Publicações

Nathalia de Setta Costa

Possui graduação em Licenciatura em Ciências Biológicas pela UNESP Campus de São José do Rio Preto (2002) e, Mestrado (2005) e Doutorado (2009) em Genética pela mesma universidade, como doutorado sanduíche no Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS/Gyf-Sur-Yvette/França). Pós-doutorado no Depto de Botânica da USP, com estágio no exterior no Institut National de la Recherche Agronomique (INRA/Toulouse/França). Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Genética Evolutiva e Funcional, atuando principalmente nos seguintes temas: evolução e impacto dos elementos de transposição nos genomas vegetais, genética do estresse hídrico vegetal, prospecção de genes com importância biotecnológica. Atualmente é Professora Associada na UFABC, Brasil. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/2574016827971663 (06/09/2022)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq:

Período de análise:

Endereço: Universidade Federal do ABC, Centro de Ciências Naturais e Humanas. Rua Arcturus, 03, Bloco Delta, Sala 283 Jardim Antares 09606070 - São Bernardo do Campo, SP - Brasil Telefone: (11) 23206306 URL da Homepage: http://www.ufabc.edu.br/

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Genética

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (14)
1. SIMÕES, MARCELLA SIQUEIRA ; CARVALHO, GABRIEL GARON ; FERREIRA, SÁVIO SIQUEIRA ; HERNANDES-LOPES, JOSÉ ; DE SETTA, NATHALIA ; CESARINO, IGOR. Genome-wide characterization of the laccase gene family in Setaria viridis reveals members potentially involved in lignification. PLANTA. v. 251, p. 46, issn: 0032-0935, 2020.
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2. MASUDA, H. P. ; NAKABASHI, M. ; MORGANTE, P. ; KAJIHARA, D. ; SETTA, N. ; MENCK, C. F. M. ; SLUYS, M. A. V.. Evidence for sub-functionalization of tandemly duplicated XPB nucleotide excision repair genes in Arabidopsis thaliana. GENE. p. 144818, issn: 0378-1119, 2020.
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3. TAVARES, EVELINE Q P ; DE SOUZA, AMANDA P ; ROMIM, GRAYCE H ; GRANDIS, ADRIANA ; PLASENCIA, ANNA ; GAIARSA, JONAS W ; GRIMA-PETTENATI, JACQUELINE ; DE SETTA, NATHALIA ; Van Sluys, Marie-Anne ; BUCKERIDGE, MARCOS S. The control of endopolygalacturonase expression by the sugarcane RAV transcription factor during aerenchyma formation. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY. v. 70, p. 497-506, issn: 0022-0957, 2019.
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4. SUGUIYAMA, VANESSA FUENTES ; VASCONCELOS, LUIZ AUGUSTO BACIEGA ; ROSSI, MARIA MAGDALENA ; BIONDO, CIBELE ; DE SETTA, NATHALIA. The population genetic structure approach adds new insights into the evolution of plant LTR retrotransposon lineages. PLoS One. v. 14, p. e0214542, issn: 1932-6203, 2019.
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5. DE OLIVEIRA SILVA, FRANKLIN MAGNUM ; LICHTENSTEIN, GABRIEL ; ALSEEKH, SALEH ; ROSADO-SOUZA, LAISE ; CONTE, MARIANA ; SUGUIYAMA, VANESSA FUENTES ; LIRA, BRUNO SILVESTRE ; FANOURAKIS, DIMITRIOS ; USADEL, BJÖRN ; BHERING, LEONARDO LOPES ; DAMATTA, FÁBIO M. ; SULPICE, RONAN ; ARAÚJO, WAGNER L. ; ROSSI, MAGDALENA ; DE SETTA, NATHALIA ; FERNIE, ALISDAIR R. ; CARRARI, FERNANDO ; NUNES-NESI, ADRIANO. The genetic architecture of photosynthesis and plant growth-related traits in tomato. PLANT CELL AND ENVIRONMENT. v. 41, p. 327-341, issn: 0140-7791, 2018.
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6. SIMÃO, M C ; HAUDRY, A ; GRANZOTTO, A ; SETTA, N ; CARARETO, C M A. Helena and BS: two travellers between the genera Drosophila and Zaprionus. Genome Biology and Evolution. v. 10, p. 2671-2685, issn: 1759-6653, 2018.
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7. VILELA, MARIANE DE MENDONÇA ; DEL-BEM, LUIZ-EDUARDO ; Van Sluys, Marie-Anne ; DE SETTA, NATHALIA ; KITAJIMA, JOÃO PAULO ; CRUZ, GUILHERME MARCELO QUEIROGA ; SFORÇA, DANILO AUGUSTO ; DE SOUZA, ANETE PEREIRA ; FERREIRA, PAULO CAVALCANTI GOMES ; GRATIVOL, CLÍCIA ; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO ; VICENTINI, RENATO ; VINCENTZ, MICHEL. Analysis of three sugarcane homo/homeologous regions suggests independent polyploidization events of Saccharum officinarum and Saccharum spontaneum. Genome Biology and Evolution. v. 9, p. evw293, issn: 1759-6653, 2017.
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8. MEDEIROS, AMANDA L. ; FURTADO, CRISTIANE M. ; LEITE, FRANCINALDO S. ; SOUTO, VALESKA S. ; DE SETTA, NATHALIA ; Van Sluys, Marie-Anne ; KITAJIMA, JOÃO PAULO ; COSTA, ANA PAULA P. ; BENEDITO, VAGNER A. ; SCORTECCI, KATIA C.. Molecular Genetic Dissection of Sugarcane Flowering under Equatorial Field Conditions. Tropical Plant Biology. v. 1, p. 1-15, issn: 1935-9756, 2016.
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9. ROSADO, DANIELE ; GRAMEGNA, GIOVANNA ; CRUZ, ALINE ; LIRA, BRUNO SILVESTRE ; FRESCHI, LUCIANO ; DE SETTA, NATHALIA ; ROSSI, MAGDALENA. Phytochrome Interacting Factors (PIFs) in Solanum lycopersicum: Diversity, Evolutionary History and Expression Profiling during Different Developmental Processes. Plos One. v. 11, p. e0165929, issn: 1932-6203, 2016.
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10. LIRA, BRUNO SILVESTRE ; DE SETTA, NATHALIA ; ROSADO, DANIELE ; ALMEIDA, JULIANA ; FRESCHI, LUCIANO ; ROSSI, MAGDALENA. Plant degreening: evolution and expression of tomato (Solanum lycopersicum) dephytylation enzymes. Gene (Amsterdam). v. 546, p. 359-366, issn: 0378-1119, 2014.
