificacao de sistemas dinamicos pelas superficies de erros de predicao cruzada: analise da complexidade neural.
Descrição: Neste projeto desenvolveremos estimadores de complexidade para a análise de sinais empíricos não estacionários, baseado no estudo dos erros de predição cruzada. Esses erros são relacionados à mudanças na estrutura de recorrência e na distribuição de probabilidade dos estados. Os estimadores avaliam a componente determinística ou estocástica do mecanismo gerador bem como a componente estacionária ou não estacionária e seus resultados serão comparados com as medidas Lempel-Ziv e expoente de Lyapunov, calculados em sistemas dinâmicos clássicos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: André Ricardo Oliveira da Fonseca - Coordenador / Birajara Soares Machado - Integrante. Financiador(es): Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 1
Membro: Andre Ricardo Oliveira da Fonseca.
6.   2014-2019. Colisao de Eletrons de Baixas Energias com Moleculas que Compoem a Biomassa
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Romarly Fernandes da Costa - Integrante / Marco Aurélio Pinheiro Lima - Integrante / Márcio Teixeira do Nascimento Varella - Integrante / Márcio Henrique de Franco Bettega - Integrante / Maria Cristina Andreolli Lopes - Coordenador / DUQUE, H. V. - Integrante / BRUNGER, M. J. - Integrante / Kate L. Nixon - Integrante / Stephen J. Buckman - Integrante.
Membro: Romarly Fernandes da Costa.
7.   2014-2018. Descoberta the sondas quimicas contra proteinas envolvidas em mecanismos epigeneticos
Descrição: Desenvolvimento de estratégias computacionais para auxiliar na descoberta de sondas químicas contra alvos epigenéticos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Renato Ferreira de Freitas - Integrante / SCHAPIRA, MATTHIEU - Coordenador. Número de produções C, T A: 4
Membro: Renato Ferreira de Freitas.
8.   2014-2016. Desenvolvimento de Metodos de Modelagem Interativa de Cartoons 2.5D com Suporte a Iluminacao
Descrição: Recentemente foi apresentado um método de modelagem e animação de cartoons denominado modelos cartoons 2.5D. O método tem como objetivo, a partir de um conjunto de visões distintas de um modelo cartoon (por exemplo topo, lateral e frente) desenhados em um plano, automaticamente criar efeitos de animação de rotação espacial. Apesar dos resultados promissores do ponto de vista artístico, o método apresenta resultados restritos a objetos com preenchimentos por cores sólidas e sem efeitos de iluminação. No presente projeto propomos o estudo e o desenvolvimento métodos robustos e eficientes de simulação de cartoons 2.5D que remove as limitações de preenchimento com cores sólidas, tornando os desenhos mais ricos em detalhes. Também como parte relevante do projeto está no desenvolvimento de protótipos de interfaces gráficas interativas de modelagem e animação de cartoon 2.5D que considerem as particularidades deste tipo de desenho.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (4) . Integrantes: João Paulo Gois - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Joao Paulo Gois.
9.   2014-2015. Disputas eleitorais no ciberespaco: estudo das redes sociais de internet nas eleicoes presidenciais de 2014 no Brasil
Descrição: O projeto de pesquisa tem como objetivo estudar o comportamento dos usuários das Redes Redes Sociais de Internet (RSI) no contexto das eleições presidenciais de 2014, por meio do desenvolvimento de ferramentas computacionais de estudo de redes complexas. A rápida popularização das Redes Sociais de Internet tem produzido importantes transformações nas relações sociais, criando novas formas de sociabilidade mediadas por computadores. Nesse novo espaço de interação, diversos temas são debatidos por seus usuários que possuem um papel ativo na produção, transmissão e circulação de informações, tornando o processo comunicacional mais fluído e dinâmico. Em época eleitoral, o tema da política invade a vida cotidiana das pessoas e também ganham destaque dentro das RSI. Os militantes, os simpatizantes, as campanhas dos candidatos e mesmo o cidadão comum utilizam esse espaço de interatividade para promover um confronto de informações e contrainformações. Visando compreender o comportamento dos usuários de RSI, a pesquisa pretende desenvolver uma ferramenta computacional de extração e análise de informações de redes sociais voltada para estudar como elas são apropriadas por seus usuários durante a disputa eleitoral. Essa ferramenta tem a finalidade de caracterizar os usuários mais influentes, identificar a participação de grupos políticos e os temas mais populares. Por meio de um viés interdisciplinar, o projeto tem a intenção de contribuir nos estudos sobre comportamento eleitoral e marketing político dentro de uma nova configuração social na qual o ciberespaço se torna um campo de disputa política da Sociedade da Informação.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Fabricio Olivetti de França - Integrante / Denise Hideko Goya - Integrante / Claudio Luis de Camargo Penteado - Coordenador / Bruno Crepaldi Ambrózio - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Fabricio Olivetti de Franca.
10.   2014-2017. Efficient Runtime Environments for Universal Memory Architectures
Descrição: The current technologies for computer memory, DRAM, is reaching its end of life in terms of scalability due to the technology process evolution that requires even smaller memory cells. Nowadays, there is no prototype implementation of DRAM cells below 40nm, while it is already common to have integrated circuits using 32nm transistors and prototypes using 22nm. For this reason hardware designers turned their attention to some alternative memory technologies. Most of these technologies share, however, a common feature. Contrary to DRAM, they are non-volatile, i.e., they are capable of maintaining the stored data without the need for a continuous power supply. Using a non-volatile technology as primary and secondary memories will raise questions on the reason to have two different memories in a system, which lays the foundation to Universal Memory, one simple storage that will hold both current and persistent states. However, current software (low and high-level) is not ready for such a change in memory architectures. The research to make software work correctly on these architectures involves security, operating systems, and runtime environments optimization. This project will research the impact these new memory technologies have on current software as well as propose solutions for an efficient and coherent use of these new memories.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . Integrantes: Emilio de Camargo Francesquini - Integrante / Maurício G. Palma - Integrante / Rodolfo Azevedo - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Número de produções C, T A: 5
Membro: Emilio de Camargo Francesquini.
11.   2014-Atual. Espectroscopias de excitacao eletronica, fotoabsorcao, e decaimento Auger empregadas ao estudo de atomos e moleculas usando radiacao sincrotron na faixa dos raios-X
Descrição: Emprego de radiação síncrotron proveniente das linhas de Luz GALAXIES e LUCIA, do laboratório SOLEIL-França, para estudo dos processos de fotoabsorção, e fotoemissão de átomos e moléculas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alexsandre Figueiredo Lago - Coordenador / Marc Simon - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Alexsandre Figueiredo Lago.
12.   2014-2016. Fotorreatividade e cinetica de formacao de compostos tris-heterolepticos de rutenio(II)
Descrição: Compostos polipiridínicos de rutênio(II) apresentam características favoráveis para serem utilizados em processos de conversão de energia solar, como por exemplo possuir ampla e intensa absorção na região visível do espectro. A engenharia molecular e utilização de ligantes diferentes permitem a sintonização dos níveis de energia destes complexos para que possam executar funções úteis de maneira mais eficiente. Um exemplo é a modulação da transferência fotoinduzida de elétrons, que é o passo inicial para a conversão da luz solar em eletricidade ou em substâncias de maior conteúdo energético. Os compostos tris-heterolépticos de rutênio(II) são bastante interessantes neste contexto, pois estes permitem avaliar como a utilização de diferentes ligantes alteram as suas propriedades globais e permitem a modulação dos seus níveis de energia. O presente projeto insere-se nesse contexto com o objetivo de sintetizar e caracterizar alguns compostos tris-heterolépticos de rutênio(II) do tipo cis-[Ru(RN-phen)(dcbH2)(NCS)2]; R = substituintes doadores ou retiradores de elétrons, dcbH2 = ácido-4,4'-dicarboxílico-2,2'-bipiridina, bem como realizar investigações sobre a fotorreatividade dos compostos preparados visando processos de conversão de energia. Além disso, também é objetivo deste projeto avaliar a influência dos diferentes ligantes na cinética de formação dos compostos e assim melhorar a rota sintética de preparação. Utilizando-se o comportamento da fotorreatividade e da cinética de formação, buscar-se-á racionalizar o efeito do substituinte da 1,10-fenantrolina nestas propriedades. Desta maneira será possível compreender o comportamento das espécies e modular as propriedades necessárias visando a melhor realização das funções desejadas no processo de conversão de energia luminosa em outras formas, como a elétrica ou química.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: André Sarto Polo - Coordenador / Paula Homem de Mello - Integrante / Artur Keppler - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Andre Sarto Polo.
13.   2014-2018. Fisica de Particulas e Campos: Modelo Padrao e suas extensoes
Descrição: O modelo padrão de partículas elementares encontra-se num momento crucial: Existem evidências sobre a existência de um boson de Higgs como era esperado há muito neste modelo, bem como vínculos cada vez mais fortes sobre possíveis extensões do modelo, sendo que os próximos resultados experimentais do acelerador LHC deverão nortear a física de partículas elementares das próximas décadas. A maioria dos tópicos a serem abordados neste projeto se referem às possíveis extensões do modelo que possam vir a ser testadas nos experimentos atuais: a) Existência de novas partículas tais como quarks exóticos, diferentes tipos de neutrinos, partículas pseudo-escalares ultraleves e suas consequências fenomenológicas, b) Alternativas ou extensões do mecanismo de Higgs, tais como novas simetrias por trás do mecanismo ou um sistema de bosons escalares mais complexo e a fenomenologia dos mesmos, c) Aspectos mais formais do modelo padrão, tais como geração de massa e quebra da simetria quiral em teorias de gauge; existência ou não de outras simetrias que sejam violadas (violação de CP forte, violação da invariança de Lorentz, etc...).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Celio Adrega de Moura Junior - Integrante / Adriano Natale - Coordenador / Alex Gomes Dias - Integrante / Alexandre Alves - Integrante / Alysson Fábio Ferrari - Integrante / Celso Chikahiro Nishi - Integrante.
Membro: Celio Adrega de Moura Junior.
14.   2014-2019. Fisica e geometria do espaco-tempo
Descrição: Auxílio à Pesquisa - Temático da FAPESP: 13/09357-9. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (15) / Mestrado acadêmico: (6) / Doutorado: (1) . Integrantes: Maurício Richartz - Integrante / Alberto Saa - Coordenador / Andre Gustavo Scagliusi Landulfo - Integrante / Cecilia Bertoni Martha Hadler Chirenti - Integrante / Javier Fernando Ramos Caro - Integrante / João Paulo Pitelli Manoel - Integrante / Ricardo Antonio Mosna - Integrante / George Matsas - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Mauricio Richartz.
15.   2014-2016. Modelos de Programacao e Algoritmos para a Execucao Eficiente de Aplicacoes Paralelas em Aglomerados Heterogeneos
Descrição: Com o advento de diferentes classes de aceleradores, como as GPUs (Graphical Processing Units) e os Intel MICs (Many Integrated Cores), aglomerados heterogêneos, formados por diferentes tipos de aceleradores e processadores, se tornaram realidade. Estes aglomerados podem ser dedicados ou simplesmente um conjunto de estações de trabalho, distribuídas em diferentes laboratórios e que ficam ociosas durante a maior parte do tempo. As diferenças arquiteturais entre processadores e os diversos tipos de aceleradores tornam difícil o desenvolvimento de aplicações que utilizem estes aglomerados de modo eficiente.A proposta deste projeto consiste em avaliar modelos de programação que facilitem o desenvolvimento e a previsão do desempenho de aplicações para aglomerados heterogêneos. Também será desenvolvido um mecanismo de distribuição dinâmica de carga para estes aglomerados, que serão implementados em uma biblioteca já existente. O objetivo é facilitar tanto a implementação quanto a execução de aplicações para estes aglomerados. Na área de aplicações, serão desenvolvidos algoritmos de bioinformática para a inferência de redes de regulação gênica (Gene Regulatory Networks - GRNs), onde é preciso avaliar um vasto número de combinações de genes candidatos a preditores. Na área de neurociência computacional, será implementado o suporte a aceleradores em simuladores neuronais, como o MOOSE, de modo a permitir a simulação de redes neuronais compostas por milhares de neurônios. Para tal, serão desenvolvidos algoritmos para a solução eficiente de conjuntos de sistemas lineares, que são a base para a simulação de neurônios. Para ambas as áreas, o foco dos esforços será o suporte à execução eficiente em aglomerados heterogêneos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luiz Carlos da Silva Rozante - Integrante / Alfredo Goldman vel Lejbman - Integrante / CAMARGO, RAPHAEL Y. - Coordenador / Daniel Cordeiro - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Luiz Carlos da Silva Rozante.
16.   2014-Atual. Otimizacao das propriedades eletronicas de oxidos metalicos para aplicacao em celulas foto-eletroquimicas
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Cedric Rocha Leão - Coordenador / LI, YAT - Integrante / José Antônio de Souza - Integrante. Financiador(es): Universidade Federal do ABC - Bolsa.Número de orientações: 1
Membro: Cedric Rocha Leao.
17.   2014-Atual. Percepcao de causalidade e agencia em campos-Poisson
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Peter Maurice Erna Claessens - Coordenador / Cravo, Andre M. - Integrante / Manasses Pereira Nóbrega - Integrante.
Membro: Peter Maurice Erna Claessens.