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11. DE SETTA, NATHALIA; DE SETTA, NATHALIA MONTEIRO-VITORELLO, CLÁUDIA BARROS METCALFE, CUSHLA JANE CRUZ, GUILHERME MARCELO DEL BEM, LUIZ EDUARDO VICENTINI, RENATO NOGUEIRA, FÁBIO TEBALDI CAMPOS, ROBERTA ALVARES NUNES, SIDENY LIMA TURRINI, PAULA CRISTINA VIEIRA, ANDREIA PRATA OCHOA CRUZ, EDGAR ANDRÉS CORRÊA, TATIANA CAROLINE HOTTA, CARLOS TAKESHI DE MELLO VARANI, ALESSANDRO VAUTRIN, SONIA DA TRINDADE, ADILSON SILVA DE MENDONÇA VILELA, MARIANE LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI SATO, PALOMA MIEKO DE ANDRADE, RODRIGO FANDINO NISHIYAMA, MILTON YUTAKA CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO SCORTECCI, KATIA CASTANHO GARCIA, ANTÔNIO AUGUSTO , et al.CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO KIM, CHANGSOO PATERSON, ANDREW H BERGÈS, HÉLÈNE D'HONT, ANGÉLIQUE DE SOUZA, ANETE PEREIRA SOUZA, GLAUCIA MENDES VINCENTZ, MICHEL KITAJIMA, JOÃO PAULO Van Sluys, Marie-Anne ; Building the sugarcane genome for biotechnology and identifying evolutionary trends. Building the sugarcane genome for biotechnology and identifying evolutionary trends. BMC Genomics. v. 15, p. 540, issn: 1471-2164, 2014.
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12. Cruz, Guilherme M. Q. ; Metcalfe, Cushla J. ; DE SETTA, NATHALIA ; CRUZ, EDGAR A. O. ; VIEIRA, ANDRÉIA PRATA ; MEDINA, ROSARIO ; Van Sluys, Marie-Anne. Virus-Like Attachment Sites and Plastic CpG Islands: Landmarks of Diversity in Plant Del Retrotransposons. Plos One. v. 9, p. e97099, issn: 1932-6203, 2014.
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13. ALMEIDA, J. ; QUADRANA, L. ; Asis, R. ; SETTA, N. ; de GODOY, F. ; BERMUDEZ, L. ; Otaiza, S. N. ; Correa da Silva, J. V. ; FERNIE, A. R. ; CARRARI, F. ; ROSSI, M.. Genetic dissection of vitamin E biosynthesis in tomato. Journal of Experimental Botany. v. 62, p. 3781-3798, issn: 0022-0957, 2011.
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14. Setta, Nathalia ; Sluys, Marie-Anne ; CAPY, Pierre ; Carareto, Claudia Marcia Aparecida. Copia Retrotransposon in the Zaprionus Genus: Another Case of Transposable Element Sharing with the Drosophila melanogaster Subgroup. Journal of Molecular Evolution. v. 72, p. 326-338, issn: 0022-2844, 2011.
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Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (4)
1. JESUS, E.M. ; QUINTANILHA, D. M. ; SETTA, N. ; Van Sluys, Marie-Anne. Genoma Móvel - Mecanismos de Transposição e Impacto Evolutivo. Em: Carlos FM Menck; Marie-Anne Van Sluys. (Org.). Genética Molecular Básica - Dos Genes aos Genomas. 1ed.Rio de Janeiro. : Guanabara Koogan. 2017.v. 1, p. 335-354.
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2. KUROKI, M. A. ; SETTA, N.. Elementos de transposição, marcadores moleculares e aplicabilidade biotecnológica. Em: Claudia Marcia Ap. Carareto, Claudia Barros Monteiro-Vitorello, Marie-Anne Van Sluys. (Org.). Elementos de transposição: diversidade, evolução, aplicações e impactos nos genomas dos seres vivos. 1ed.Rio de Janeiro. : Sociedade Brasileira de Genética/Editora Fiocruz. 2015.v. 1, p. 169-194.
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3. Setta, Nathalia ; Metcalfe, Cushla J. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; Ochoa, Edgar A. ; Sluys, Marie-Anne. Noise or Symphony: Comparative Evolutionary Analysis of Sugarcane Transposable Elements with Other Grasses. Em: Marie-Angèle Grandbastien, Josep M. Casacuberta. (Org.). Plant Transposable Elements: Impact on Genome Structure and Function. 1ed.Berlin. : Springer-Verlag Berlin Heidelberg. 2012.v. 24, p. 169-192.
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4. SLUYS, Marie Anne Van ; Setta, Nathalia ; Scortecci KC ; COSTA, Ana Paula Pimentel. O genoma instável, sequências genéticas móveis. Em: Sergio Russo Matioli; Flora Maria de Campos Fernandes. (Org.). Biologia Molecular e Evolução. 2ed.Ribeirão Preto. : Holos. 2012.p. 79-90.
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Textos em jornais de notícias/revistas (2)
1. SUGUIYAMA, VANESSA FUENTES ; RODRIGUES, J. D. P. ; SANTOS, T. C. N. ; LIRA, BRUNO SILVESTRE ; HARO, L. A. ; SILVA, J. P. N. ; BORBA, E. L. ; PURGATTO, E. ; SILVA, E. A. ; BELLORA, N. ; CARRARI, FERNANDO ; CENTENO, D. C. ; BERMUDEZ, L. ; ROSSI, M. ; SETTA, N.. Regulatory mechanisms behind the phenotypic plasticity associated with Setaria italica water deficit tolerance (é um paper que não carrega no laltes por erro no sistema). Plant Molecular Biology, Site da revista, p. 761-780, 07 maio 2022.
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2. REFUNDINI, J. V. L. ; MAFFEI, M. ; BERALDO, R. G. ; IGUMA, T. S. ; SETTA, N.. Edição dos genes: uma técnica que pode curar doenças. UFABC Divulga Ciência, Santo André, SP, Brasil, p. 8-8, 20 jul. 2021.
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Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (28)
1. SILVA, J. C. S. ; SUGUIYAMA, VANESSA FUENTES ; HARO, L. A. ; LIRA, BRUNO SILVESTRE ; CARRARI, FERNANDO ; BERMUDEZ, L. ; CENTENO, D. C. ; ROSSI, MAGDALENA ; SETTA, N.. Avaliação do perfil de regulação gênica em Setaria italica sob diferentes intensidades de estresse hídrico. Em: XX Congresso Metodista de Iniciação e Produção Científica e XIX Seminário de Extensão, 2018, São Bernardo do Campo. XX Congresso Metodista de Iniciação e Produção Científica e XIX Seminário de Extensão, 2018.
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2. RODRIGUES, J. D. P. ; SUGUIYAMA, V. F. ; SANTOS, T. C. N. ; SILVA, E. A. ; Rossi MM ; CENTENO, D. C. ; Setta, Nathalia. Drought stress responses in Setaria italica cultivated under water restriction. Em: VI Simpósio Brasileiro de Biologia Molecular de Plantas, 2017, Ouro Preto. VI Simpósio Brasileiro de Biologia Molecular de Plantas, 2017.
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3. SANTOS, T. C. N. ; SUGUIYAMA, V. F. ; RODRIGUES, J. D. P. ; SEIXAS, L. B. ; Rossi MM ; SETTA, N.. Phenotypic plasticity of Setaria italica cultivated under water stress. Em: VI Simpósio Brasileiro de Biologia Molecular de Plantas, 2017, Ouro Preto. VI Simpósio Brasileiro de Biologia Molecular de Plantas, 2017.
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4. SUGUIYAMA, V. F. ; BIONDO, C. ; SETTA, N.. Transposable elements as individuals in a population - a population structure approach for studying LTR retrotransposon lineages evolution. Em: VI Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2017, Ouro Preto - MG. Anais do VI Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2017.
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5. CRUZ, A. C. O. ; SILVA, M. V. G. ; SETTA, N. ; CENTENO, D. C. ; MASUDA, H. P.. Phylogenetic and expression analysis of malate dehydrogenase (MDH) in grasses. Em: VI Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2017, Ouro Preto. VI Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2017.
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6. SUGUIYAMA, V. F. ; BIONDO, C. ; SETTA, N.. Structure and evolution of Setaria italica LTR retrotransposons. Em: Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambú. Brazilian-International Congress of Genetics, 2016.
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7. SUGUIYAMA, V. F. ; SANTOS, T. C. N. ; SOUZA, D. ; SILVA, J. P. N. ; CARDOSO, P. ; BUCKERIDGE, M. ; BORBA, E. L. ; ROSSI, M. ; CENTENO, D. C. ; SETTA, N.. Fitness components of Setaria italica (L.) P. Beauv. under water stress conditions. Em: Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambú. Brazilian-International Congress of Genetics, 2016.
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8. GIMENEZ, B. T. ; SUGUIYAMA, V. F. ; SETTA, N.. Transposable elements impact on Setaria italica genome and gene structure. Em: 11th International Congress of Plant Molecular Biology, 2015, Foz do Iguaçú. 11th International Congress of Plant Molecular Biology, 2015.
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9. LICHTENSTEIN, G. ; CONTE, M. ; SILVA, F. M. O. ; LIRA, BRUNO SILVESTRE ; SETTA, N. ; SUGUIYAMA, V. F. ; FERNIE, A. R. ; Rossi MM ; NUNES-NESI, A. ; CARRARI, F.. Genomic analyses of tomato traits associated to photosynthetic capacity and biomass accumulation. Em: 11th International Congress of Plant Molecular Biology, 2015, Foz do Iguaçú. 11th International Congress of Plant Molecular Biology, 2015.
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10. LIRA, BRUNO SILVESTRE ; Setta, Nathalia ; ROSADO, DANIELE ; ALMEIDA, JULIANA ; FRESCHI, LUCIANO ; ROSSI, MAGDALENA. Plant degreening: evolution and expression of tomato (Solanum lycopersicum) dephytylation enzymes. Em: Decision-Making Pathways, Networks, and Models in Plant Biology - GRC, 2014, Holderness. Decision-Making Pathways, Networks, and Models in Plant Biology - GRC, 2014.
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11. VARANI, A. M. ; SETTA, N. ; Cruz, Guilherme M. Q. ; CRUZ, E. A. O. ; METCALFE, C.J. ; GAIARSA, J. W. ; PALHARES, A. ; VIEIRA, M. L. C. ; KITAJIMA, J. P. ; SLUYS, M. A. V. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B.. Biocuration improves annotation of protein-coding genes in the sugarcane genome. Em: XXI Plant Animal Genome Conference, 2013, San Diego. XXI Plant Animal Genome Conference, 2013.
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12. VITORELLO, C. ; SETTA, N. ; Cruz GM ; CRUZ, E. A. O. ; METCALFE, C.J. ; CAMPOS, R. A. ; HOTTA, C. ; VILELA, M. M. ; VINCENTZ, M. ; NOGUEIRA, F. ; VICENTINI, R. ; VAUTRIN, S. ; SOUZA, G. ; BERGES, H. ; GAIARSA, J. W. ; KITAJIMA, J. P. ; SLUYS, Marie Anne Van. 300 BACs Acomplished. Em: Plant Animal Genome XX, 2012, San Diego. Plant Animal Genome XX, 2012.
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13. VINCENTZ, M. ; VILELA, M. M. ; VICENTINI, R. ; SETTA, N. ; Cruz GM ; CONTE, M. ; SFORZA, D. ; SOUZA, A. P. ; BERGES, H. ; KITAJIMA, J. P. ; GARCIA, A. A. F. ; SLUYS, Marie Anne Van ; DEL BEM, LEV. Sugarcane Allelic Variation: What Does It Tell About Polyploidization. Em: Plant Animal Genome XX, 2012, San Diego. Plant Animal Genome XX, 2012.
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14. CARARETO, C. M. A. ; DIAS, E. S. ; CAPY, Pierre ; SLUYS, Marie Anne Van ; SETTA, N.. Drosophilids as a model of recent invasion and ancestral polymorphism of transposable elements. Em: ICTE 2012 - International Congress on Transposable Elements, 2012, Saint Malo. ICTE 2012 - International Congress on Transposable Elements, 2012.