18.   2014-2017. Predicao da morfologia de cristais com o uso de simulacoes de dinamica molecular
Descrição: As indústrias farmacêuticas estão interessadas na possibilidade de prever a morfologia dos cristais de forma a otimizar o processo de produção de medicamentos. Na verdade, antes de sua utilização em formas de dosagens sólidas, é necessário compreender e caracterizar as propriedades físicas e químicas do insumo farmacêutico ativo, excipientes e suas misturas em pó, incluindo, entre outras possibilidades, hábito cristalino e tamanho das partículas. A morfologia de um sólido farmacêutico é de grande importância uma vez que esta propriedade pode influenciar as propriedades dos ingredientes farmacêuticos ativos, que podem variar entre diferentes formas polimórficas do fármaco. A forma amorfa de um fármaco tem o ponto de fusão mais baixo e, geralmente, uma taxa de dissolução mais rápida, podendo levar a problemas indesejados de reação ou degradação. De acordo com Bernstein ? que avaliou a evolução do conceito de polimorfismo, sugerido há mais de um século ? a definição mais adequada de um polimorfo é aquela dada por McCrone, em 1965: "A fase sólida cristalina de um dado composto resultante da possibilidade de pelo menos duas disposições diferentes das moléculas daquele composto no estado sólido". Para o caso mais específico dos fármacos, em 1982, Byrn atribuiu uma definição semelhante de polimorfismo como sendo: "as diferentes estruturas cristalinas em que um composto pode cristalizar. Polimorfos são normalmente caracterizados por seus grupos espaciais e parâmetros de rede". A última definição, fornecida pela FDA (U.S. Food and Drug Administration), sobre materiais cristalinos é: "formas cristalinas com diferentes arranjos e/ou conformações das moléculas na rede cristalina". Qualquer que seja a definição, é de comum acordo que uma descrição completa do polimorfismo na fase molecular, o qual é baseado nas diferenças de empacotamento cristalino, deve ser feita. O presente projeto de pesquisa tem por objetivo realizar a predição da morfologia cristalina com o uso de modelagem computacional baseada em dinâmica molecular (DM). Os resultados obtidos serão comparados com imagens obtidas em microscópio óptico (MO). Além disso, dados de difração de raios X serão obtidos e as estruturas de diversos polimorfos, que não possuem uma descrição na literatura, serão determinadas. Os parâmetros de deslocamento atômico serão então correlacionados com os resultados obtidos da simulação computacional.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / AMANDA LAURA IBIAPINO - Integrante / Juliana Alves Pereira Sato - Integrante / Francesco Punzo - Integrante / DE FIGUEIREDO, LAYSA PIRES - Integrante / Fanny Nascimento Costa - Integrante / Rondes Ferreira da Silva - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 4
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
19.   2014-2015. Primeiros Projetos: Dinamica Molecular ab initio fora do equilibrio aplicada a interfaces agua/solido: uma nova abordagem no estudo de processos eletroquimicos
Descrição: The objective of this proposal is to properly describe, using rst principles molecular dynamics simulations, the dynamics of a combined surface/water system both in the presence and absence of an external bias potential applied to the electrodes, as one would come across in electrochemistry. This will be accomplished using a combination of density functional theory (DFT) and non-equilibrium Green's functions methods (NEGF). While standard DFT methods are not suited to treat extended system under an external bias, NEGF has been designed to treat out-of-equilibrium situations. Their combination has been developed over the past few years to describe current-voltage characteristics of nanoscopic systems. It treats an open system under the in hence of an external bias, and albeit dynamics is typically ignored in such systems, it can be incorporated into the methodology. This is what we plan to do, in such a way that, by the end of this project we will provide a computational tool to simulate an electrochemical cell.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Luana Sucupira Pedroza - Coordenador / Alexandre Reily Rocha - Integrante.
Membro: Luana Sucupira Pedroza.
20.   2014-Atual. Redes Bayesianas na modelagem de processos cognitivos
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Peter Maurice Erna Claessens - Coordenador / Narges Jangholi - Integrante / Iman Ghodrati Toostani - Integrante / Tanit Ganz Sanchez - Integrante.
Membro: Peter Maurice Erna Claessens.
21.   2014-2017. Sensores/(bios)sensores como ferramentas eletroanaliticas para deteccao, quantificacao e remocao de contaminantes emergentes
Descrição: Pretende-se desenvolver sensores e/ou (bios)sensores eletroquímicos à base de compostos de carbono (nanotubos ou grafeno), nanomateriais (nanopartículas de ouro, platina, prata, etc.), compostos inorgânicos e/ou um elemento biológico (proteína, enzima ou anticorpo) para reconhecimento do analito, de acordo com a experiência da equipe de pesquisadores deste projeto e desenvolver metodologias de degradação por meio de PEOA usando diferentes materiais eletródicos com ou sem irradiação, para aplicação na detecção e remoção de poluentes ambientais. Por outro lado, a interação entre pesquisadores experimentais e teóricos tem trazido grandes contribuições para o conhecimento aprofundado sobre estruturas moleculares e reações químicas. Entretanto, no geral, não é possível simular todos os aspectos envolvidos nos complexos sistemas experimentais. Dessa forma, faz-se necessária a construção de modelos computacionais que dividam o problema experimental em diferentes contribuições. A construção desses modelos e a seleção das principais variáveis a serem avaliadas não é trivial, sendo necessária a participação de uma equipa multidisciplinar para equacionar esse problema. Uma vez proposto o modelo e as propriedades relevantes para auxiliar na compreensão do problema, é possível selecionar dentre uma gama de métodos computacionais, baseados em Mecânica Quântica ou em Dinâmica Molecular. Envolve a colaboração entre UFC, UFABC, UERN e o Instituto Superior de Engenharia do Porto (Portugal).. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paula Homem-de-Mello - Integrante / Hugo Barbosa Suffredini - Integrante / BECKER, HELENA - Integrante / CORREIA, ADRIANA N. - Coordenador / DE LIMA-NETO, PEDRO - Integrante / Michele Aparecida Salvador - Integrante / Camila Pinheiro Souza - Integrante / Simone Morais - Integrante / Suely Souza Leal de Castro - Integrante.
Membro: Paula Homem-de-Mello.
22.   2014-2017. Simulacao de Produtos de Oxidacao de Colesterol em Membranas Lipidicas
Descrição: A oxidação não-enzimática do colesterol leva à formação de oxisteróis, os quais estão envolvidos em estados patofisiológicos como a arterosclerose e a neurodegeneração. Os efeitos citotóxicos e apoptóticos de oxisteróis podem ser parcialmente atribuídos à sua influência sobre as propriedades biofísicas de membranas fosfolipídicas. Além disso, eles são capazes de se translocar entre membranas e de disseminar dano oxidativo. Todas estas capacidades estão fortemente relacionadas com a estrutura química dos oxisteróis, embora os mecanismos moleculares subjacentes ainda não sejam completamente compreendidos. Popomos aqui um estudo de simulação molecular do efeito de diferentes oxisteróis, especialmente de hidroperóxidos de colesterol, nas propriedades biofísicas de membranas fosfolipídicas. Serão procuradas as relações estrutura-propriedade que possam contribuir para uma melhor compreensão dos efeitos da oxidação de membranas tanto por radicais como por oxigênio singlete.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Rodrigo Maghdissian Cordeiro - Coordenador.
Membro: Rodrigo Maghdissian Cordeiro.
23.   2014-2018. Terapia fotodinamica: desenvolvimento de novos fotossensibilizadores a partir de simulacoes de primeiros principios
Descrição: Projeto Universal CNPq. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Paula Homem-de-Mello - Coordenador / FELIPE CESAR TORRES ANTONIO - Integrante / Mateus Zanotto - Integrante / Camila R. Vieira - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 4
Membro: Paula Homem-de-Mello.

2013

1.   2013-Atual. "Estudo da biodiversidade de bacterias simbiontes de ciliados marinhos e de agua doce no estado do Rio de Janeiro?
Descrição: Resumidamente, este projeto de cunho multidisciplinar e com temática de grande relevância nacional tem como principal objetivo, aprofundar o conhecimento a respeito das interações entre bactérias simbiontes e protistas ciliados, realizando de uma forma geral, uma análise da biodiversidade de bactérias em associação com estes protozoários e de uma forma mais específica, identificar bactérias patogênicas ou potencialmente patogênicas ao Homem e a outros animais, que utilizam ciliados como seus reservatórios naturais. Neste trabalho protozoários ciliados estão sendo coletados em diferentes ambiêntes impactados e livres de influência antropogênica como rios, riachos, estuários, manguezais e marinho; e caracterizados molecular e morfológicamente. Bactérias simbiontes estão sendo identificadas e caracterizadas por ensáios de FISH (hibridização in situ com fluorescência), microscopia eletrônica de transmissão e varredura, por sequenciamento e análise filogenéticas do 16S rDNA. Com isso esperamos revelar um pouco da biodiversidade de bactérias simbiontes de protistas ciliados e clarificar o seu potencial para atuar como reservatório natural de bactérias patogênicas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Marcus Vinicius Xavier Senra - Coordenador / Roberto Junio P. Dias - Integrante / Inácio Silva Neto - Integrante / Carlos Augusto Gomes Soares - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Marcus Vinicius Xavier Senra.
2.   2013-2015. Aglomerados de GPUs em Simulacoes de Modelos Biologicos
Descrição: Inferência de redes de regulação gênica (GRNs) é um importante problema da bioinformática --- com várias aplicações em biologia de sistemas --- no qual tenta-se deduzir as interações entre genes a partir de dados de expressão gênica, como por exemplo dados de microarray ou RNA-Seq. Métodos de seleção de características podem ser aplicados neste problema. Um método de seleção de características é composto por duas partes: um algoritmo de busca e uma função critério. No contexto desse projeto, trataremos de uma técnica já bem estabelecida na literatura para inferência de GRNs, baseada em seleção de características, e que usa busca exaustiva como algoritmo de busca e entropia condicional média como função critério. Busca exaustiva tem a vantagem de sempre retornar o melhor subconjunto de características, mas é computacionalmente inviável na maioria das situações, o que torna soluções baseadas em computação de alto-desempenho atraentes; entretanto, plataformas de alto-desempenho tradicionais são ainda caras e de difícil manutenção. O objetivo deste trabalho é desenvolver uma solução paralela de custo relativamente baixo --- baseada na arquitetura GPU/CUDA --- para busca exaustiva. CUDA é uma arquitetura paralela de propósito geral com um novo modelo de programação paralela que permite que as GPUs da NVIDIA resolvam problemas complexos de forma mais eficiente a um custo relativamente baixo. Essa solução deverá ser capaz de executar em aglomerados de GPUs, isto é, em múltiplas máquinas (heterogêneas ou não) com múltiplas GPUs cada uma; além disso, deverá também ser capaz de detectar automaticamente as características (número de SMs, tamanho da memória local, etc) de cada componente do aglomerado, de modo a otimizar, também automaticamente, a distribuição da carga de trabalho entre as diversas máquinas e GPUs. Essa solução exigirá o desenvolvimento de técnicas -- em especial no que diz respeito a estratégias para gerência do tráfego entre as memórias local e global dos dispositivos -- que poderão ser utilizadas em outros problemas combinatórios, com uma vasta gama de aplicações.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Luiz Carlos da Silva Rozante - Integrante / de Camargo, Raphael Y. - Coordenador / David Correa Martins Jr. - Integrante / F. F. Borelli - Integrante.
Membro: Luiz Carlos da Silva Rozante.
3.   2013-2014. Aquisicao de criostato circuito fechado de Helio para difracao de Raios-X
Descrição: Subprojeto proposto e aprovado no Edital No 27/2013 - Pró-Equipamentos CAPES (Programa de Pós-Graduação em Física) relativo a aquisição de acessório a ser instalado em equipamento de uso compartilhado na Central Experimental Multiusuária. As informações de uso do equipamento bem como o agendamento podem ser obtidas no site http://propes.ufabc.edu.br/cem/crbst_1.html.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Herculano da Silva Martinho - Coordenador. Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Auxílio financeiro.
Membro: Herculano da Silva Martinho.
4.   2013-2015. Auto-organizacao hierarquica de peptideos anfifilicos: mecanismos fundamentais e potenciais aplicacoes - FAPESP (Proc. No. 2013/12997-0)
Descrição: Propomos a síntese e caracterização de novas nanoestruturas peptídicas, a partir de reações de auto-organização. Serão preparadas sequências peptídicas inéditas do tipo bola-anfifílicos e lipopeptídicos. A escolha por essas classes reside no rico polimorfismo de mesofases que elas são capazes de formar e na sua capacidade de estabelecer biointerfaces por meio de operações de reconhecimento molecular, ampliando significativamente seu leque de aplicações. Estudaremos a formação desses sistemas e os tipos de interações presentes em sua construção.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (11) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Integrante / WENDEL ANDRADE ALVES - Coordenador / Alexandre Reily Rocha - Integrante / Emerson R. Silva - Integrante / Eudes Eterno Fileti - Integrante / Cristiano Luis Pinto de Oliveira - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
5.   2013-2016. Determinacao da estrutura cristalina de farmacos com o uso da difracao de raios x por policristais
Descrição: Fármacos policristalinos podem apresentar polimorfismo (propriedade de uma substância de se cristalizar em mais de uma forma ou estrutura cristalina), levando, por exemplo, a diferenças de solubilidade, afetando diretamente a biodisponibilidade e, consequentemente, a sua eficácia. A difração de raios X por policristais é uma poderosa técnica usada na caracterização estrutural de materiais diversos. Aliada ao método de Rietveld, a quantificação de fases em estruturas cristalinas, bem como o refinamento das mesmas, são obtidos de maneira bastante confiável. Entretanto, este procedimento só tem sucesso quando a estrutura cristalina é conhecida. Neste projeto de pesquisa serão utilizados métodos de espaço direto para determinação da estrutura cristalina de diversos fármacos usando dados de difração de raios X por policristais. A estrutura final será, então, refinada pelo método de Rietveld. Até o presente momento, diversas estruturas já foram determinadas com sucesso em nosso grupo de pesquisa.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
6.   2013-2017. Fotossensibilizacao nas Ciencias da Vida
Descrição: Fotossensibilização ocorre quando compostos fotoativos absorvem luz e a transferem para moléculas vizinhas, de tal forma que a energia luminosa é transformada em química. A natureza utiliza os processos de fotossensibilização de forma organizada e controlada. No entanto, estes processos podem ficar descontrolados, gerando espécies reativas, que causam danos em células em tecidos, por exemplo, na pele do ser humano que se expõem demasiadamente ao sol. O homem aprendeu a utilizar esta geração foto-induzida de espécies excitadas e reativas para destruir células e tecidos doentes e consequentemente tratar diversas doenças, em um processo denominado Terapia Fotodinânica (PDT, do inglês Photodynamic Therapy). Neste projeto pretendemos entender no nível molecular os mecanismos de fotossensibilização que atuam durante a PDT ou durante a exposição exagerada ao sol, utilizando diversos modelos de estudo: os ambientes e técnicas computacionais, os sólidos e as soluções de compostos e nanomateriais purificados, os modelos biomiméticos, as células em cultura, modelos animais e estudos clínicos em pacientes. Estes modelos de estudo são normalmente utilizados/dominados por pesquisadores com especialidades em disciplinas distintas, ou seja, física, química, biologia, bioquímica, farmácia e medicina, que neste projeto formarão uma equipe para tratar o tema das reações de fotossensibilização de maneira multidisciplinar, formando um ambiente ideal para o treinamento de graduandos, pós-graduandos, pós-doutores e jovens pesquisadores. Além disso, a colaboração com instituições clínicas permitirá que alguns destes conhecimentos sejam rapidamente aplicados na prática clínica trazendo benefícios imediatos para a sociedade. Para alcançar estes objetivos dividimos este projeto em quatro sub-projetos, que são: estudo dos mecanismos da PDT, síntese de novos fotossensibilizadores para PDT, caracterização dos mecanismos de fotossensibilização induzidos por UVA, resposta aos processos de fotossensibilização em animais e humanos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (4) . Integrantes: Ronei Miotto - Integrante / Maurício da Silva Baptista - Coordenador / Maurício Domingues Coutinho Neto - Integrante / Paula Homen de Mello - Integrante / Rosangela Itri - Integrante / Armando Corbani Ferraz - Integrante / CORDEIRO, RODRIGO M. - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 2 / Número de orientações: 1
Membro: Ronei Miotto.