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15. METCALFE, C.J. ; Domingues DS ; Cruz GM ; Setta, Nathalia ; SLUYS, Marie Anne Van. Sugarcane LTR-RT retrotranspons; lineages, structure, age and genomic localisation. Em: ICTE 2012 - International Congress on Transposable Elements, 2012, Saint Malo. ICTE 2012 - International Congress on Transposable Elements, 2012.
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16. CRUZ, E. A. O. ; Cruz GM ; JESUS, E.M. ; Setta, Nathalia ; SLUYS, Marie Anne Van. Characterization of Domesticated Transposable Elements Related to the SChAT (hAT-like sugarcane) Family. Em: ICTE 2012 - International Congress on Transposable Elements, 2012, Saint Malo. ICTE 2012 - International Congress on Transposable Elements, 2012.
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17. SANTOS, P. K. F. ; SETTA, N. ; BONETTI, A. M. ; ARIAS, M. C. ; BRITO, R. M.. Identification of mariner transposable elements in stingless bees genomes and evaluation of its presence in melipona, Lliger 1806 (Hymenoptera, Apidae, Meliponini) related to different heterochromatin contents. Em: 58° Congresso Brasileiro de genética, 2012, Foz do Iguaçú. 58º Congresso Brasileiro de Genética, 2012.
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18. METCALFE, C.J. ; CRUZ, G. M. Q. ; SETTA, N. ; SAMPAIO, M. ; KITAJIMA, J. P. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; SLUYS, M. A. V.. Sugarcane mobilome and genome associated variation. Em: 10th International Plant Molecular Biology Congress, 2012, Jeju. 10th International Plant Molecular Biology Congress, 2012.
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19. SETTA, N. ; KITAJIMA, J. P. ; SLUYS, Marie Anne Van. Diversity and evolution of Helitrons transposons in "Saccharum complex" species. Em: 57° Congresso Brasileiro de Genética, 2011, Águas de Lindóia. 57° Congresso Brasileiro de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.
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20. SETTA, N. ; DU, C. ; KITAJIMA, J. P. ; SLUYS, Marie Anne Van. Helitron transposon prediction in sugarcane using the HelitronFinder program. Em: III Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2011, Ilhéus. III Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.
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21. CAMPOS, R. A. ; SETTA, N. ; KIM, C. ; ALMEIDA, A. ; HOTTA, C. ; LEMBKE, C. ; SATO, P. ; NUNES, S. ; Junior, M.Y. ; Cruz GM ; GAIARSA, J. W. ; PATERSON, A. ; KITAJIMA, J. P. ; SLUYS, Marie Anne Van ; SOUZA, G.. A strategy to select and sequence sugarcane BACs corresponding to gene-rich regions. Em: III Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2011, Ilhéus. III Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.
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22. ALMEIDA, A. ; CAMPOS, R. A. ; HOTTA, C. ; SETTA, N. ; Cruz GM ; GAIARSA, J. W. ; LEMBKE, C. ; SATO, P. ; NUNES, S. ; KITAJIMA, J. P. ; SLUYS, Marie Anne Van ; DURHAM, A. ; SOUZA, G.. Sugarcane genome annotation based in sorghum genome and ESTs mapping. Em: III Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2011, Ilhéus. III Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.
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24. VILELA, M. M. ; SETTA, N. ; SLUYS, Marie Anne Van ; VINCENTZ, M.. Polymorphic and syntenic analysis of three distinct region of sugarcane genome. Em: III Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2011, Ilhéus. III Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.
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25. VILELA, M. M. ; DEL BEM, LEV ; SETTA, N. ; KITAJIMA, J. P. ; SLUYS, Marie Anne Van ; VINCENTZ, M.. Comparative genomic analysis of TOR locus from sugarcane, sorghum and rice: insights into sugarcane genome evolution. Em: Current Opinion Conferences: Plant Genome Evolution, 2011, Amsterdan. Current Opinion Conferences: Plant Genome Evolution, 2011.
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26. Van Sluys, Marie-Anne ; Rossi MM ; Cruz GM ; CRUZ, E. A. O. ; SETTA, N. ; Abrantes E ; Domingues DS ; Scortecci KC. Assemble the sugarcane genome, the use R570 BACs as a start. Em: Plant animal genomes XVIII Conference, 2010, San Diego. Plant animal genomes XVIII Conference, v. 1, 2010.
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28. SETTA, N. ; SLUYS, Marie Anne Van ; CAPY, Pierre ; CARARETO, Cláudia Márcia Ap. Copia retrotransposon in the Zaprionus genus: another case of transposable element sharing with the Drosophila melanogaster subgroup. Em: SMBE 2010 - Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, 2010, Lyon. SMBE 2010 - Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, 2010.
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Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (11)
1. SETTA, N.. Palestra em mesa-redonda: Tema 'Evolução Molecular'. 2018. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
2. SETTA, N.. Práticas em genômica comparada: análises de ortologia e sintenia. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
3. Setta, N.. Dissecting genetics and epigenetics mechanisms underlying drought tolerance in C4 plants: do transposable elements play a role on the scene?. 2015. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
4. SETTA, N.. Elementos de transposição, marcadores moleculares e aplicabilidade biotecnológica. 2015. Apresentação de Trabalho/Congresso