Descrição: Fotossensibilização ocorre quando compostos fotoativos absorvem luz e a transferem para moléculas vizinhas, de tal forma que a energia luminosa é transformada em química. A natureza utiliza os processos de fotossensibilização de forma organizada e controlada. No entanto, estes processos podem ficar descontrolados, gerando espécies reativas, que causam danos em células em tecidos, por exemplo, na pele do ser humano que se expõem demasiadamente ao sol. O homem aprendeu a utilizar esta geração foto-induzida de espécies excitadas e reativas para destruir células e tecidos doentes e consequentemente tratar diversas doenças, em um processo denominado Terapia Fotodinânica (PDT, do inglês Photodynamic Therapy). Neste projeto pretendemos entender no nível molecular os mecanismos de fotossensibilização que atuam durante a PDT ou durante a exposição exagerada ao sol, utilizando diversos modelos de estudo: os ambientes e técnicas computacionais, os sólidos e as soluções de compostos e nanomateriais purificados, os modelos biomiméticos, as células em cultura, modelos animais e estudos clínicos em pacientes. Estes modelos de estudo são normalmente utilizados/dominados por pesquisadores com especialidades em disciplinas distintas, ou seja, física, química, biologia, bioquímica, farmácia e medicina, que neste projeto formarão uma equipe para tratar o tema das reações de fotossensibilização de maneira multidisciplinar, formando um ambiente ideal para o treinamento de graduandos, pós-graduandos, pós-doutores e jovens pesquisadores. Além disso, a colaboração com instituições clínicas permitirá que alguns destes conhecimentos sejam rapidamente aplicados na prática clínica trazendo benefícios imediatos para a sociedade. Para alcançar estes objetivos dividimos este projeto em quatro sub-projetos, que são: estudo dos mecanismos da PDT, síntese de novos fotossensibilizadores para PDT, caracterização dos mecanismos de fotossensibilização induzidos por UVA, resposta aos processos de fotossensibilização em animais e humanos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Rodrigo Maghdissian Cordeiro - Integrante / BAPTISTA, MAURÍCIO S. - Coordenador / Ronei Miotto - Integrante / Mauricio Domingues Coutinho Neto - Integrante / Paula Homem de Mello - Integrante / Rosangela Itri - Integrante / Armando Corbani Ferraz - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Rodrigo Maghdissian Cordeiro.
Descrição: Neste projeto pretendemos entender no nível molecular os mecanismos de fotossensibilização que atuam durante a PDT (terapia fotodinâmica) ou durante a exposição exagerada ao sol, utilizando diversos modelos de estudo: os ambientes e técnicas computacionais, os sólidos e as soluções de compostos e nanomateriais purificados, os modelos biomiméticos, as células em cultura, modelos animais e estudos clínicos em pacientes. Estes modelos de estudo são normalmente utilizados/dominados por pesquisadores com especialidades em disciplinas distintas, ou seja, física, química, biologia, bioquímica, farmácia e medicina, que neste projeto formarão uma equipe para tratar o tema das reações de fotossensibilização de maneira multidisciplinar, formando um ambiente ideal para o treinamento de graduandos, pós-graduandos, pós-doutores e jovens pesquisadores. Além disso, a colaboração com instituições clínicas permitirá que alguns destes conhecimentos sejam rapidamente aplicados na prática clínica trazendo benefícios imediatos para a sociedade. Para alcançar estes objetivos dividimos este projeto em quatro sub-projetos, que são: estudo dos mecanismos da PDT, síntese de novos fotossensibilizadores para PDT, caracterização dos mecanismos de fotossensibilização induzidos por UVA, resposta aos processos de fotossensibilização em animais e humanos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paula Homem-de-Mello - Integrante / Ronei Miotto - Integrante / Coutinho-Neto, Maurício Domingues - Integrante / Rodrigo M. Cordeiro - Integrante / Mauricio da Silva Baptista - Coordenador / Luís Gustavo Dias - Integrante / Rosangela Itri - Integrante / Armando Corbani Ferraz - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Paula Homem-de-Mello.
7.   2013-Atual. Implantacao de Infraestrutura em Novo Campus e Consolidacao da Pesquisa Interdisciplinar na UFABC
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcio Gustavo Di Vernieri Cuppari - Coordenador / Humberto Naoyuki Yoshimura - Integrante / Sydney Ferreira Santos - Integrante / Renato Altobelli Antunes - Integrante / Everaldo Carlos Venâncio - Integrante / Carlos Triveño Rios - Integrante / José Fernando Queiruga Rey - Integrante / Marcela Sorelli Carneiro Ramos - Integrante / Alejandro Andres Zuniga Paez - Integrante / Alexandre José Castro Lanfredi - Integrante / Daniel Zanetti de Florio - Integrante.
Membro: Marcio Gustavo Di Vernieri Cuppari.
8.   2013-2015. Inferencia de GRNs em Aglomerados de GPUs
Descrição: O objetivo deste trabalho é desenvolver uma solução paralela - baseada na arquitetura GPU/CUDA - para o problema de inferência de GRNs através da aplicação do problema do Hitting Set, que é um problema equivalente ao do Set Cover. Essa solução deverá ser capaz de executar em aglomerados de GPUs, isto é, em múltiplas máquinas (heterogêneas ou não) com múltiplas GPUs cada uma; além disso, deverá também ser capaz de detectar automaticamente as características (número de SMs, tamanho da memória local, etc) de cada componente do aglomerado, de modo a otimizar, também automaticamente, a distribuição da carga de trabalho entre as diversas máquinas e GPUs. Essa solução exigirá o desenvolvimento de técnicas em especial no que diz respeito a estratégias para gerência do tráfego entre as memórias local e global dos dispositivos que poderão ser utilizadas em outros problemas combinatórios, com uma vasta gama de aplicações. Os experimentos serão realizados com diferentes combinações das seguintes máquinas: a) 4 máquinas hive com 2 placas gtx 680, processador intel i7 3930k e 32G de RAM; b) 1 máquina montada com 12G de RAM e com 2 placas de video GTX 295 cada contendo dois chips, totalizando 4 GPUS e c) dois servidores Supermicro modelo 7047GR-TPRF, sendo cada servidor possui 4 GPUs Tesla K20X com 2688 cores e 6G de RAM.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Luiz Carlos da Silva Rozante - Coordenador / de Camargo, Raphael Y. - Integrante / Song, Siang W. - Integrante / David Correa Martins Jr. - Integrante / Francisco Eloi Soares de Araujo - Integrante / Marco Aurélio Stefanes - Integrante / BORELLI, FABRIZIO F - Integrante / Danilo Carastan dos Santos - Integrante.
Membro: Luiz Carlos da Silva Rozante.
9.   2013-2013. Modelos analogos: superradiancia e estabilidade
Descrição: Bolsa de pesquisa no exterior - FAPESP 2013/15748-0.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maurício Richartz - Coordenador / LIBERATI, STEFANO - Integrante / Silke Weinfurtner - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Mauricio Richartz.
10.   2013-Atual. Navegacao de um Robo Vigilante em Ambientes Desconhecidos
Descrição: Embora a grande maioria dos robôs atuais sejam manipuladores industriais, nas últimas décadas, surgiram robôs de aplicações não convencionais conhecidos como os robôs de serviços. Este tipo de robô executa tarefas de forma autônoma ou parcialmente, além de serem úteis ao bem estar do homem em diversas situações. Por exemplo, no resgate, na vigilância e na realização de tarefas em locais de difícil acesso. Sendo assim, este projeto de pesquisa visa estudar e implementar alguma técnica de navegação autônoma em ambientes desconhecidos utilizando a plataforma robótica RoboDeck que terá o papel de um robô vigilante. Pode-se citar as Redes Neurais, Odometria, Filtro de Kalman, Visão Computacional, entre outras.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maria das Graças Bruno Marietto - Integrante / Wagner Tanaka Botelho - Coordenador.
Membro: Maria das Gracas Bruno Marietto.
11.   2013-Atual. NUVEM - Nucleo Estrategico de Universos Virtuais, Entretenimento e Mobilidade
Descrição: O Núcleo Estratégico de Universos Virtuais, Entretenimento e Mobilidade (NUVEM) tem o objetivo de produzir novos conhecimentos, formar recursos humanos de alto nível e gerar soluções inovadoras e interdisciplinares em áreas relacionadas com as Tecnologias de Informação e Comunicação (TICs) e suas interações com demandas da sociedade, como melhoria da qualidade de vida dos cidadãos e sustentabilidade.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: João Paulo Gois - Integrante / André Guilherme Ribeiro Balan - Integrante / Harlen Costa Batagelo - Integrante / Ronaldo Cristiano Prati - Integrante / Carlos Alberto Kamienski - Coordenador / Claudio Penteado - Integrante / Itana Stiubiener - Integrante / Helio Waldman - Integrante / Celso Setsuo Kurashima - Integrante / Denise Hideko Goya - Integrante / Fabricio Olivetti de França - Integrante / Gustavo Sousa Pavani - Integrante / Jesus Mena-Chalco - Integrante / João Henrique Kleinschmidt - Integrante / Juliana Cristina Braga - Integrante / Luiz Henrique Bonani - Integrante / Sergio Amadeu de Oliveira - Integrante.
Membro: Joao Paulo Gois.
Descrição: O Núcleo Estratégico de Universos Virtuais, Entretenimento e Mobilidade (NUVEM) tem o objetivo de produzir novos conhecimentos, formar recursos humanos de alto nível e gerar soluções inovadoras e interdisciplinares em áreas relacionadas com as Tecnologias de Informação e Comunicação (TICs) e suas interações com demandas da sociedade, como melhoria da qualidade de vida dos cidadãos e sustentabilidade.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Fabricio Olivetti de França - Coordenador / Gustavo Sousa Pavani - Integrante / Ronaldo Cristiano Prati - Integrante / João Paulo Góis - Integrante / Carlos Alberto Kamienski - Integrante / Claudio Penteado - Integrante / Itana Stiubiener - Integrante / Helio Waldman - Integrante / André Guilherme Balan - Integrante / Celso Setsuo Kurashima - Integrante / Denise Hideko Goya - Integrante / Fabiana Soares Santana - Integrante / Harlen Costa Batagelo - Integrante / Jesus Mena-Chalco - Integrante / João Henrique Kleinschmidt - Integrante / Juliana Cristina Braga - Integrante / Luiz Henrique Bonani - Integrante / Sergio Amadeu de Oliveira - Integrante.
Membro: Fabricio Olivetti de Franca.
12.   2013-Atual. O papel das interacoes fonon-fonon em sistemas de alta anarmonicidade
Descrição: Duas transições de fase dinâmicas de caráter universal tem sido recentemente observadas em macromoléculas (lisozima, mioglobina, bacteriorodopsina, DNA e RNA) nas temperaturas TD ~ 180 - 220 K e T* ~100 K. A primeira representa o limiar de atividade biológica e a transição de um regime dinâmico anarmônico para harmônico para o movimento das biomoléculas hidratadas. A segunda representa o limiar para uma transição harmônica secundária. Apesar de sua relevância, é ausente uma completa compreensão da natureza destas transições e as suas conseqüências para a bio-atividade de macromoléculas. Especificamente, podemos citar como importantes pontos em aberto (i) a natureza dos mecanismos de relaxação envolvidos nas diversas interações moleculares e como eles dependem do nível de hidratação; (ii) a natureza termodinâmica das transições envolvidas; (iii) a dependência de TD e T* com o nível de hidratação e a complexidade estrutural da biomolécula envolvida; (iv)o papel das interações fônon-fônon e as contribuições relativas oriundas das anarmonicidades intrínseca e extrínseca; (v) o papel da vizinhança local do sítio das águas; (vi) como os pontos acima alteram-se quando consideram-se isômeros ópticos não ativos biologicamente (forma dextrógira). No presente projeto temos como objetivo contribuir para a elucidação das questões levantadas acima escolhendo como objeto de estudo os isômeros ópticos (levógiros e dextrógiro), bem como a mistura racêmica, dos aminoácidos cisteína (C3H7NO2S), cistina (C6H12N2O4S2), prolina (C5H9NO2) e hidroxiprolina (C5H9NO3) em vários níveis de hidratação. A metodologia empregada consiste em estudar as propriedades termodinâmicas (calor específico), estruturais (difração de Raios-X) e espectro de fônons ativos em Raman em função da temperatura (10-300 K), em conjunto com simulações computacionais (cálculos DFT) das propriedades físicas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Herculano da Silva Martinho - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Herculano da Silva Martinho.
13.   2013-2017. Projeto Tematico FAPESP: Estudo e Desenvolvimento de Novos Materiais Avancados: Eletronicos, Magneticos e Nanoestruturados - Uma Abordagem Interdisciplinar
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (8) / Doutorado: (6) . Integrantes: Gustavo Martini Dalpian - Integrante / Carlos Rettori - Coordenador / Flávio Leandro de Souza - Integrante / Marcos de Abreu Ávila - Integrante / Raquel de Almeida Ribeiro - Integrante / Leticie Mendonça Ferreira - Integrante / Pascoal Jose Giglio Pagliuso - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Gustavo Martini Dalpian.
14.   2013-Atual. Protistas ciliados da subclasse Peritrichia Stein, 1859 ocorrentes em ambientes aquaticos da Zona da Mata Mineira: Caracterizacao multidisciplinar, filogenia molecular e biomonitoramento
Descrição: A presente proposta tem como objetivo consolidar e atualizar o conhecimento do nosso grupo de pesquisa sobre a diversidade morfológica e molecular de protistas ciliados peritríqueos (Ciliophora, Peritrichia) em sistemas lóticos no Estado de Minas Gerais com o intuito de detectar possíveis espécies indicadoras da qualidade da água. O projeto propõe redirecionar e ampliar nossa linha de pesquisa sobre biodiversidade de protistas ciliados usando o diagnóstico molecular destes microorganismos com a finalidade da aplicação deste conhecimento no monitoramento de ecossistemas de águas correntes superficiais. objetiva ainda a formação de pesquisadores em áreas com escassez de profissionais que são a taxonomia e ecologia de protistas ciliados. A presente proposta é de grande relevância uma vez que ampliará o escasso conhecimento sobre a diversidade de ciliados peritríqueos na região neotropical, além de investigar uma nova metodologia de gerenciamento dos sistemas lóticos. O desenvolvimento de tecnologias para o gerenciamento dos recursos hídricos é um dos grandes desafios que o desenvolvimento econômico enfrentará no presente século. Sendo assim, é evidente a importância de estudos que busquem detectar possíveis organismos indicadores utilizando uma abordagem multidisciplinar. Os estudos sobre protistas ciliados indicadores da qualidade da água realizados por nosso grupo de pesquisa vêem sendo patrocinados com bolsas de iniciação científica e aprovação de projetos de pesquisa (CNPq, CAPES e FAPEMIG). Os estudos sobre os protozoários ciliados em um córrego urbano no município de Juiz de Fora iniciaram em 2002 e vêem sendo patrocinados pelo Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) com bolsas de iniciação científica (2002/2003; 2003/2004; 2005/2006 e 2006/2007). Em 2007, nosso grupo de pesquisa obteve recurso (PPM/FAPEMIG/2007-2009) para estudar o potencial de ciliados epibiontes de invertebrados como indicadores da qualidade da água no mesmo córrego. Em 2009, nosso grupo de pesquisa obteve financiamento (PPM/FAPEMIG/2009-2011) para investigar a diversidade morfológica e o potencial dos ciliados peritríqueos como indicadores da qualidade em doze córregos que compõem a Bacia do rio Paraibuna, no município de Juiz de Fora, Minas Gerais. Pretende-se, com o desenvolvimento da presente proposta, realizar uma caracterização multidisciplinar das espécies de ciliados peritríqueos presentes em alguns rios, ribeirões, córregos, lagos e tanques de bromélias ocorrentes na Zona da Mata Mineira e testar uma possível nova metodologia de avaliação da qualidade da água usando informações sobre a composição e estrutura da taxocenose de ciliados peritríqueos por meio do diagnóstico morfológico e molecular em conjunto, abordagem esta inédita em âmbito internacional. Nosso grupo de pesquisa tem realizado estudos sobre o uso dos ciliados como indicadores da qualidade da água (Dias et al., 2008a), e sobre ecologia básica de ciliados peritríqueos (Dias et al., 2006; 2007; 2008a,b; 2009a,b; 2010; Cabral et al., 2010) e pretende ampliar e investir nesta linha de pesquisa.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcus Vinicius Xavier Senra - Coordenador / Inácio domingos da silva neto - Integrante / Roberto Junio P. Dias - Integrante / Marta Tavares d`Agosto - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Marcus Vinicius Xavier Senra.
15.   2013-2016. Robotica Educacional: Apoio a Abertura de Possibilidades Interdisciplinares, Motivacionais e Criativas em Disciplinas na Area de Computacao
Descrição: A utilização da Robótica Educacional como ferramenta de auxílio no processo de ensino-aprendizagem permite aos estudantes desenvolverem capacidades relacionadas à elaboração de hipóteses, busca de soluções, estabelecimento de relações, entre outras. O grande desafio é proporcionar momentos nos quais os alunos aprendem a trabalhar em equipe, a buscar por soluções criativas e idéias novas para situações-problema, identificar e compreender um conceito, levantar hipóteses e confrontá-las com a dos colegas, respeitando e valorizando a função de cada um na equipe, são condições necessárias para a formação e a construção do cidadão e de suas competências. A literatura mostra que trabalhos e projetos desenvolvidos nesse contexto estão trazendo resultados satisfatórios e mostrando que a Robótica Educacional é um bom instrumento capaz de estimular o desenvolvimento do conhecimento científico e tecnológico. Diante disso, este projeto de pesquisa vem propor a utilização da Robótica Educacional utilizando vários kits, no desenvolvimento de experimentos relacionados ao ensino de conteúdos nas disciplinas na área da Computação.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Maria das Graças Bruno Marietto - Integrante / Wagner Tanaka Botelho - Coordenador. Número de orientações: 1
Membro: Maria das Gracas Bruno Marietto.
16.   2013-2016. Transformacoes de fases em ligas Fe-Ni-C: estudos experimentais e computacionais
Descrição: Projeto de cooperação internacional Brasil-França desenvolvido no âmbito do convênio CAPES/COFECUB com o objetivo de realizar estudos experimentais e téorico-computacionais das transformações de fases em aços com teores variáveis de níquel e carbono. Os trabalhos experimentais utlizarão prioritariamente técnicas não-destrutivas para caracterizar essas transformações, com foco na transformação martensítica, a saber: medida do ruído de Barkhausen, dilatometria, variação do potencial termoelétrico. Simulações computacionais multi-escala, por sua vez, envolverão desde cálculos de primeiros princípios até simulações do tipo campo de fase ("phase field"), passando por simulações do tipo dinâmica molecular e Monte Carlo cinetico, com o intuito de modelar transformações de fases com e sem difusão nas ligas de interesse.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . Integrantes: Roberto Gomes de Aguiar Veiga - Integrante / Michel Perez - Integrante / Charlotte Becquart - Integrante / Hélio Goldenstein - Coordenador / Helena Petrilli - Integrante / Marcio Gustavo Di Vernieri Cuppari - Integrante / Andre Paulo Tschiptschin - Integrante / Alexandre Legris - Integrante / Ludovic Thuinet - Integrante / Julien Morthomas - Integrante / Paula Fernanda da Silva Farina - Integrante / Xavier Kleber - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Cooperação / COFECUB - Cooperação.
Membro: Roberto Gomes de Aguiar Veiga.
Descrição: Projeto de cooperação internacional Brasil-França desenvolvido no âmbito do convênio CAPES/COFECUB com o objetivo de realizar estudos experimentais e téorico-computacionais das transformações de fases em aços com teores variáveis de níquel e carbono.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcio Gustavo Di Vernieri Cuppari - Integrante / Hélio Goldenstein - Coordenador / Charlotte BECQUART - Integrante / Roberto Gomes de Aguiar Veiga - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Marcio Gustavo Di Vernieri Cuppari.

2012

1.   2012-2016. Agregacao de Fenotiazinas e Porfirinas, em Meios Homogeneo e Microheterogeneo
Descrição: O plano de pesquisa em apreço é um projeto na área de química teórica com vários temas interligados. Os resultados a serem obtidos permitirão um melhor entendimento do processo agregacional envolvido nas substâncias que podem ser utilizadas como fármacos em Terapia Fotodinâmica. O plano de trabalho inclui estudos básicos e estudos aplicados. O objetivo deste projeto é o estudo de base dos fenômenos envolvidos nos sistemas de trabalho envolvendo drogas com potencial aplicação em TFD. Nesse sentido, propõe-se investigar um fenômeno muito comum que ocorre com os princípios ativos de medicamentos usados em TFD, o de auto-agregação em meio aquoso ou não, processo este que pode inviabilizar o tratamento clínico. Essa agregação será investigada utilizando pacotes computacionais que possuem a Teoria do Funcional de Densidade implementada dentro das rotinas disponíveis. Os pacotes serão utilizados para analisar moléculas do grupo das fenotiazinas e das clorofilas considerando os solventes nas quais as mesmas podem ser utilizadas para TDF tais como água e misturas de água/solventes orgânicos biocompatíveis como, por exemplo, etanol, bem como sistemas micelares e polímeros biocompatíveis.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Hueder Paulo Moisés de Oliveira - Coordenador / Ana Paula Romani - Integrante / Antonio Eduardo da Hora Machado - Integrante / Leonardo Marmo Moreira - Integrante / Juliano Bonacin - Integrante / Codognoto, Lúcia - Integrante / Sandra Cruz dos Santos - Integrante / Luiza Rosimeri Romano Santin - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Hueder Paulo Moises de Oliveira.
2.   2012-2013. Agregacao de Fenotiazinas e Porfirinas, em Meios Homogeneo e Microheterogeneo
Descrição: O plano de pesquisa em apreço é um projeto na área de química teórica com vários temas interligados. Os resultados a serem obtidos permitirão um melhor entendimento do processo agregacional envolvido nas substâncias que podem ser utilizadas como fármacos em Terapia Fotodinâmica. O plano de trabalho inclui estudos básicos e estudos aplicados. O objetivo deste projeto é o estudo de base dos fenômenos envolvidos nos sistemas de trabalho envolvendo drogas com potencial aplicação em TFD. Nesse sentido, propõe-se investigar um fenômeno muito comum que ocorre com os princípios ativos de medicamentos usados em TFD, o de auto-agregação em meio aquoso ou não, processo este que pode inviabilizar o tratamento clínico. Essa agregação será investigada utilizando pacotes computacionais que possuem a Teoria do Funcional de Densidade implementada dentro das rotinas disponíveis. Os pacotes serão utilizados para analisar moléculas do grupo das fenotiazinas e das clorofilas considerando os solventes nas quais as mesmas podem ser utilizadas para TDF tais como água e misturas de água/solventes orgânicos biocompatíveis como, por exemplo, etanol, bem como sistemas micelares e polímeros biocompatíveis.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Hueder Paulo Moisés de Oliveira - Coordenador / Ana Paula Romani - Integrante / Lúcia Codognoto - Integrante / Antonio Eduardo da Hora Machado - Integrante / Leonardo Marmo Moreira - Integrante / Juliano Bonacin - Integrante / Sandra Cruz dos Santos - Integrante / Luiza Rosimeri Romano Santin - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Hueder Paulo Moises de Oliveira.
3.   2012-2015. ANALISE DA ESTRUTURA POPULACIONAL E DA DIVERSIDADE GENETICA DE QUEIXADAS (Tayassu pecari) DO PANTANAL E DO CERRADO DO MATO GROSSO DO SUL
Descrição: Em muitas espécies de mamíferos, as populações são subdivididas em grupos sociais que constituem unidades de reprodução, o que pode promover estruturação genética e endocruzamento. O grau de estruturação genética nestes casos sofre a influência de fatores comportamentais como o sistema de acasalamento e o padrão de dispersão da espécie. Além dos fatores comportamentais, fatores ambientais, como a fragmentação do habitat, podem subdividir populações, reduzindo seu tamanho original e inibindo o fluxo gênico entre fragmentos isolados. A redução no tamanho de uma população e o seu isolamento pode ter sérias consequências em longo prazo, como a depauperação genética. A estruturação populacional genética tem sido um tópico pouco explorado nos mamíferos sociais em que ambos os sexos são filopátricos e/ou dispersores, como é o caso das queixadas (Tayassu pecari). Além disso, nada se sabe sobre o efeito da fragmentação do habitat, decorrente da ação humana, na estrutura e variabilidade genética das populações dessa espécie, o que demonstra a necessidade de mais estudos nessa área. Os objetivos deste projeto são: a) analisar se existe diferenciação genética entre quatro localidades no Pantanal do Mato Grosso do Sul e uma no Planalto que o circunda; b) avaliar o grau de diversidade genética dessas localidades e compará-las; c) testar a ocorrência de gargalos populacionais recentes; d) avaliar a estrutura sócio-genética dos animais em cada uma das localidades por meio da caracterização das relações de parentesco entre os indivíduos do bando; e) verificar se ocorre sinal de endogamia nas localidades amostradas. O DNA será extraído de amostras de sangue e pelo que serão genotipadas utilizando-se 15 locos de microssatélites. A diferenciação genética entre as localidades será avaliada pelos parâmetros FST e DEST e por análises Bayesianas. A diversidade genética será estimada em termos de número de alelos, riqueza alélica, heterozigosidades esperadas e observadas. A evidência de cru. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Cibele Biondo - Coordenador / Cristina Yumi Miyaki - Integrante / Danilo Aqueu Rufo - Integrante / Alexine Keuroghlian - Integrante / Ana Carolina Dalla Vecchia - Integrante / Galetti, Mauro - Integrante / Flavia Maria Appolinário da Silva - Integrante / Mariana Sayuri Tanaka Gotardi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Cibele Biondo.
4.   2012-2014. Analise de povoamentos bentonicos em costoes rochosos utilizando a abordagem de Ecologia de Paisagens
Descrição: A abordagem de Ecologia de Paisagens aplicada a costões rochosos é inédita no Brasil. Este projeto visa analisar a relação da estrutura da comunidade bentônicas com características da paisagem que inclui a região costeira, marinha e o costão rochoso. Os objetivos específicos são: 1) Verificar a estrutura da comunidade, através dos parâmetros: composição, riqueza, diversidade e dominância de povoamentos; 2) Avaliar o recobrimento percentual de povoamentos para o total da área de estudo e por diferentes faixas de profundidade (separadas de 0,5 m em 0,5 m); 3) Analisar a heterogeneidade da paisagem da área de estudo, através dos seguintes parâmetros: quantidade de manchas, área média ocupada por cada mancha, forma e perímetro das manchas; 4) Verificar a associação espacial entre povoamentos da área de estudo e sua relação com características da paisagem. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Coordenador / Simone Rodrigues de Freitas - Integrante. Número de produções C, T A: 1
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
5.   2012-2013. Avaliacao da correcao de orientacao preferencial e microdeformacao anisotropica em analises quantitativas de fases de farmacos pelo Metodo de Rietveld
Descrição: As propriedades macroscópicas de um sólido são definidas por suas estruturas microscópicas. As estruturas cristalinas, isto é, as formas como os átomos ou íons estão dispostos, são determinantes na caracterização dessas substâncias. Os fármacos, em geral, são administrados na forma sólida, portanto podem apresentar polimorfismo (capacidade de se cristalizar em mais de uma forma ou estrutura cristalina). Por isso, alguns medicamentos podem ser tóxicos ou ter sua eficácia diminuída, caso o polimorfo errado seja utilizado (no caso, aquele que não possui o princípio ativo). A principal técnica utilizada para identificar diferentes polimorfos é a difração de raios X. Com o método de Rietveld é possível realizar o refinamento de estruturas cristalinas a partir dos dados obtidos pela difração, para que seja possível obter a quantificação de fase em estruturas cristalinas, por exemplo. O objetivo deste trabalho é realizar um estudo sobre as influências da aplicação (ou não) de correções para orientação preferencial dos cristalitos e microdeformação anisotrópica, com diferentes termos, na quantificação de fases do mebendazol, medicamento utilizado no tratamento de infestações por vermes, utilizando dados de difração de raios X por policristais e o método de Rietveld.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / Elton Ogoshi de Melo - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
6.   2012-2016. D04A - SXS - 5801- Excitacao eletronica e mecanismos de dissociacao ionica das moleculas halogenadas de C3H5OCl, CH2Cl2 , CH2ClBr na regiao dos raios-X
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alexsandre Figueiredo Lago - Coordenador.