5. SETTA, N.. Elementos de transposição de cana-de-açúcar: impacto na estrutura e dinâmica do genoma. 2014. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
6. SETTA, N.. Barulho ou sinfonia? Elementos de transposição nos genomas vegetais. 2014. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
7. SETTA, N.. Aplicações biotecnológicas dos elementos de transposição. 2014. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
8. SETTA, N.. Biologia e impacto dos elementos de transposição na evolução dos genomas eucarióticos. 2012. Apresentação de Trabalho/Outra
9. SETTA, N.; Cruz GM ; CRUZ, E. A. O. ; Gomes KA ; CAMPOS, R. A. ; HOTTA, C. ; VILELA, M. M. ; VINCENTZ, M. ; VAUTRIN, S. ; SOUZA, G. ; GAIARSA, J. W. ; KITAJIMA, J. P. ; SLUYS, Marie Anne Van. Sugarcane Genome: A Snapshot From 100 Sequenced BACs. 2011. Apresentação de Trabalho/Simpósio
10. SETTA, N.. Sequencimento de nova-geração: conceitos e aplicações. 2011. Apresentação de Trabalho/Outra
11. SETTA, N.. Evolução dos elementos de transposição em eucariotos. 2011. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro de patente (0)
Programas de computador sem registro de patente (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (13)
1. SETTA, N.. Peer-review para a Mobile DNA. 2018.
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2. SETTA, N.. Peer-review para a Brazilian Jounal of Botany. 2017.
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3. SETTA, N.. Peer-review para Molecular Genetics and Genomics. 2016.
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4. SETTA, N.. Peer-review para Genetics and Molecular Biology. 2016.
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5. SETTA, N.. Peer-review para a Genetics and Molecular Biology. 2016.
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6. SETTA, N.. Peer-review para Brazilian Journal of Botany. 2015.
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7. SETTA, N.. Peer-review para Brazilian Jounal of Botany. 2015.
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8. SETTA, N.. Peer-review para Molecular Genetics and Genomics. 2015.
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9. SETTA, N. . Parecer ad-hoc FAPESP. 2013.
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10. SETTA, N. . Peer-review para Gene. 2013.
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11. SETTA, N.. Peer-review para Plos One. 2012.
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12. SETTA, N.. Peer-review para Genetics and Molecular Biology. 2012.
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13. SETTA, N. ; SLUYS, Marie Anne Van. Análises estruturais, funcionais e evolutivas de Helitrons em cana-de-açúcar. 2011.
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Demais tipos de produção técnica (5)
1. SETTA, N.. Aplicações genéticas e biotecnológicas dos elementos de transposição. 2012. Curso de curta duração ministrado/Outra
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2. SETTA, N.. Sequenciamento de nova-geração: conceitos e aplicações. 2011. Curso de curta duração ministrado/Outra
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3. SETTA, N.; SLUYS, Marie Anne Van ; CARARETO, C. M. A.. Zaprionus retrotransposon gypsy env gene, partial sequence (FJ710405-FJ710422). 2010. Sequencias de DNA depositada no GenBank
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4. SETTA, N.; SLUYS, Marie Anne Van ; CARARETO, C. M. A.. Zaprionus retrotransposon micropia RNAse H domain, partial sequence (FJ710423-FJ710440). 2010. Sequencias de DNA depositada no GenBank
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5. SETTA, N. Filogenia Molecular. 2010. Colaboração na Disciplina BIB538 ?Biologia e Evolução em Procariotos?
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Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (2)
1. Thais Massanet. Análise genômica evolutiva e funcional associada ao estresse hídrico das metacaspases de monocotiledôneas, com ênfase em Setaria italica e Setaria viridis.. Tese (Doutorado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2018.
  Orientador: Nathalia de Setta Costa.
2. Anderson Marques de Oliveira. Caracterização funcional e evolutiva da família gênica malato desidrogenase em Poaceae. Tese (Doutorado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2018.
  Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Dissertação de mestrado (1)
1. Vitor Gabriel Bucieri Theodoro. Análise genômica das famílias ascorbato peroxidase e glutationa peroxidase em Setaria italica e Setaria viridis. Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2022.
  Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (1)
1. Juliana Melo Rodrigues. Diversidade genética derivada de elementos de transposição e seu impacto no genoma funcional vegetal: existe correlação entre o padrão de inserção dessas sequências e as funções gênicas?. Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do ABC, . Início: 2021.
  Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (1)
1. Vanessa Fuentes Suguiyama. Entendendo as respostas plásticas ao estresse hídrico em Setaria italica e a influência dos elementos de transposição. Tese (Doutorado em Evolução e Diversidade) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2019.
  Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Dissertação de mestrado (4)