Membro: Alexsandre Figueiredo Lago.
7.   2012-Atual. Dinamica de fotodissociacao de moleculas de moleculas heterociclicas nitrogenadas e sulfuradas excitadas na regiao do VUV
Descrição: Investigação dos processos de excitação eletrônica e os mecanismos de dissociação iônica de moléculas heterocíclicas nitrogenadas ou sulfuradas, tais como Methimazole (C4H6N2S) e Mercaptobenzimidazole (C7H6N2S), entre outras, utilizando radiação síncrotron na faixa de energia na região do ultravioleta de vácuo (VUV) e raios-x moles.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Alexsandre Figueiredo Lago - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Alexsandre Figueiredo Lago.
8.   2012-2013. EEG quantitative analysis for semantic memory access in reading
Descrição: In this project we investigate the sequence of perceptual and conceptual processes in semantic memory access during readings tasks. We intend to record the EEG while participants read sentences that could contain a contextually unexpected word and then apply nonlinear measures of predictability and complexity to each side of the semantic access boundary, estimated as the onset time of the N400 effect evoked by critical words.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: André Ricardo Oliveira da Fonseca - Coordenador / Giosuè Baggio - Integrante. Financiador(es): Universidade Federal do ABC - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 2
Membro: Andre Ricardo Oliveira da Fonseca.
9.   2012-2014. Estudo de lubrificacao por meio de simulacoes de dinamica molecular
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcio Gustavo Di Vernieri Cuppari - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Marcio Gustavo Di Vernieri Cuppari.
10.   2012-2013. Estudo de materias-primas de prednisona com o uso da Difracao de Raios X por policristais
Descrição: As propriedades macroscópicas de um sólido são definidas por suas estruturas microscópicas. As estruturas cristalinas, isto é, as formas como os átomos ou íons estão dispostos, são determinantes na caracterização dessas substâncias. Os fármacos, em geral, são administrados na forma sólida, portanto podem apresentar polimorfismo (capacidade de se cristalizar em mais de uma forma ou estrutura cristalina). Por isso, alguns medicamentos podem ser tóxicos ou ter sua eficácia diminuída, caso o polimorfo errado seja utilizado (no caso, aquele que não possui o princípio ativo). A principal técnica utilizada para identificar diferentes polimorfos é a difração de raios X. Com o método de Rietveld é possível realizar o refinamento dos dados obtidos pela difração, para que seja possível obter a quantificação de fase em estruturas cristalinas, por exemplo. O objetivo deste trabalho é realizar a caracterização estrutural de lotes de matérias-primas de prednisona, um medicamento utilizado no tratamento de doenças auto-imunes, doenças inflamatórias e várias doenças renais. A principal técnica de caracterização será a difração de raios X por policristais juntamente com o método de Rietveld de refinamento de estruturas cristalinas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / Debora Christina Ramos - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
11.   2012-Atual. Evolucao de orquideas Neotropicais sob a optica da citogenetica, filogenia e biogeografia
Descrição: A biodiversidade contida nos Neotrópicos oferece oportunidades valiosas para estudos evolutivos. Apartir de estudos na família Orchidaceae, e contando com uma rede de pesquisadores de diferentes espertises, pretendemos obter um melhor panorama das tendências evolutivas. A primeira fase deste projeto (JP1) visou superar alguns desafios, como a integração da ecologia-citogenética-tamanho do genoma, mas é necessário um novo passo: considerar plenamente a ecologia vegetal ao estudar hibridação e poliploidia. Considerando a reorganização genômica (das sequências e do padrão epigenético) que ocorre após a hibridação e poliploidia, todo o desenvolvimento da planta pode ser afetado. Portanto, todos os sinais que a planta usa para se comunicar com outros organismos podem ser afetados, e como a mudança nesses sinais participa na delimitação das fronteiras das espécies híbridas e no estabelecimento de novas barreiras reprodutivas precisa ser explorado. Todos os nossos estudos contam com uma hipótese filogenética, permitindo que os resultados sejam interpretados dentro do contexto evolutivo. Entretanto, a partir de novos estudos de sistemática, geralmente surgem novas dúvidas. Aqui, pretendemos usar técnicas complementares para estudar alguns gêneros parafiléticos de orquídeas, compondo a segunda grande área do projeto. Como as sequências repetitivas são gênero ou espécie específicas, seu uso poderia somar novas informações. Tais abordagens se beneficiam da popularização de técnicas de sequenciamento, também entre plantas não-modelo. Estas duas grandes áreas, a integração da hibridação e ecologia e a sistemática das Orchidaceae serão abordadas durante o JP2 com o objetivo de obter novos insights sobre a evolução das plantas neotropicais.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Ana Paula de Moraes - Coordenador.
Membro: Ana Paula de Moraes.
12.   2012-2013. Investigacoes fotoquimicas e fotofisicas de compostos tris-heterolepticos de rutenio(II)
Descrição: Compostos polipiridínicos de rutênio(II) apresentam ampla e intensa absorção da luz visível e podem ser projetados de maneira a executarem funções úteis, como a conversão de energia solar. A classe dos compostos tris-heterolépticos de rutênio(II) tem se destacado, pois modificações feitas em um dos seus ligantes refletem nas suas propriedades globais. O presente projeto tem o objetivo de sintetizar e caracterizar alguns compostos do tipo cis-[Ru(GA-bpy)(R2-phen)(X)2]; GA = ácido carboxílico, por exemplo, R = substituintes doadores ou retiradores de elétrons e X = Cl- ou NCS-, bem como realizar investigações fotoquímicas, fotofísicas e eletroquímicas buscando racionalizar o efeito do substituinte R nas propriedades. Desta maneira será possível melhorar processos de conversão de energia luminosa, associando investigações de caráter fundamental com a preparação de dispositivos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: André Sarto Polo - Coordenador / Kleber Thiago de Oliveira - Integrante / Paula Homem de Mello - Integrante / Rodrigo Luiz Oliveira Rodrigues Cunha - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 12
Membro: Andre Sarto Polo.
13.   2012-2015. Jogos educativos como ferramenta para aprendizagem experiencial e significativa sobre as mudancas climaticas globais e seus efeitos nos ecossistemas marinhos e costeiros
Descrição: O conceito científico de Mudança Climática é muito difícil para a maioria da população e há uma tendência em percebê-lo como um problema abstrato, longe no tempo e deslocado no espaço. É importante, portanto, promover um ensino, em todos os espaços de aprendizagem, baseado no aprofundamento científico sobre o tema através, por exemplo, da confecção de materiais didáticos interdisciplinares com conhecimentos acumulados sobre clima e mudanças globais. O presente projeto propõe o desenvolvimento, aplicação e teste de dois jogos educativos, interdisciplinares e sistêmicos, sobre as influências das mudanças climáticas nos ambientes marinhos e costeiros. Ambos os jogos (Trilha Interpretativa Virtual e Livro-jogo virtual) serão voltados para alunos de ensino fundamental e médio, serão disponibilizados na internet e avaliados em termos de eficácia como material educacional. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Coordenador / Flávio Augusto de Souza Berchez - Integrante / Simone Rodrigues de Freitas - Integrante / Juliana Cristina Braga - Integrante / Rosana Louro Ferreira Silva - Integrante / Luciano Silva - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 13
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
14.   2012-2015. Modelagem computacional da evolucao microestrutural de ligas Fe-Ni-C
Descrição: O Ni é um dos elementos de liga utilizados na formulação de ligas ferrosas utilizadas em condições extremas e em ligas com propriedades especiais. No Laboratório de Transformações de Fase do PMT-EPUSP, ligas Fe-Ni-C vêm sendo utilizadas como sistemas-modelo para estudar as transformações da austenita durante o resfriamento, aproveitando o forte efeito do Ni na energia livre da transformação e a quase ausência de interação do Ni com o C. Neste contexto, o presente projeto de pós-doutorado pretende oferecer um suporte ao trabalho experimental em curso no Departamento de Engenharia Metalúrgica e de Materiais da USP por meio de simulações atomísticas (dinâmica molecular e Monte Carlo) e cálculos de primeiros princípios.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Roberto Gomes de Aguiar Veiga - Integrante / Hélio Goldenstein - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa. Número de produções C, T A: 5
Membro: Roberto Gomes de Aguiar Veiga.
15.   2012-2014. Projeto CAPES PROBRAL/DAAD: Electronic transport properties of semiconductor nanowires
Descrição: The aim of this project is to use computational modeling to modify the surface properties of ZnO nanowires (NWs) by attaching organic molecules. We will employ tight-binding methods, first-principles density-functional theory and Green's functions to investigate the structural, electronic and electrical properties of hybrid ZnO NWs-organic systems. Based on recent experiments we will investigate the adsorption of funcional groups, such as thiols, carboxylic acids and silanes on ZnO nanowires. By controlling the inorganic-organic interface at an atomistic scale, we will suggest a route for designing efficient and stable hybrid materials which can be applied in biosensing and solar cells, thus minimizing costs for fabrication and manufacturing. Our calculated properties for the investigated systems will be closely correlated to experimental investigations which will be carried out by our collaborators in Germany and eventually newly established collaborations in Brazil.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . Integrantes: Gustavo Martini Dalpian - Coordenador / Aline Luciana Schoenhalz - Integrante / Alexandre Reily Rocha - Integrante / Thomas Frauenheim - Integrante / Andreia Luiza da Rosa - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Deutscher Akademischer Austauschdienst - Auxílio financeiro.
Membro: Gustavo Martini Dalpian.
16.   2012-2018. Respostas do genoma vegetal as variacoes ambientais: o que as Orchidaceae tem a contar?
Descrição: Espécies vicariantes apresentam distribuição disjunta, podendo levar a especiação e endemismos. Estudos que relacionem a estrutura genética com a distribuição geográfica das plantas são prementes, permitindo entender quais são as consequências da fragmentação de habitat sobre a biologia destas espécies e a relação entre ambiente e genoma. Entretanto, apesar da mega biodiversidade vegetal encontrada nos neotrópicos, praticamente inexistem trabalhos em que a vicariância tenha sido abordada do ponto de vista cromossômico. Visando minimizar este gap, a família Orchidaceae será utilizada de modelo, pois apresenta espécies ocorrentes em formações vegetais abertas, como fechadas; diferentes hábitos e distribuição geográfica ampla. As mudanças observadas nos caracteres genômicos podem ser relacionadas com as variações ambientais, mantendo a taxa de recombinação em situações que favoreçam a manutenção de um determinado genótipo ou alterando a taxa de recombinação em condições de grande instabilidade ambiental. Nestas condições de instabilidade, os retrotransposons igualmente podem tornar-se mais ativos, re-padronizando o genoma e levando a um incremento na quantidade de DNA, sendo que esta variação é considerada um das principais causas de divergência entre espécies. Para tal, quatro subprojetos são propostos, onde espécies de Epidendrum, Acianthera e Maxillarineae serão analisadas do ponto de vista cromossômico e de tamanho de genoma, em uma abordagem citogeográfica, visando compreender as relações genoma x ambiente.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ana Paula de Moraes - Coordenador / Fábio Pinheiro - Integrante / Fábio de Barros - Integrante / Eduardo Leite Borba - Integrante / Samantha Koehler - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Ana Paula de Moraes.
17.   2012-2015. Sub-Projeto MCTI/FINEP/CT-INFRA - PROINFRA - 01/2011
Descrição: O objetivo principal deste subprojeto é proporcionar uma infra-estrutura de suporte às atividades científicas e tecnológicas de cunho computacional, o que irá favorecer a grande maioria das linhas de pesquisa e os cursos de pós-graduação da UFABC. Mais especificamente, podemos sublinhar os seguintes objetivos: (i) Aumentar sensivelmente a capacidade de simulação computacional e modelagem disponível para os grupos de pesquisa e cursos de pós-graduação da UFABC; (ii) Fomentar novas pesquisas científicas e tecnológicas com o novo patamar de processamento e armazenamento a ser alcançado com este subprojeto; (iii) Formar recursos humanos altamente capacitados com foco em sistemas de computação de alto desempenho e simulação computacional e modelagem; (iv) Permitir um melhor aproveitamento das instalações no Data Center de Pesquisa da UFABC, além de prover um aumento de disponibilidade e de eficiência; (v) Aumentar a relevância da UFABC na área de computação de alto desempenho nos âmbitos regional, nacional e internacional. Subprojeto ECADCUPS : valor solicitado : Cluster R$ 812.250,00 UPS rotativa R$ 1.297.692 Total R$ 2.109.942,00 Valor aprovado: R$ 2.109.942,00. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (2) . Integrantes: Jeverson Teodoro Arantes Junior - Coordenador / Gustavo M. Dalpian - Integrante / Caetano Rodrigues Miranda - Integrante / Luis Paulo Barbour Scott - Integrante / Mauricio Coutinho Domingues Neto - Integrante / Marcio Eisencraft - Integrante / Mario Minami - Integrante / Paula Homem de Melo - Integrante / Ricardo Suyama - Integrante / Ronei Mioto - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
Membro: Jeverson Teodoro Arantes Junior.
18.   2012-2013. Trait dynamics in interacting populations
Descrição: The project explores the dynamics of ecological communities in which interactions between different species affect, and are affected by, the internal variation of individual traits in each population.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Renato Mendes Coutinho - Coordenador / Roberto André Kraenkel - Integrante / Ursula Gaedke - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Renato Mendes Coutinho.

2011

1.   2011-2014. Consolidacao do Programa de Pos-Graduacao em Quimica da UFPel atraves de colaboracao com os programas consolidados da UFSM, UFRGS e UNICAMP
Descrição: O financiamento deste projeto vai contribuir para a consolidação do PPGQ da UFPel, através da realização de projetos conjuntos de pesquisa entre os participantes da proposta. A contribuição para o madurecimento do curso de pós-graduação em fase de consolidação ocorrerá através da interação entre os membros que já possuem histórico de colaboração, além de fomentar a criação de novos projetos cooperativos entre membros. Esta proposta busca centrar na UFPel um conjunto de ações que permitirá a integração dos membros e a complementação das atividades a serem desenvolvidas nas demais instituições. Cabe salientar que estas instituições são referências em Programas de Pós-Graduação em Química, cujos grupos provenientes são ícones nas áreas de pesquisa a serem contempladas nesta proposta. Além disso, busca reforçar a colaboração interinstitucional entre os grupos membros da proposta, o que permitirá um salto qualitativo no alcance científico dos estudos desenvolvidos pelos membros. O salto qualitativo da pesquisa científica realizada pelos participantes desta rede resultará em grande contribuição na formação de recursos humanos, uma vez que estão envolvidos professores orientadores em programas de Pós- Graduação e de iniciação científica com um grande número de estudantes que se beneficiarão das possibilidades de expansão do horizonte de pesquisa a que serão expostos. O projeto é subdividido, assim dentre as três Instituições envolvidas no projeto.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Hueder Paulo Moisés de Oliveira - Integrante / Daniela Bianchini - Integrante / Mariana Antunes Vieira - Integrante / Anderson Schwingel Ribeiro - Coordenador / Aline Joana Rolina Wohlmuth Alves dos Santos - Integrante.
Membro: Hueder Paulo Moises de Oliveira.
2.   2011-2015. D05A - TGM - 6614 - Investigacao da fotoabsorcao e dos processos de fotoionizacao dissociativa de amino acidos e bases de DNA e RNA na regiao do VUV
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alexsandre Figueiredo Lago - Coordenador.
Membro: Alexsandre Figueiredo Lago.
3.   2011-2013. Efeito do uso da terra e das estradas sobre a riqueza de especies no Estado de Sao Paulo
Descrição: O projeto tem como objetivo avaliar a relação da riqueza de espécies de mamíferos, aves, peixes e árvores com características da paisagem (estradas, uso da terra, cobertura vegetal, hidrografia, relevo). Os dados do projeto Biota-FAPESP, do mapeamento dos biomas Mata Atlântica e Cerrado (PROBIO-MMA) e do IBGE serão analisados com ferramentas de geoprocessamento.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) . Integrantes: Cibele Biondo - Integrante / Simone Rodrigues de Freitas - Coordenador / Fernando Zaniolo Gibran - Integrante / Márcio S. Werneck - Integrante / Carlos E. Candia-Gallardo - Integrante.
Membro: Cibele Biondo.
4.   2011-2013. Estudo ambiental de areas de cultivo da macroalga Kappaphycus alvarezii (Rhodophyta, Gigartinales), no litoral de Santa Catarina, visando a elaboracao de programas de monitoramento
Descrição: O conhecimento prévio da estrutura das comunidades naturais no entorno das áreas potenciais de introdução de cultivos de Kappaphycus alvarezii é fundamental para que seja possível o estabelecimento de programas de monitoramento nestas áreas. O presente trabalho teve como objetivos: avaliar a composição, riqueza, diversidade e repartição espacial de povoamentos de costões rochosos no litoral de Santa Catarina (Enseada do Sambaqui, Ribeirão da Ilha, Penha e Canto Grande), o Estado; analisar a similaridade quantitativa dessas áreas. Em dois trechos de 50 m no mediolitoral de cada localidade foram listados todos os povoamentos que puderam ser discriminados visualmente e foram situados aleatoriamente 20 elementos amostrais de 25 cm de lado, constituídos de imagens digitais, de onde foi obtido o recobrimento percentual médio de cada povoamento. As amostras foram ordenadas por nMDS baseada no Índice de Similaridade de Bray-Curtis e a comparação entre as localidades foi realizada por ANOSIM e, caso encontradas diferenças significativas, por SIMPER. Foram encontrados 51 povoamentos no total, sendo a categoria ?Banco? a mais representada (51%). Os povoamentos fitobentônicos foram predominantes em todos os locais e Rhodophyta foi o grupo mais representado (41%). A análise nMDS revelou dois grupos significativamente diferentes no nível de 51% de similaridade (ANOSIM entre locais, R = 0.625, p = 0.019), um contendo os transectos de Penha e o outro contendo todos os demais transectos. A análise de SIMPER revelou que a dissimilaridade entre Penha e Sambaqui (de 65,20%), entre Penha e Ribeirão da Ilha (de 67,22%) e entre Penha e Canto Grande (de 63,89%), foi principalmente causada pelos povoamentos Banco de Crassostrea e Banco de Sargassum. Os demais transectos não formaram grupos definidos de acordo com a localidade a que pertenciam, indicando que a estruturação quantitativa dos povoamentos foi semelhante entre eles. Os índices de diversidade de Shannon-Weaver e dominância de Simpson não apresentaram diferenças significativas entre os locais. O presente estudo permitiu o estabelecimento de um conhecimento de base para a proposição de programas de monitoramento de longo prazo nas áreas potenciais de cultivo de Kappaphycus alvarezii.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Integrante / Eurico Cabral de Oliveira - Coordenador / Leila Hayashi - Integrante / Paulo Antunes Horta Junior - Integrante / Alex Alves dos Santos - Integrante / Larissa de Araújo Kawabe - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 4
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
5.   2011-2016. Estudos sobre ectoparasitos e hemoparasitos de aves silvestres de fragmentos da Mata Atlantica da regiao da Zona da Mata de Minas Gerais
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (2) . Integrantes: Marcus Vinicius Xavier Senra - Integrante / Roberto Junio P. Dias - Integrante / MARTINELE, ISABEL - Integrante / Marta Tavares d`Agosto - Coordenador / Eric Daemon - Integrante. Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Auxílio financeiro.
Membro: Marcus Vinicius Xavier Senra.
6.   2011-2013. Infraestrutura multiusuaria e laboratorios de pesquisa
Descrição: O presente projeto visa à aplicação da Parcela para Custos de Infraestrutura Institucional para Pesquisa (PCIIP) para a construção de dois mezaninos (área de aprox. 220 m2) em vão existente no interior do chamado bloco B do campus de Santo André, em espaços que irão permitir que vários pesquisadores das áreas de Física de Altas Energias, Nanociências, Eng. De Materiais, Petróleo, Polimeros, Ciência da Computação, Matemática e Neurociência e Cognição tenha espaço adequado para desenvolver as suas atividades de pesquisa. Além disso, serão construídos mezaninos (área de aprox.. 160 m2) na área da Central Experimental Multiusuário (CEM), localizada também no Bloco B, permitindo que a utilização mais adequada dos cerca de 30 equipamentos lá instalados pelos atuais 110 usuários da CEM.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Herculano da Silva Martinho - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Herculano da Silva Martinho.
7.   2011-Atual. Interacao de Farmacos com modelos de membranas
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Ronei Miotto - Coordenador / Rodrigo Maghdissian Cordeiro - Integrante. Número de produções C, T A: 6 / Número de orientações: 1
Membro: Ronei Miotto.
8.   2011-2013. Modelagem Computacional de Nanocompositos
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Jeverson Teodoro Arantes Junior - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T A: 1
Membro: Jeverson Teodoro Arantes Junior.
9.   2011-2013. O papel das interacoes fonon-fonon em sistemas de alta anarmonicidade: o caso dos aminoacidos hidratado
Descrição: Duas transições de fase dinâmicas de caráter universal tem sido recentemente observadas em macromoléculas (lisozima, mioglobina, bacteriorodopsina, DNA e RNA) nas temperaturas TD ~ 180 - 220 K e T* ~ 100 K. A primeira representa o limiar de atividade biológica e a transição de um regime dinâmico anarmônico para harmônico para o movimento das biomoléculas hidratadas. A segunda representa o limiar para uma transição harmônica secundária. Apesar de sua relevância, é ausente uma completa compreensão da natureza destas transições e as suas conseqüências para a bio-atividade de macromoléculas. Especificamente, podemos citar como importantes pontos em aberto (i) a natureza dos mecanismos de relaxação envolvidos nas diversas interações moleculares e como eles dependem do nível de hidratação; (ii) a natureza termodinâmica das transições envolvidas; (iii) a dependência de TD e T* com o nível de hidratação e a complexidade estrutural da biomolécula envolvida; (iv)o papel das interações fônon-fônon e as contribuições relativas oriundas das anarmonicidades intrínseca e extrínseca; (v) o papel da vizinhança local do sítio das águas; (vi) como os pontos acima alteram-se quando consideram-se isômeros ópticos não ativos biologicamente (forma dextrógira). No presente projeto temos como objetivo contribuir para a elucidação das questões levantadas acima escolhendo como objeto de estudo os isômeros ópticos (levógiros e dextrógiro), bem como a mistura racêmica, dos aminoácidos cisteína (C3H7NO2S), cistina (C6H12N2O4S2), prolina (C5H9NO2) e hidroxiprolina (C5H9NO3) em vários níveis de hidratação. A metodologia empregada consiste em estudar as propriedades termodinâmicas (calor específico), estruturais (difração de Raios-X) e espectro de fônons ativos em Raman em função da temperatura (10-300 K), em conjunto com simulações computacionais (cálculos DFT) das propriedades físicas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Herculano da Silva Martinho - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Herculano da Silva Martinho.
10.   2011-2013. Otimizacao da estabilidade metabolica de inibidores da plasmepsina II
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Renato Ferreira de Freitas - Integrante / FREIRE, ERNESTO - Coordenador. Número de produções C, T A: 1
Membro: Renato Ferreira de Freitas.
11.   2011-2013. Otimizacao das condicoes experimentais para aquisicao de dados de difracao de raios X de farmacos policristalinos
Descrição: Fármacos e os excipientes de um dado medicamento podem se cristalizar em diversas formas (polimorfos), as quais podem apresentar diferenças nas propriedades físicas e químicas e na biodisponibilidade. O polimorfismo é a capacidade uma molécula adquirir mais de uma forma ou estrutura cristalina, sendo que essas variações causam alterações nas propriedades físico-químicas e provocam diferenças entre os polimorfos como tamanho de partículas, higroscopicidade, solubilidade, dentre outras. A maioria dos fármacos é administrada na forma sólida, podendo sua estrutura ser amorfa ou policristalina. As formas policristalinas são facilmente detectadas por difração de raios X e, conhecendo-se a estrutura cristalina, é possível realizar a quantificação dos polimorfos nos fármacos através da aplicação do método de Rietveld de refinamento de estruturas cristalinas. Neste projeto serão avaliadas algumas condições experimentais para a adequada aquisição de dados de difração de raios X em fármacos policristalinos, cujos cristalitos tendem a se orientar preferencialmente em certas direções, dependendo das técnicas de preparação de amostras, o que pode influenciar negativamente na correta análise quantitativa de fases. A importância de tal pesquisa está ligada ao anseio das indústrias farmacêuticas em melhorar cada vez mais a qualidade de seus produtos e da importante ação social resultante da melhor qualidade dos medicamentos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (1) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Fabio Furlan Ferreira.
12.   2011-2013. Processos de Agregacao em Corantes Oxazinicos e Porfirinicos com Potencial Aplicacao em Terapia Fotodinamica
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Hueder Paulo Moisés de Oliveira - Coordenador / Ana Paula Romani - Integrante / Lúcia Codognoto - Integrante / Leonardo Marmo Moreira - Integrante / Juliano Bonacin - Integrante / Juliana Pereira Lyon - Integrante / Sandra Cruz dos Santos - Integrante / Luiza Rosimeri Romano Santin - Integrante / ADJACI UCHOA FERNANDES - Integrante.
Membro: Hueder Paulo Moises de Oliveira.
13.   2011-Atual. Processos de Agregacao em Corantes Oxazinicos e Porfirinicos com Potencial Aplicacao em Terapia Fotodinamica
Descrição: O objetivo deste projeto é o estudo de base dos fenômenos envolvidos nos sistemas de trabalho envolvendo drogas com potencial aplicação em Terapia Fotodinâmica (TFD). Nesse sentido, propõe-se investigar um fenômeno muito comum que ocorre com os princípios ativos de medicamentos usados em TFD, o de auto-agregação em meio aquoso, processo este que inviabiliza o tratamento clínico. Essa agregação será investigada nos meios: formulados tópicos (sistema homogêneo envolvendo misturas de água com solvente orgânico) e sistemas com surfactantes. Em tais estudos serão utilizadas técnicas fotofísicas destacando-se a fluorescência estacionária. A Terapia Fotodinâmica (TFD), técnica que utiliza um composto cromóforo e luz, teve seu uso recentemente aprovado por diversos países, incluindo-se o Brasil. O tratamento é adequado a doenças que se caracterizam por crescimento anormal de tecidos. Por ser recente, seu uso não está difundido amplamente, além do que, o custo de aplicação é extremamente elevado devido ao medicamento e ao LASER (irradiação na região de 600 a 800 nm). Quanto ao cromóforo (princípio ativo) propõe-se investigar corantes, como o azul de metileno, azul de toluidina, Azures, derivados da clorofila retirados de plantas (forma natural (íon magnésio), base livre, e com troca do íon metálico), ou seja, compostos de custo inexpressivo que podem ter boa resposta terapêutica. Nos sistemas de formulação serão investigados o formulado tópico (misturas de água/solvente orgânico) e micelas de polímeros surfactantes.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Hueder Paulo Moisés de Oliveira - Coordenador / Ana Paula Romani - Integrante / Lúcia Codognoto - Integrante / Antonio Eduardo da Hora Machado - Integrante / Divinomar Severino - Integrante / Leonardo Marmo Moreira - Integrante.
Membro: Hueder Paulo Moises de Oliveira.
14.   2011-2016. Projeto Tematico FAPESP: PROPRIEDADES ELETRONICAS, MAGNETICAS E DE TRANSPORTE EM NANOESTRUTURAS
Descrição: O objetivo deste projeto é o estudo das propriedades físicas de novos materiais, através de métodos ab initio ("estado-da-arte"), focando em nanosistemas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Gustavo Martini Dalpian - Integrante / Adalberto Fazzio - Coordenador / Antônio José Roque da Silva - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 2
Membro: Gustavo Martini Dalpian.