Tatiane Cristina Nicomedio dos Santos. Análise do fitness de Setaria italica cultivada em diferentes níveis de estresse hídrico. Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC, . 2018.
Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Larissa Batista Seixas. Diversidade da família gênica LEA nas espécies irmãs Setaria italica e Setaria viridis. Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC, . 2018.
Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Pedro Teixeira Pimont. Caracterização dos genes rafinose sintase e estaquiose sintase em gramíneas. Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC, . 2018.
Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Jae Diana Paredes Rodriguez. Identificação de rotas metabólicas associadas ao estresse hídrico na monocotiledônea C4 Setaria italica.. Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2018.
Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (5)

Joice Caroline dos Santos Silva. Avaliação do perfil de regulação gênica em Setaria italica sob diferentes intensidades de estresse hídrico. (Graduando em Biomedicina) - Universidade Metodista de São Paulo, . 2018.
Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Luiz Augusto Baciega Vasconcelos. Os transposons de DNA hAT em Setaria: caracterização, diversidade e impacto no genoma das espécies irmãs Setaria italica e Setaria viridis. (Graduando em Bacharelado em Ciencia e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2018.
Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Beatriz Tonhazolo Gimenez. Evolução e contribuição dos elementos de transposição aos genes de síntese de sacarose e amido em gramíneas, com ênfase em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) e milheto (Setaria italica). (Graduando em Bacharelado em Ciencia e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Marcos Vinícius Gonçalves da Silva. Caracterização estrutural e evolutiva dos genes fumarase e malato desidrogenase em cana-de-açúcar. (Graduando em Bacharelado em Ciencia e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . 2014.
Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Vitor Audibert. Caracterização de genes da rota de biossíntese da vitamina E em variedades de pimenta Capsicum chinense. (Graduando em Bacharelado em Ciencia e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, . 2012.
Orientador: Nathalia de Setta Costa.
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (4)

2018-Atual. Analise genomica e funcional de metacaspases envolvidas no processo de senescencia induzida por estresse hidrico em monocotiledoneas, com enfase em Setaria italica e Setaria viridis
Descrição: Análise genômica e funcional de metacaspases envolvidas no processo de senescência induzida por estresse hídrico em monocotiledôneas, com ênfase em Setaria italica e Setaria viridis. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Nathalia de Setta - Coordenador / thais Massanet - Integrante / Luciano Freschi - Integrante. Financiador(es): Universidade Federal do ABC - Bolsa.Número de orientações: 1
Membro: Nathalia de Setta Costa.
2018-Atual. Prospeccao de genes candidatos ao melhoramento voltado a tolerancia ao estresse abiotico em gramineas.
Descrição: Gramíneas monocotiledôneas são a principal fonte de nutrição humana e pesquisas sobre o melhoramento desse grupo são de importância crítica na segurança alimentar. Entre as principais gramíneas cultivadas no mundo, podemos destacar milho, trigo, cana-de-açúcar e arroz. Dado o cenário atual das mudanças climáticas, é esperado um aumento das temperaturas globais e taxas de CO2, modificação nos regimes de precipitação e na ocorrência de pragas. Essas mudanças terão sérios impactos nas quatro dimensões da segurança alimentar, sendo que seus efeitos já estão sendo sentidos nos mercados globais de alimentos. Neste contexto, a pesquisa em melhoramento genético vegetal tem trabalhado para gerar plantas mais tolerantes a estresses como seca e altas temperaturas; sendo que o primeiro passo para o processo de melhoramento é a seleção de genes candidatos a serem modificados. Este projeto de pesquisa tem como objetivo realizar estudos genômicos de larga escala em famílias gênicas vegetais, focando na seleção e caracterização de potenciais genes candidatos ao melhoramento para estresse abiótico em gramíneas. Para isso, serão empregadas as seguintes metodologias: (i) mineração gênica e dos perfis de expressão in silico em bases de dados genômicas, (ii) caracterização das estruturas e diversidade gênicas, (iii) busca in silico por localização subcelular proteica e (iv) estudo das relações de ortologia entre genes de espécies modelo e alvo. A seleção das famílias gênicas a serem estudadas será realizada posteriormente, de acordo com o background teórico em vigor e possíveis colaborações com empresas e instituições de pesquisas públicas, com o objetivo de maximizar a aplicação dos resultados no desenvolvimento de ferramentas para a pesquisa inovativa voltada à cadeia produtiva agrícola.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Nathalia de Setta - Coordenador / Hana Paula Masuda - Integrante / Danilo da Cruz Centeno - Integrante / WAGNER RODRIGO DE SOUZA - Integrante / Fernanda Dias da Silva - Integrante / Silvia Ribeiro de Souza - Integrante. Número de orientações: 2
Membro: Nathalia de Setta Costa.
2015-Atual. Understanding the plastic responses to the water deficit in Setaria italica and the influence of the transposable elements
Descrição: Evolução e Fisiologia se desenvolveram como disciplinas separadas, o que refletiu em uma hipótese de que ambas só poderiam ser estudadas de forma desassociada. Nesse projeto, propomos investigar um problema clássico da fisiologia vegetal com um olhar evolutivo para buscar respostas sobre os mecanismos que regem a herança da plasticidade fenotípica. Como os elementos de transposição têm sido repetidamente associados à geração de variabilidade genética e epigenética em plantas, o objetivo desse projeto será avaliar o papel dessas sequências na geração e herança da resposta plástica ao estresse hídrico em monocotiledôneas C4. Propõe-se utilizar Setaria italica como espécie modelo devido à facilidade de cultivo e a disponibilidade do genoma sequenciado. Será realizado um experimento em casa de vegetação em que plantas serão cultivadas por duas gerações em um gradiente de estresse hídrico. Plantas dos diferentes tratamentos serão comparadas quanto à sobrevivência e reprodução, por meio da avaliação de caracteres de fitness, e amostras de folhas e sementes serão analisadas por meio de perfis metabólicos e de expressão gênica (mRNA, sRNAs e qPCR). Além de avaliar se os elementos de transposição desempenham um papel na regulação epigenética da tolerância à seca, os dados obtidos permitirão determinar genes e rotas metabólicas que conferem plasticidade fenotípica em S. italica. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Nathalia de Setta - Coordenador / Luisa Bérmudez - Integrante / Fernando Carrari - Integrante / Magdalena Rossi - Integrante / Danilo da Cruz Centeno - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Bolsa. Número de produções C, T A: 4
Membro: Nathalia de Setta Costa.
2015-Atual. Caracterizacao genomica funcional e evolutiva das malato desidrogenases de gramineas
Descrição: A malato desidrogenase (MDH) é uma enzima importante para a manutenção do estado redox celular, por causa da sua capacidade de interconversão reversível de malato em oxaloacetato e oxidorredução de NAD ou NADP. Em A. thaliana existem 9 isoformas conhecidas que são direcionadas para mitocondriais, peroxissomos, plastídios, dentre ele cloroplastos e citosol. Entretanto, a estrutura e história evolutiva da família gênica malato desidrogenase permanecem pouco estudadas em monocotiledôneas, entre elas, arroz, milho e cana-deaçúcar. O objetivo geral deste projeto de pesquisa é caracterizar a estrutura e evolução da malato desidrogenase em gramíneas e guiar futuros estudos funcionais com foco no incremento no rendimento do metabolismo de carboidratos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Nathalia de Setta - Coordenador / Danilo da Cruz Centeno - Integrante / Marcos Vinícius Gonçalves da Silva - Integrante / Anderson Marque de Oliveira - Integrante.
Membro: Nathalia de Setta Costa.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (2)