15.   2011-Atual. Rede de Monitoramento de Habitats Bentonicos Costeiros (ReBentos) - Recifes coralinos e rochosos
Descrição: Edital MCT/CNPq/MEC/CAPES/FNDCT ? Ação Transversal/FAPs Nº 47/2010 ? Sistema Nacional de Pesquisa em Biodiversidade - SISBIOTA BRASIL, visando ampliar o conhecimento e entendimento da biodiversidade brasileira, melhorar a capacidade preditiva de respostas a mudanças globais, particularmente às mudanças de uso e cobertura da terra e mudanças climáticas; associando as pesquisas à formação de recursos humanos, educação ambiental e divulgação do conhecimento científico. A ReBentos objetiva o monitoramento contínuo e permanente de parâmetros biológicos e abióticos de regiões intermareais e do infralitoral raso, abrangendo seus mais diversos habitats ao longo da costa brasileira. Assim, a obtenção de séries de dados contínuas no tempo e distribuídas no espaço, por tipo de habitat e através de um gradiente latitudinal, permitirá investigar questões científicas relacionadas a alterações causadas por impactos antropogênicos e modificações climáticas. Portanto, a presente proposta está aderida a Chamada 3 do edital nº47/2010, que visa a pesquisa em redes temáticas para o entendimento e previsão da biodiversidade brasileira às mudanças climáticas e aos usos da terra, principalmente na linha temática ?detecção das alterações de mudanças ambientais regionais e globais?. Visto que esta proposta constitui uma iniciativa pioneira para o ambiente marinho, com grande abrangência geográfica (sul, sudeste e nordeste brasileiro) e pesquisadores de diversas áreas do conhecimento (fauna, flora e fatores abióticos de recifes coralinos e rochosos, praias arenosas, manguezais e marismas, fundos não consolidados e banco de fanerógamas), ligados a 17 instituições de ensino e/ou pesquisa, a consolidação dessa rede visa discutir, padronizar e aplicar metodologias para a geração de dados de longo prazo. Com isso, futuramente, a rede poderá propor a criação de uma modelagem descritiva e preditiva das respostas e alterações da biodiversidade sob diferentes cenários de alterações globais e regi. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Integrante / Flávio Augusto de Souza Berchez - Integrante / Alexander Turra - Coordenador / Ricardo Coutinho - Integrante / Carlos Eduardo Leite Ferreira - Integrante / Júlio César Monteiro - Integrante / Fernanda Neves Siviero - Integrante / Bernardo Antonio Perez da Gama - Integrante / Diclá Pupo Santos - Integrante / Maria Soledad Lopez - Integrante / Zelinda M. A. Nery Leão - Integrante / Ruy Kenji Papa Kikuchi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 17
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
16.   2011-2013. Simulacao de Sistemas Biologicos Utilizando GPUs
Descrição: A área de biologia de sistemas é um campo de pesquisa interdisciplinar que foca no estudo sistêmico de interações complexas verificadas em organismos vivos. Um dos principais objetivos das pesquisas nessa área é descobrir propriedades novas que podem surgir da visão sistêmica para um melhor en- tendimento dos processos que ocorrem em sistemas biológicos. Em particular, esta proposta pretende focar em três aspectos importantes em biologia de sistemas: i) a investigação das interações entre neurô- nios em redes neuronais de grande escala; ii) o estudo e desenvolvimento de métodos de inferência de redes de regulação gênica e iii) o estudo e desenvolvimento de métodos de análise do comporta- mento dinâmico de redes de regulação gênica. O estudo de tais aspectos normalmente envolve um poder computacional significativo devido ao elevado número de elementos interagentes nesses sistemas. Para amenizar esse problema, uma possibilidade é o emprego de aglomerados de processadores gráficos (do inglês: Graphics processing unit - GPU). As GPUs geralmente são bastante eficientes em aplicações que envolvem exaustivas operações de ponto flutuante. A idéia central deste projeto é a obtenção e de- senvolvimento de conhecimento e técnicas que permitam a exploração do poder de computacional das GPUs para fins de desenvolvimento de soluções relativamente baratas e eficientes para problemas críti- cos colocados no contexto dos três aspectos mencionados acima. Este projeto pretende fazer parte dos esforços do projeto do Centro Nacional de Processamento em Bioinformática de Intenso Desempenho (CENABID).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Luiz Carlos da Silva Rozante - Integrante / de Camargo, Raphael Y. - Integrante / Song, Siang W. - Integrante / David Correa Martins Jr. - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Luiz Carlos da Silva Rozante.
17.   2011-2013. Super Strained 3D semiconductors
Descrição: Busca-se desenvolver técnicas de recobrimento de pilares semicondutores por filmes amorfos para assim aplicar-se tensões tanto compressivas quanto de distensão em níveis muito superiores ao que pode ser alcançado por técnicas convencionais como deposição epitaxial. Desta forma, pode-se modular as propriedades eletrônicas de um semicondutor e empregá-lo em aplicações às quais este normalmente não se prestaria.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Cedric Rocha Leão - Coordenador / Adam Conway - Integrante / Rebecca Nikolic - Integrante / Qinghui Shao - Integrante / Lars Voss, - Integrante. Financiador(es): Laboratory Directed Research and Development fund - Remuneração.
Membro: Cedric Rocha Leao.
18.   2011-2015. Utilizacao de Tecnicas de Simulacao Multiagente e Processamento de Imagem no Controle do Fluxo de Pedestres
Descrição: A técnica de modelagem multiagentes surgiu nos anos 70, mas há pouco tempo conseguiu atingir o seu potencial como ferramenta prática de aplicação. Um modelo neste contexto pode contar com vários agentes, sendo que o funcionamento do sistema ocorre pela interação entre eles. Este projeto interdisciplinar tem como foco desenvolver um modelo para o controle do fluxo de pedestres em um ambiente com obstáculos. A validação dos resultados será feita com o auxílio de técnicas de Processamento de Imagem. O modelo proposto é baseado nas teorias de Autômato Celular (AC), Sistemas Multiagentes (SMA), Simulação Multiagentes, Processamento de Imagens e Teoria de Sistemas de Transporte. Neste contexto, os pedestres e obstáculos são SMA e o modelo AC é usado na interação entre os agentes. Além disso, os movimentos dos pedestres devem ser capturados utilizando processamento de imagens. Um dos grandes desafios desse projeto está na validação dos resultados da simulação com os dados reais.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . Integrantes: Maria das Graças Bruno Marietto - Integrante / Marcelo Zanchetta do Nascimento - Integrante / Wagner Tanaka Botelho - Coordenador / Fábio Aragão da Silva - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Maria das Gracas Bruno Marietto.

2010

1.   2010-2011. AcadSistem - Sistema de Controle Academico
Descrição: Desenvolvimento de aplicativo para gerenciamento de programa de pós-graduacao na Universidade Federal de Pelotas.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Hueder Paulo Moisés de Oliveira - Coordenador / Christianne Melo Silva Paraíso - Integrante / Juliana Forin Pasquini Martinez - Integrante.
Membro: Hueder Paulo Moises de Oliveira.
2.   2010-2011. Analise da reparticao espacial e temporal de povoamentos de mediolitoral consolidado do costao oeste da Praia do Guaeca ? Sao Sebastiao (SP).
Descrição: As comunidades marinhas bentônicas de substrato consolidado apresentam certa regularidade nos padrões estruturais. Amostrar estas comunidades de maneira representativa é um passo importante para o conhecimento dos processos determinantes destes padrões, bem como para o monitoramento dos mesmos ao longo do tempo. O método ?Levantamento Fisionômico? é uma ferramenta que permite a identificação de padrões visuais, ou heterogeneidade, de comunidades bentônicas de costões rochosos, usando unidades da paisagem chamadas povoamentos. O objetivo do trabalho é usar o método dos povoamentos para caracterizar a repartição espacial e temporal da comunidade bentônica em um trecho de mediolitoral de 250 m no costão oeste da Praia do Guaecá, que se localiza no município de São Sebastião ? SP.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Coordenador.
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
3.   2010-Atual. Avaliacao de impactos de atividades turisticas sobre comunidades marinhas bentonicas de substrato consolidado
Descrição: A visitação turística em áreas costeiras protegidas tem como um de seus principais objetivos a conscientização do visitante e o estímulo a atitudes que levem à conservação do meio ambiente e, portanto, os impactos negativos causados por essa atividade devem ser minimizados ao máximo. Já em áreas não protegidas esse tipo de conscientização não é incentivado e diversos são os impactos negativos sobre as comunidades bentônicas. Particularmente no Brasil, dados são escassos no que se refere à avaliação desses impactos e a discussão de metodologias adequadas para tanto. O presente projeto busca colaborar na implantação de metodologias para a avaliação de impactos da atividade (eco)turística sobre as comunidades marinhas bentônicas de substrato consolidado.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (1) . Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Coordenador / Ruan Soares Risso Possas - Integrante / Juliana Nascimento Silva - Integrante / Natalia Uehara - Integrante / Juliana Imenis Barradas - Integrante. Número de produções C, T A: 4
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
4.   2010-Atual. CINAR PATHOBACTER: CIliates as NAtural Reservoir of potentially PATHOgenic BACTERia: an ecological, functional and evolutionary genomic investigation
Descrição: In the last years, Protists (Protozoa) gained a significant attention from the scientific community because of their role as Trojan horses respect to opportunistic pathogens of humans and animals. Although this role is nowadays well established and accepted for some Protists like Acanthamoeba, little is known for other groups of possible hosts. Recently, members of the coordinating unit of Pisa got evidences that many of the natural occurring bacterial symbionts of ciliates have a strong phylogenetic affiliation to human and animal (especially fish) pathogens like Rickettsia (Vannini et al., 2005; Ferrantini et al., 2009; Ferrantini et al., in prep) and Francisella (Schrallhammer et al., in prep.). These observations raised the question whether ciliates may also represent natural reservoirs for potentially pathogenic bacteria especially in tropical regions where the environmental conditions favor microbial growth and fast evolution. Furthermore tropical countries are predicted as the Hot Spot for emerging infectious diseases and zoonosis due to hygienic standards lower than in Western countries and the living together of humans with their farmed animals. Aim of the present project is to set up an international research network that, starting from the collection of novel isolates especially from tropical regions, performs a complete ecological, functional and evolutionary genomic investigation on symbiotic bacteria retrieved from ciliates that shows phylogenetic affinities to pathogenic ones. Units from the proposed network posses expertise that ranges from the traditional morphological investigation to advanced ultrastructure, ecology, functional biology, molecular phylogeny, comparative genomics and postgenomics. Aim of the research network will be to coordinate the research activities of the involved units into joined projects and to transfer know-how to the younger researcher to allow them to re-establish the acquired competences in their home labora.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Marcus Vinicius Xavier Senra - Coordenador / Carlos Augusto Gomes Soares - Integrante / Inácio domingos da silva neto - Integrante. Financiador(es): Marie Curie Actions - Auxílio financeiro.
Membro: Marcus Vinicius Xavier Senra.
5.   2010-2015. D05A - TGM - 5835 - dissociacao ionica de moleculas poliatomicas de interesse atmosferico na regiao do ultravioleta de vacuo .
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alexsandre Figueiredo Lago - Coordenador.
Membro: Alexsandre Figueiredo Lago.
6.   2010-2015. D05A - TGM-4619 - Dissociacao ionica de halo-etanos (C2H4Cl2 , C2H3Cl3 e C2H2Cl4) no VUV
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alexsandre Figueiredo Lago - Coordenador.
Membro: Alexsandre Figueiredo Lago.
7.   2010-2016. D05A - TGM-5384 - fotoabsorcao e dos mecanismos de dissociacao de moleculas halogenadas atraves do uso da radiacao sincrotron na regiao do VUV
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alexsandre Figueiredo Lago - Coordenador.
Membro: Alexsandre Figueiredo Lago.
8.   2010-2014. Desenvolvimento de um Time de Futebol de Robos
Descrição: Este projeto tem por objetivo desenvolver um sistema integrado de sensores e atuadores que possam ser utilizados na manufatura de robôs autônomos para que os mesmos possam ter uma melhor identificação do ambiente e melhor resposta no que diz respeito a sua locomoção em um jogo de futebol de robôs. Além disso, a interface eletrônica (utilização de circuitos elétricos), seus respectivos componentes (resistor, capacitor, diodo, regular de tensão, relé, circuito integrado, entre outros) e a sua estrutura mecânica serão considerados. Para o desenvolvimento do projeto deve ser utilizado um software CAD (Computer-Aided Design) chamado SolidWorks com modelagem em 3D. Este permite a criação de ambientes totalmente virtuais, onde é possível avaliar a interação dos vários componentes do robô possibilitando detectar erros e incompatibilidades. Após a análise da modelagem o robô real poderá ser desenvolvido.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Maria das Graças Bruno Marietto - Integrante / Wagner Tanaka Botelho - Coordenador.
Membro: Maria das Gracas Bruno Marietto.
9.   2010-2015. Dinamica de populacoes estruturadas
Descrição: O projeto trata de dinâmica de populações biológicas ditas estruturadas. As estruturas referidas podem ser de idade, de classe, de estágio de vida. Tais estruturas são importantes quando diferentes classes tem comportamentos dinâmicos diferentes.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Renato Mendes Coutinho - Integrante / Roberto André Kraenkel - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Renato Mendes Coutinho.
10.   2010-Atual. Electronic properties of metallic contacts in TlBr radiation detection devices
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Cedric Rocha Leão - Integrante / Lordi, Vincenzo - Coordenador / Lars Voss - Integrante / Adam Conway - Integrante. Financiador(es): Lawrence Livermore National Laboratory - Remuneração.
Membro: Cedric Rocha Leao.
11.   2010-2011. Enabling Scalable Cloud Services Choreography Baile
Descrição: O projeto Baile aqui descrito tem como objetivo estudar problemas relacionados ao desenvolvimento e uso de coreografias em ambientes de grande escala, em particular no contexto de Computação em Nuvem. O projeto irá investigar como tornar possível a evolução de coreografias à medida em que novos serviços e novas versões de serviços tornam-se disponíveis e como manter o sistema funcionando com desempenho aceitável na presença de falhas e mudanças dinâmicas na nuvem. A abordagem irá basear-se (1) no desenvolvimento de metodologias e catalogação de boas práticas para a implementação correta de serviços fracamente acoplados e (2) na representação explícita das dependências entre os serviços de forma que reconfigurações dinâmicas possam ser executadas sem a quebra dessas dependências de forma a permitir a evolução robusta e eficiente de coreografias de serviços em ambientes complexos de grande escala... Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Emilio de Camargo Francesquini - Integrante / Alfredo Goldman vel Lejbman - Integrante / Fabio Kon - Coordenador / Marco Gerosa - Integrante / Edson Nery - Integrante. Financiador(es): Hewlett-Packard Brasil - Matriz - Auxílio financeiro.