Menção honrosa - Orientação de trabalho no XVI Simpósio de BECN, UFABC.. 2018.
Membro: Nathalia de Setta Costa.
Melhor Pôster de Pós-graduação no VI Simpósio Brasileiro de Biologia Molecular de Plantas (Orientadora), Sociedade Brasileira de Genética.. 2017.
Membro: Nathalia de Setta Costa.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (15)

1º Workshop de Genômica Comparada.Práticas em genômica comparada: análises de ortologia e sintenia. 2017. (Outra).
VI Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. 2017. (Simpósio).
3° Workshop em Evolução e Diversidade. 2016. (Outra).
Brazilian-International Congress of Genetics. Structure and evolution of Setaria italica LTR retrotransposons. 2016. (Congresso).
11th International Congress of Plant Molecular Biology. Transposable elements impact on Setaria italica genome and gene structure. 2015. (Congresso).
61° Congresso Brasileiro de Genética. Elementos de transposição, marcadores moleculares e aplicabilidade biotecnológica. 2015. (Congresso).
Arena de Inovação: Biotecnologia e Nanotecnologia. 2015. (Encontro).
Environmental and metabolic control of plant growth and development.Dissecting genetics and epigenetics mechanisms underlying drought tolerance in C4 plants: do transposable elements play a role on the scene?. 2015. (Outra).
58° Congresso Brasileiro de genética. Minicurso: Aplicações genéticas e biotecnológicas dos elementos de transposição. 2012. (Congresso).
57° Congresso Brasileiro de Genética. Diversity and evolution of Helitrons transposons in "Saccharum complex" species. 2011. (Congresso).
III Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas.Helitron transposon prediction in sugarcane using the HelitronFinder program. 2011. (Simpósio).
Plant and Animal Genome XIX Conference.Sugarcane Genome Sequencing Initiative. 2011. (Outra).
Workshop: O pós-doutorado e a pesquisa no Departamento de Botânica.Evolução dos elementos de transposição em eucariotos. 2011. (Outra).
Workshop on Syntetic Biology and Robotics. 2011. (Outra).
2nd ASM Conference on Mobile DNA.First record of Helitrons transposons in sugarcane (Saccharum spp.). 2010. (Outra).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (4)

SETTA, N.. UFABC PARA TODOS 2019. 2019. Outro
SETTA, N.. UFABC PARA TODOS 2018. 2018. Outro
SETTA, N. ; CENTENO, D. C. ; BARCELOS, L. A.. 1º Workshop de Genômica Comparada. 2017. Outro
Setta, Nathalia. VII Simpósio de Iniciação Científica da UFABC. 2014. Outro

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (1)

Nathalia de Setta Costa ⇔ Cibele Biondo (3.0)
SUGUIYAMA, VANESSA FUENTES ; VASCONCELOS, LUIZ AUGUSTO BACIEGA ; ROSSI, MARIA MAGDALENA ; BIONDO, CIBELE ; DE SETTA, NATHALIA. The population genetic structure approach adds new insights into the evolution of plant LTR retrotransposon lineages. PLoS One. v. 14, p. e0214542, issn: 1932-6203, 2019.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
SUGUIYAMA, V. F. ; BIONDO, C. ; SETTA, N.. Transposable elements as individuals in a population - a population structure approach for studying LTR retrotransposon lineages evolution. Em: VI Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2017, Ouro Preto - MG. Anais do VI Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2017.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
SUGUIYAMA, V. F. ; BIONDO, C. ; SETTA, N.. Structure and evolution of Setaria italica LTR retrotransposons. Em: Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambú. Brazilian-International Congress of Genetics, 2016.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]

(*) Relatório criado com produções desde 2010 até 2022
Data de processamento: 21/09/2022 19:52:35

Relatório gerado por scriptLattes V8.11. Os resultados estão sujeitos a falhas devido a inconsistências no preenchimento dos CVs Lattes. E-mail de contato: admin@email.com