Membro: Emilio de Camargo Francesquini.
12.   2010-2013. Estudo da interacao de bacterias com populacoes naturais de ciliados marinhos no Brasil
Descrição: Neste projetos estudamos a diversidade de bactérias simbiontes potencialmente patogênicas em associação com protistas ciliados do rio de Janeiro e avaliamos o potencial destes organismos na produção de metabólitos secundários. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Marcus Vinicius Xavier Senra - Coordenador / Inácio domingos da silva neto - Integrante / Roberto Junio P. Dias - Integrante / SOARES, CARLOS A. G. - Integrante / Giulio Petroni - Integrante. Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
Membro: Marcus Vinicius Xavier Senra.
13.   2010-2016. Estudo dos raios cosmicos de mais altas energias com o Observatorio Pierre Auger
Descrição: O projeto de construção e operação do Observatório Pierre Auger é uma obra desenvolvida em colaboração internacional, envolvendo pesquisadores de instituições em dezessete países. O Observatório Auger tem como objetivo principal o estudo de raios cósmicos na faixa de energias em torno e acima de 1018 eV. Presentemente, esses raios cósmicos são as partículas de mais alta energia já observadas na natureza. Os dados experimentais obtidos no Observatório permitem dar passos importantes no entendimento de origem, processos de aceleração, propagação desde as fontes até a Terra, composição e espectro energético desses raios cósmicos de energias ultra altas. Em seu projeto original, o Observatório está concebido como constituído de dois sítios, um em cada hemisfério terrestre, visando a cobertura total do céu. O sítio sul do Observatório está localizado próximo à cidade de Malargüe, na Argentina, e teve sua construção concluída em junho de 2008. Este projeto temático vem suceder ao anterior, já apoiado pela FAPESP (1999/05404-3), e tem como objetivos viabilizar a continuidade da participação de pesquisadores paulistas na Colaboração Auger, contribuir com a parcela correspondente aos pesquisadores paulistas para a operação e a manutenção do Observatório nos próximos quatro anos, viabilizar a reposição de equipamento, e também possibilitar a participação dos pesquisadores nos turnos de operação dos detectores e Reuniões de Trabalho.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Celio Adrega de Moura Junior - Integrante / Anderson C. Fauth - Integrante / Ernesto Kemp - Integrante / Leigui - Integrante / Vitor - Integrante / Todero - Integrante / Carola Dobrigkeit - Coordenador / José Augusto Chinellato - Integrante / Philippe Gouffon - Integrante / ALBUQUERQUE, IVONE.F.M. - Integrante / ESCOBAR, C O - Integrante / Rogério M. de Almeida - Integrante / Edivaldo Moura Santos - Integrante / Fernando Catalani - Integrante / Marcio Aparecido Muller - Integrante.
Membro: Celio Adrega de Moura Junior.
14.   2010-2015. Estudo espectroscopico e espectrometrico de nanoparticulas Metalicas sintetizadas na presenca de aminoacidos na regiao do VUV
Descrição: Nanopartículas metálicas são interessantes devido a características ópticas, elétricas, catalíticas e magnéticas. Essas propriedades estão fortemente correlacionadas ao tamanho das partículas. Compósitos híbridos biológico-inorgânicos têm sido amplamente investigados, devido principalmente às suas possíveis aplicações em bionanotecnologia. A síntese de nanopartículas metálicas, que podem ser diretamente obtidas na presença de moléculas (dendriméricas, poliméricas, biológicas) estabilizadoras, representa uma nova maneira de obtenção destes nanocompósitos em solução aquosa. As nanopartículas podem então ser aplicadas em sensores, fotônica, liberação controlada de fármacos, etc. Recentemente, no grupo de pesquisa na UFABC junto com colaboradores têm se empenhado na síntese e caracterização de nanopartículas metálicas utilizando moléculas biológicas, onde estruturas tridimensionais, por exemplo, foram obtidas ao utilizar o aminoácido metionina durante a rota sintética de nanopartículas de ouro. Estendendo esse conceito, essa parte do projeto tem o principal objetivo de sintetizar e caracterizar esses materiais, assim como utilizar irradiação por luz síncrotron na faixa do Ultravioleta de vácuo (energias a partir de 11 eV até 280 eV) no estudo da fotoionização e fragmentação iônica da amostra em fase gasosa (sublimada). Para isso, nanopartículas de Au, Ag, Pd e Pt serão obtidas por redução química (a partir do sal metálico) na presença de diferentes tipos de aminoácidos, como a metionina e a cisteína. Geralmente, técnicas espectroscópicas, microscópicas e eletroquímicas são empregadas na caracterização dos nanocompósitos obtidos. Assim, este projeto de pesquisa visa estender nossos conhecimentos na área de síntese e caracterização de nanopartículas metálicas na presença de aminoácidos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . Integrantes: Alexsandre Figueiredo Lago - Coordenador / Juan Z. Davalos - Integrante / R.L. Cavasso-Filho - Integrante / Frank Nelson Crespilho - Integrante.
Membro: Alexsandre Figueiredo Lago.
15.   2010-2015. Imagens Medicas de Tomografia por Impedanica Eletrica para Anestesia e Pacientes Neonatos
Descrição: Projeto tematico - FINEP - envolvendo a Escola Politécnica da USP, a Faculdade de Medicina da Universidade de Sáo Paulo, e a micro-empresa Timpel S.A. O objetivo é desenvolver aplicativos para diagnósticos em condições especiais encontradas em pediatria e anestesia. Novas cintas de eletrodos dedicadas a ambas condições serão desenvolvidas.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . Integrantes: Fernando Silva de Moura - Integrante / AA-erick camargo - Integrante / Raul Gonzalez Lima - Integrante / AMATO, MARCELO BRITO PASSOS - Coordenador / Vinicius Torsani - Integrante / Adriana Sayuri Hirota - Integrante / Guilherme Buzon Gregores - Integrante / Mauro Roberto Tucci - Integrante / Alexandre Bezerra de Melo - Integrante.
Membro: Fernando Silva de Moura.
16.   2010-2012. Influencia da funcao f no espalhamento de positrons e eletrons por moleculas
Descrição: O objetivo deste trablho é estudar a influência da função f em diversos tipos de moléculas usando a implementação mais recente do método multicanal de Schwinger. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Romarly Fernandes da Costa - Integrante / Marco Aurélio Pinheiro Lima - Integrante / Sérgio d'Almeida Sanchez - Coordenador / Márcio Henrique de Franco Bettega - Integrante.
Membro: Romarly Fernandes da Costa.
17.   2010-2012. Influencia do orbital f no espalhamento de positrons e eletrons por hidrocarbonetos
Descrição: Este projeto visa o estudo do efeito do orbital tipo f espalhamento e pósitrons e elétrons por hidrocarbonetos usando o método multicanal de Schwinger. Esta função se mostrou importante para o C2H6 e será testada agora em outras moléculas da mesma família.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Romarly Fernandes da Costa - Integrante / Marco Aurélio Pinheiro Lima - Integrante / Sérgio d'Almeida Sanchez - Coordenador / Márcio Henrique de Franco Bettega - Integrante. Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Romarly Fernandes da Costa.
18.   2010-2013. Large Scale Choreographies for the Future Internet - Choreos
Descrição: CHOReOS rationale is sustaining decentralized service choreographies in the Future Internet. It revisits the concept of choreography-centric service-oriented systems to introduce a dynamic development process and associated methods, tools, and middleware referred to as CHOReOS Integrated Development and Runtime Environment (IDRE) for software systems coordinating services in the Ultra Large Scale Future Internet.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (4) . Integrantes: Emilio de Camargo Francesquini - Integrante / Alfredo Goldman vel Lejbman - Integrante / Fabio Kon - Coordenador / Marco Gerosa - Integrante. Financiador(es): European Commission - Auxílio financeiro.
Membro: Emilio de Camargo Francesquini.
19.   2010-Atual. Levantamento multiescalar de comunidades marinhas bentonicas de substrato consolidado
Descrição: A variabilidade em pequena escala (centímetros e metros) na diversidade de organismos bentônicos de substrato consolidado pode ser o reflexo de diferentes padrões de recrutamento, crescimento e mortalidade desses organismos, e atributos do substrato, como heterogeneidade e inclinação, mas estes padrões são provavelmente gerados por processos outros àqueles sugeridos para a larga escala. Em particular, a interação entre os atributos físicos do hábitat e as interações biológicas é responsável por grande parte da variabilidade de padrões observada de um costão rochoso para o outro. Entretanto, há pouca informação na literatura que permita confirmar essa hipótese, em especial para os ambientes bentônicos do Brasil. Nesse contexto, o objetivo deste projeto é a caracterização de padrões de ocorrência das assembléias de espécies marinhas bentônicas em diferentes escalas, correspondentes à estruturação das comunidades em seus diferentes níveis de organização. A partir do reconhecimento das condições ambientais onde cada padrão de macroescala pode ocorrer, objetiva-se a previsão, a partir das características físicas do ambiente, de quais padrões de ocorrência são esperados, partindo da hipótese de que a ocorrência de padrões em escalas maiores seja determinada principalmente pelo tipo de habitat.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes - Integrante / Flávio Augusto de Souza Berchez - Coordenador / Mutuê Toyota Fujii - Integrante / Silvia M. Pitta Beauclair Guimarães - Integrante / Alexander Turra - Integrante.
Membro: Natalia Pirani Ghilardi-Lopes.
20.   2010-2012. Modelagem de objetos usando morfologia matematica e grafos de vizinhanca
Descrição: (Processo: 2009/14430-1). A modelagem de objetos usando morfologia matemática e grafos de vizinhança, além da validação de novos conceitos e testes de eficiência, serão trabalhos neste projeto de pesquisa. Propomos dar continuidade aos estudos realizados de operadores morfológicos usando grafos de vizinhança e aplicar em problemas de processamento de imagens, destacando a segmentação de células em biologia.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (4) . Integrantes: Francisco de Assis Zampirolli - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 12
Membro: Francisco de Assis Zampirolli.
21.   2010-2011. Modelagem molecular e caracterizacao experimental de peptideos bioativos, substratos da Enzima Conversora de Angiotensina I em diferentes fluidos biologicos de origem humana
Descrição: A variedade estrutural de peptídeos bioativos susceptíveis à hidrólise pela Enzima Conversora de Angiotensina I (ECA) requer a análise detalhada das interações entre estes substratos e a enzima, para uma melhor compreensão das especificidades dos seus domínios N e C. Atualmente, a cristalografia de Raios-X é a ferramenta mais poderosa na determinação da estrutura molecular tridimensional de proteínas, bem como das possíveis interações enzima-substrato, no estado sólido. Entretanto, a estrutura cristalina fornece informações estruturais estáticas da macromolécula, sem levar em consideração o efeito do solvente, e que as proteínas apresentam elevada liberdade conformacional, a qual é influenciada pela flutuação térmica do sistema. Por esse motivo, propomos investigar as diferentes características intrínsecas dos peptídeos hidrolisados pela ECA, dos dois domínios da ECA, além dos complexos proteína-peptídeos, utilizando-se métodos de modelagem e simulação molecular, aliados a experimentos de caracterização experimental de isoenzimas de ECA isoladas de diferentes fluídos biológicos de origem humana. Em especial, propõe-se a realização de analises conformacionais, cálculos mecânico-quanticos, modelagem com Dinâmica Molecular, Docking e QM/MM (Quantum Mechanics/Molecular Mechanics). Os seguintes peptídeos serão estudados: angiotensina I, angiotensina-(1-7), bradicinina, neurotensina, substância P, des-Arg9-bradicinina e Ac-SDKP. Assim, entender as diferentes especificidades apresentadas frente a peptídeos bioativos estruturalmente bem diferentes é de fundamental importância para o desenvolvimento de novos inibidores e novos substratos específicos para cada um dos domínios da ECA.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) . Integrantes: Renato Ferreira de Freitas - Coordenador. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
Membro: Renato Ferreira de Freitas.
22.   2010-2014. PET 2010 - Edital n 09
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (12) . Integrantes: Ronei Miotto - Coordenador / Hugo Barbosa Suffredini - Integrante / Wendel Andrade Alves - Integrante / L. P. B. Scott - Integrante / Paula Homem-de-Mello - Integrante. Financiador(es): Ministério da Educação - Bolsa.
Membro: Ronei Miotto.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (12) . Integrantes: Paula Homem-de-Mello - Coordenador / Hugo Barbosa Suffredini - Integrante / Wendel Andrade Alves - Integrante / Ronei Miotto - Integrante / L. P. B. Scott - Integrante. Financiador(es): Ministério da Educação - Bolsa.
Membro: Paula Homem-de-Mello.
23.   2010-2014. Projeto Jovem Pesquisador (2008/10537-3) - Estudo de polimorfos de farmacos cristalinos atraves da difracao de raios X por policristais e do metodo de Rietveld
Descrição: Fármacos podem se cristalizar de diversas formas (polimorfos), as quais podem apresentar diferenças nas propriedades físicas e químicas e na biodisponibilidade. O polimorfismo decorre das condições empregadas na síntese e purificação da substância, dependendo, por exemplo, do tipo de solvente utilizado e da temperatura da reação. A maioria dos fármacos é administrada na forma sólida, podendo sua estrutura ser amorfa ou policristalina. As formas policristalinas são facilmente detectadas por difração de raios X e, conhecendo-se a estrutura cristalina, é possível realizar a quantificação dos polimorfos nos fármacos através da aplicação do método de Rietveld. Neste projeto será estabelecido o procedimento adequado para obtenção de dados de difração de raios X por policristais que permitam a quantificação inequívoca dos polimorfos presentes em alguns fármacos atualmente usados na indústria farmacêutica brasileira ou em farmácias de manipulação bem como, quando for o caso, a determinação de sua estrutura cristalina usando dados de difração por policristais. A importância de tal pesquisa está ligada ao anseio das indústrias farmacêuticas em melhorar cada vez mais a qualidade de seus produtos e da importante ação social resultante da melhor qualidade dos medicamentos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (1) . Integrantes: Fabio Furlan Ferreira - Coordenador / Carlos de Oliveira Paiva Santos - Integrante / Selma Gutierrez Antonio - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T A: 13
Membro: Fabio Furlan Ferreira.


(*) Relatório criado com produções desde 2010 até 2022
Data de processamento: 21/09/2022 19:52:37